RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583689.5

NAT9-223, Transcript of N-acetyltransferase 9 (putative), human

TSL 2

Gene NAT9, Length 563 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NAT9-223	ENST00000583689	JPH4	Q96JJ6	628 aa		29.86	■■■□□ 2.37
NAT9-223	ENST00000583689	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	29.86	■■■□□ 2.37
NAT9-223	ENST00000583689	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		29.76	■■■□□ 2.35
NAT9-223	ENST00000583689	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		29.72	■■■□□ 2.35
NAT9-223	ENST00000583689	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	29.57	■■■□□ 2.32
NAT9-223	ENST00000583689	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		29.54	■■■□□ 2.32
NAT9-223	ENST00000583689	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		29.53	■■■□□ 2.32
NAT9-223	ENST00000583689	IQGAP2	Q13576	1575 aa		29.51	■■■□□ 2.31
NAT9-223	ENST00000583689	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		29.49	■■■□□ 2.31
NAT9-223	ENST00000583689	MAPKBP1	O60336	1514 aa		29.45	■■■□□ 2.3
NAT9-223	ENST00000583689	PTPRG	P23470	1445 aa		29.42	■■■□□ 2.3
NAT9-223	ENST00000583689	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		29.42	■■■□□ 2.3
NAT9-223	ENST00000583689	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		29.41	■■■□□ 2.3
NAT9-223	ENST00000583689	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		29.41	■■■□□ 2.3
NAT9-223	ENST00000583689	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	29.39	■■■□□ 2.3
NAT9-223	ENST00000583689	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		29.37	■■■□□ 2.29
NAT9-223	ENST00000583689	PRX	Q9BXM0	1461 aa		29.36	■■■□□ 2.29
NAT9-223	ENST00000583689	DISP1	Q96F81	1524 aa		29.36	■■■□□ 2.29
NAT9-223	ENST00000583689	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		29.35	■■■□□ 2.29
NAT9-223	ENST00000583689	DIP2B	Q9P265	1576 aa		29.34	■■■□□ 2.29
NAT9-223	ENST00000583689	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	29.31	■■■□□ 2.28
NAT9-223	ENST00000583689	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		29.31	■■■□□ 2.28
NAT9-223	ENST00000583689	KIAA0556	O60303	1618 aa		29.25	■■■□□ 2.27
NAT9-223	ENST00000583689	ABCC2	Q92887	1545 aa		29.23	■■■□□ 2.27
NAT9-223	ENST00000583689	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		29.2	■■■□□ 2.26
NAT9-223	ENST00000583689	UACA	Q9BZF9	1416 aa		29.19	■■■□□ 2.26
NAT9-223	ENST00000583689	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		29.18	■■■□□ 2.26
NAT9-223	ENST00000583689	TSPOAP1	O95153	1857 aa		29.17	■■■□□ 2.26
NAT9-223	ENST00000583689	EEA1	Q15075	1411 aa		29.13	■■■□□ 2.25
NAT9-223	ENST00000583689	ASXL2	Q76L83	1435 aa		29.13	■■■□□ 2.25
NAT9-223	ENST00000583689	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		29.12	■■■□□ 2.25
NAT9-223	ENST00000583689	GOLGA3	Q08378	1498 aa		29.1	■■■□□ 2.25
NAT9-223	ENST00000583689	KDM6B	O15054	1643 aa		29.09	■■■□□ 2.25
NAT9-223	ENST00000583689	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		29.04	■■■□□ 2.24
NAT9-223	ENST00000583689	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	29.03	■■■□□ 2.24
NAT9-223	ENST00000583689	GLI2	P10070	1586 aa		29.03	■■■□□ 2.24
NAT9-223	ENST00000583689	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		29.02	■■■□□ 2.24
NAT9-223	ENST00000583689	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	29	■■■□□ 2.23
NAT9-223	ENST00000583689	ABCA8	O94911	1581 aa		28.96	■■■□□ 2.23
NAT9-223	ENST00000583689	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	28.94	■■■□□ 2.22
NAT9-223	ENST00000583689	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	28.93	■■■□□ 2.22
NAT9-223	ENST00000583689	SAMD9	Q5K651	1589 aa		28.92	■■■□□ 2.22
NAT9-223	ENST00000583689	KIF21B	O75037	1637 aa		28.91	■■■□□ 2.22
NAT9-223	ENST00000583689	P3H3	Q8IVL6	736 aa		28.91	■■■□□ 2.22
NAT9-223	ENST00000583689	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		28.87	■■■□□ 2.21
NAT9-223	ENST00000583689	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		28.85	■■■□□ 2.21
NAT9-223	ENST00000583689	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		28.82	■■■□□ 2.2
NAT9-223	ENST00000583689	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	28.78	■■■□□ 2.2
NAT9-223	ENST00000583689	KCNH8	Q96L42	1107 aa		28.75	■■■□□ 2.19
NAT9-223	ENST00000583689	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		28.73	■■■□□ 2.19
NAT9-223	ENST00000583689	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	28.72	■■■□□ 2.19
NAT9-223	ENST00000583689	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		28.72	■■■□□ 2.19
NAT9-223	ENST00000583689	ATP10B	O94823	1461 aa		28.72	■■■□□ 2.19
NAT9-223	ENST00000583689	ARID3C	A6NKF2	412 aa		28.71	■■■□□ 2.19
NAT9-223	ENST00000583689	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		28.71	■■■□□ 2.19
NAT9-223	ENST00000583689	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		28.7	■■■□□ 2.18
NAT9-223	ENST00000583689	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		28.69	■■■□□ 2.18
NAT9-223	ENST00000583689	CD109	Q6YHK3	1445 aa		28.69	■■■□□ 2.18
NAT9-223	ENST00000583689	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		28.68	■■■□□ 2.18
NAT9-223	ENST00000583689	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		28.64	■■■□□ 2.18
NAT9-223	ENST00000583689	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	28.63	■■■□□ 2.17
NAT9-223	ENST00000583689	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	28.62	■■■□□ 2.17
NAT9-223	ENST00000583689	ADGRL1	O94910	1474 aa		28.54	■■■□□ 2.16
NAT9-223	ENST00000583689	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	28.53	■■■□□ 2.16
NAT9-223	ENST00000583689	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	28.53	■■■□□ 2.16
NAT9-223	ENST00000583689	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		28.51	■■■□□ 2.15
NAT9-223	ENST00000583689	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		28.49	■■■□□ 2.15
NAT9-223	ENST00000583689	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		28.42	■■■□□ 2.14
NAT9-223	ENST00000583689	FMN1	Q68DA7	1419 aa		28.4	■■■□□ 2.14
NAT9-223	ENST00000583689	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	28.38	■■■□□ 2.13
NAT9-223	ENST00000583689	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		28.38	■■■□□ 2.13
NAT9-223	ENST00000583689	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		28.37	■■■□□ 2.13
NAT9-223	ENST00000583689	HECW1	Q76N89	1606 aa		28.33	■■■□□ 2.13
NAT9-223	ENST00000583689	NEO1	Q92859	1461 aa		28.33	■■■□□ 2.13
NAT9-223	ENST00000583689	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	28.29	■■■□□ 2.12
NAT9-223	ENST00000583689	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	28.29	■■■□□ 2.12
NAT9-223	ENST00000583689	RAPGEF3	O95398	923 aa		28.27	■■■□□ 2.12
NAT9-223	ENST00000583689	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		28.25	■■■□□ 2.11
NAT9-223	ENST00000583689	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		28.23	■■■□□ 2.11
NAT9-223	ENST00000583689	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	28.19	■■■□□ 2.1
NAT9-223	ENST00000583689	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		28.17	■■■□□ 2.1
NAT9-223	ENST00000583689	CLIP1	P30622	1438 aa		28.17	■■■□□ 2.1
NAT9-223	ENST00000583689	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		28.16	■■■□□ 2.1
NAT9-223	ENST00000583689	FANCA	O15360	1455 aa		28.16	■■■□□ 2.1
NAT9-223	ENST00000583689	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		28.16	■■■□□ 2.1
NAT9-223	ENST00000583689	AKNA	Q7Z591	1439 aa		28.15	■■■□□ 2.1
NAT9-223	ENST00000583689	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	28.14	■■■□□ 2.09
NAT9-223	ENST00000583689	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	28.13	■■■□□ 2.09
NAT9-223	ENST00000583689	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		28.12	■■■□□ 2.09
NAT9-223	ENST00000583689	KIF14	Q15058	1648 aa		28.12	■■■□□ 2.09
NAT9-223	ENST00000583689	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	28.11	■■■□□ 2.09
NAT9-223	ENST00000583689	PLCH2	O75038	1416 aa		28.09	■■■□□ 2.09
NAT9-223	ENST00000583689	RICTOR	Q6R327	1708 aa		28.09	■■■□□ 2.09
NAT9-223	ENST00000583689	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	28.07	■■■□□ 2.08
NAT9-223	ENST00000583689	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		28.07	■■■□□ 2.08
NAT9-223	ENST00000583689	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		28.06	■■■□□ 2.08
NAT9-223	ENST00000583689	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		28.05	■■■□□ 2.08
NAT9-223	ENST00000583689	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		28.05	■■■□□ 2.08
NAT9-223	ENST00000583689	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		28.04	■■■□□ 2.08
NAT9-223	ENST00000583689	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		28.01	■■■□□ 2.07

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms