RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578025.5

TSPOAP1-AS1-201, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 2,229 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.45■■■■□ 3.43
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PBRM1Q86U86 1689 aa36.45■■■■□ 3.43
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 P3H3Q8IVL6 736 aa36.44■■■■□ 3.42
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IFT140Q96RY7 1462 aa36.39■■■■□ 3.42
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 EFCAB5A4FU69 1503 aa36.36■■■■□ 3.41
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FHOD3Q2V2M9 1422 aa36.35■■■■□ 3.41
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.33■■■■□ 3.41
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.32■■■■□ 3.4
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP36.32■■■■□ 3.4
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.29■■■■□ 3.4
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GRIN2BQ13224 1484 aa36.29■■■■□ 3.4
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ADAMTS12P58397 1594 aa36.27■■■■□ 3.4
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP36.26■■■■□ 3.4
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TIAM1Q13009 1591 aa36.25■■■■□ 3.39
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP36.23■■■■□ 3.39
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MAP3K1Q13233 1512 aa36.2■■■■□ 3.38
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP36.18■■■■□ 3.38
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SAMD9Q5K651 1589 aa36.16■■■■□ 3.38
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.14■■■■□ 3.38
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FYCO1Q9BQS8 1478 aa36.11■■■■□ 3.37
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CFAP43Q8NDM7 1665 aa36.09■■■■□ 3.37
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FMN1Q68DA7 1419 aa36.09■■■■□ 3.37
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa36.09■■■■□ 3.37
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa36.09■■■■□ 3.37
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP36.07■■■■□ 3.36
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.07■■■■□ 3.36
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IQGAP2Q13576 1575 aa36.03■■■■□ 3.36
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CCNB3Q8WWL7 1395 aa35.97■■■■□ 3.35
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP35.96■■■■□ 3.35
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GRIN2AQ12879 1464 aa35.89■■■■□ 3.34
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.87■■■■□ 3.33
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PHLDB1Q86UU1 1377 aa35.87■■■■□ 3.33
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP35.84■■■■□ 3.33
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa35.82■■■■□ 3.32
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa35.81■■■■□ 3.32
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 UGGT2Q9NYU1 1516 aa35.79■■■■□ 3.32
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ITGAEP38570 1179 aa35.79■■■■□ 3.32
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.78■■■■□ 3.32
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SYNJ2O15056 1496 aa35.77■■■■□ 3.32
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NEUROD1Q13562 356 aa35.75■■■■□ 3.31
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FBLN2P98095 1184 aa35.74■■■■□ 3.31
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MTUS2Q5JR59 1369 aa35.72■■■■□ 3.31
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP35.68■■■■□ 3.3
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP35.68■■■■□ 3.3
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CEP170Q5SW79 1584 aa35.67■■■■□ 3.3
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP35.67■■■■□ 3.3
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KIAA0556O60303 1618 aa35.65■■■■□ 3.3
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HECW1Q76N89 1606 aa35.65■■■■□ 3.3
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DISP1Q96F81 1524 aa35.65■■■■□ 3.3
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CCDC18Q5T9S5 1454 aa35.61■■■■□ 3.29
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa35.56■■■■□ 3.28
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP35.54■■■■□ 3.28
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP35.54■■■■□ 3.28
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP35.53■■■■□ 3.28
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NUP160Q12769 1436 aa35.53■■■■□ 3.28
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NCOA2Q15596 1464 aa35.53■■■■□ 3.28
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa35.52■■■■□ 3.28
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP35.52■■■■□ 3.28
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FGD6Q6ZV73 1430 aa35.51■■■■□ 3.28
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ARID3CA6NKF2 412 aa35.51■■■■□ 3.27
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP35.5■■■■□ 3.27
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa35.44■■■■□ 3.26
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP35.44■■■■□ 3.26
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MYOM3Q5VTT5 1437 aa35.42■■■■□ 3.26
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 JPH4Q96JJ6 628 aa35.41■■■■□ 3.26
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa35.39■■■■□ 3.26
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SETD5Q9C0A6 1442 aa35.39■■■■□ 3.26
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CLSPNQ9HAW4 1339 aa35.38■■■■□ 3.25
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa35.37■■■■□ 3.25
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ARHGEF11O15085 1522 aa35.37■■■■□ 3.25
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP35.35■■■■□ 3.25
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa35.35■■■■□ 3.25
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PLB1Q6P1J6 1458 aa35.27■■■■□ 3.24
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PTPN23Q9H3S7 1636 aa35.26■■■■□ 3.23
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CHD1O14646 1710 aa35.26■■■■□ 3.23
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PTPRKQ15262 1439 aa35.2■■■■□ 3.23
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MIER1Q8N108 512 aa35.18■■■■□ 3.22
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP35.15■■■■□ 3.22
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP35.13■■■■□ 3.21
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP35.12■■■■□ 3.21
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MAPKBP1O60336 1514 aa35.11■■■■□ 3.21
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MIA2Q96PC5 1412 aa35.09■■■■□ 3.21
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HFM1A2PYH4 1435 aa35.06■■■■□ 3.2
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ABCA8O94911 1581 aa35.05■■■■□ 3.2
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP35.04■■■■□ 3.2
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP35.01■■■■□ 3.2
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NAIPQ13075 1403 aa34.98■■■■□ 3.19
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CHIC2Q9UKJ5 165 aa34.97■■■■□ 3.19
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PTPRGP23470 1445 aa34.96■■■■□ 3.19
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SHROOM2Q13796 1616 aa34.93■■■■□ 3.18
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KIF14Q15058 1648 aa34.93■■■■□ 3.18
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa34.91■■■■□ 3.18
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ATP10BO94823 1461 aa34.91■■■■□ 3.18
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ADCY10Q96PN6 1610 aa34.9■■■■□ 3.18
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP34.88■■■■□ 3.17
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PLEKHD1A6NEE1 506 aa34.85■■■■□ 3.17
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SIN3AQ96ST3 1273 aa34.84■■■■□ 3.17
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 UACAQ9BZF9 1416 aa34.83■■■■□ 3.17
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GCC2Q8IWJ2 1684 aa34.83■■■■□ 3.17
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ITSN2Q9NZM3 1697 aa34.83■■■■□ 3.17
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