RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578025.5

TSPOAP1-AS1-201, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 2,229 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.56■■■■■ 6
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.71■■■■■ 4.59
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.58■■■■■ 4.57
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.28■■■■■ 4.52
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ABCC9O60706 1549 aa42.7■■■■■ 4.43
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.48■■■■■ 4.39
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.34■■■■■ 4.37
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SCRIBQ14160 1630 aa42.13■■■■■ 4.34
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.71■■■■■ 4.27
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.99■■■■■ 4.15
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.94■■■■■ 4.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.73■■■■■ 4.11
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.71■■■■■ 4.11
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.51■■■■■ 4.08
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.51■■■■■ 4.08
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 WIZO95785 1651 aa40.47■■■■■ 4.07
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SMARCA4P51532 1647 aa40.29■■■■■ 4.04
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.64■■■■□ 3.94
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TRIM41Q8WV44 630 aa39.63■■■■□ 3.93
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SMARCA2P51531 1590 aa39.63■■■■□ 3.93
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.62■■■■□ 3.93
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.48■■■■□ 3.91
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.33■■■■□ 3.89
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP39.12■■■■□ 3.85
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ABCC8Q09428 1581 aa39.11■■■■□ 3.85
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PCGF6Q9BYE7 350 aa38.96■■■■□ 3.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NCAPD3P42695 1498 aa38.95■■■■□ 3.83
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 EHMT2Q96KQ7 1210 aa38.71■■■■□ 3.79
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.66■■■■□ 3.78
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.55■■■■□ 3.76
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SYNJ1O43426 1573 aa38.51■■■■□ 3.76
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SOGA1O94964 1423 aa38.49■■■■□ 3.75
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.33■■■■□ 3.73
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CFTRP13569 1480 aa38.3■■■■□ 3.72
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 EEA1Q15075 1411 aa38.3■■■■□ 3.72
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP38.29■■■■□ 3.72
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP38.26■■■■□ 3.72
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TOP2BQ02880 1626 aa38.2■■■■□ 3.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CSRNP3Q8WYN3 585 aa38.2■■■■□ 3.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.12■■■■□ 3.69
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PRDM2Q13029 1718 aa38.08■■■■□ 3.69
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.07■■■■□ 3.69
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CUX1P39880 1505 aa38.03■■■■□ 3.68
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GOLGA3Q08378 1498 aa37.92■■■■□ 3.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TNIKQ9UKE5 1360 aa37.9■■■■□ 3.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 UBTFP17480 764 aaKnown RBP37.89■■■■□ 3.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CEP162Q5TB80 1403 aa37.84■■■■□ 3.65
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.84■■■■□ 3.65
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KIF21BO75037 1637 aa37.82■■■■□ 3.65
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.7■■■■□ 3.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NESP48681 1621 aa37.7■■■■□ 3.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa37.65■■■■□ 3.62
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KIF27Q86VH2 1401 aa37.59■■■■□ 3.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.52■■■■□ 3.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.52■■■■□ 3.6
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CUX2O14529 1486 aa37.43■■■■□ 3.58
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.43■■■■□ 3.58
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.41■■■■□ 3.58
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CLIP1P30622 1438 aa37.39■■■■□ 3.58
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TOPBP1Q92547 1522 aa37.35■■■■□ 3.57
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.21■■■■□ 3.55
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.21■■■■□ 3.55
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP37.19■■■■□ 3.54
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.12■■■■□ 3.53
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 VPS8Q8N3P4 1428 aa37.11■■■■□ 3.53
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.06■■■■□ 3.52
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ARAP1Q96P48 1450 aa36.94■■■■□ 3.5
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 WDR97A6NE52 1622 aa36.92■■■■□ 3.5
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.81■■■■□ 3.48
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa36.8■■■■□ 3.48
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CUL7Q14999 1698 aa36.78■■■■□ 3.48
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.77■■■■□ 3.48
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.76■■■■□ 3.48
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.71■■■■□ 3.47
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.7■■■■□ 3.47
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP36.63■■■■□ 3.45
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP36.53■■■■□ 3.44
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa36.52■■■■□ 3.44
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 WDR62O43379 1518 aa36.51■■■■□ 3.44
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ERCC6Q03468 1493 aa36.5■■■■□ 3.43
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP36.46■■■■□ 3.43
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