RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577256.5

ATG13-223, Transcript of autophagy related 13, human

TSL 4

Gene ATG13, Length 613 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG13-223	ENST00000577256	JPH4	Q96JJ6	628 aa		29.78	■■■□□ 2.36
ATG13-223	ENST00000577256	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		29.77	■■■□□ 2.36
ATG13-223	ENST00000577256	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		29.74	■■■□□ 2.35
ATG13-223	ENST00000577256	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	29.74	■■■□□ 2.35
ATG13-223	ENST00000577256	IQGAP2	Q13576	1575 aa		29.61	■■■□□ 2.33
ATG13-223	ENST00000577256	PRX	Q9BXM0	1461 aa		29.61	■■■□□ 2.33
ATG13-223	ENST00000577256	EEA1	Q15075	1411 aa		29.6	■■■□□ 2.33
ATG13-223	ENST00000577256	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		29.58	■■■□□ 2.33
ATG13-223	ENST00000577256	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		29.54	■■■□□ 2.32
ATG13-223	ENST00000577256	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		29.49	■■■□□ 2.31
ATG13-223	ENST00000577256	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		29.48	■■■□□ 2.31
ATG13-223	ENST00000577256	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		29.45	■■■□□ 2.3
ATG13-223	ENST00000577256	DISP1	Q96F81	1524 aa		29.39	■■■□□ 2.3
ATG13-223	ENST00000577256	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		29.39	■■■□□ 2.29
ATG13-223	ENST00000577256	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	29.38	■■■□□ 2.29
ATG13-223	ENST00000577256	PTPRG	P23470	1445 aa		29.37	■■■□□ 2.29
ATG13-223	ENST00000577256	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	29.37	■■■□□ 2.29
ATG13-223	ENST00000577256	KIAA0556	O60303	1618 aa		29.32	■■■□□ 2.28
ATG13-223	ENST00000577256	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		29.31	■■■□□ 2.28
ATG13-223	ENST00000577256	GOLGA3	Q08378	1498 aa		29.29	■■■□□ 2.28
ATG13-223	ENST00000577256	KIF21B	O75037	1637 aa		29.28	■■■□□ 2.28
ATG13-223	ENST00000577256	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	29.26	■■■□□ 2.27
ATG13-223	ENST00000577256	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	29.26	■■■□□ 2.27
ATG13-223	ENST00000577256	UACA	Q9BZF9	1416 aa		29.18	■■■□□ 2.26
ATG13-223	ENST00000577256	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		29.17	■■■□□ 2.26
ATG13-223	ENST00000577256	MAPKBP1	O60336	1514 aa		29.17	■■■□□ 2.26
ATG13-223	ENST00000577256	ABCC2	Q92887	1545 aa		29.14	■■■□□ 2.25
ATG13-223	ENST00000577256	SAMD9	Q5K651	1589 aa		29.09	■■■□□ 2.25
ATG13-223	ENST00000577256	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		29.05	■■■□□ 2.24
ATG13-223	ENST00000577256	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		29.04	■■■□□ 2.24
ATG13-223	ENST00000577256	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		29.03	■■■□□ 2.24
ATG13-223	ENST00000577256	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		29.02	■■■□□ 2.24
ATG13-223	ENST00000577256	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	29.01	■■■□□ 2.23
ATG13-223	ENST00000577256	P3H3	Q8IVL6	736 aa		29.01	■■■□□ 2.23
ATG13-223	ENST00000577256	ABCA8	O94911	1581 aa		29.01	■■■□□ 2.23
ATG13-223	ENST00000577256	DIP2B	Q9P265	1576 aa		28.98	■■■□□ 2.23
ATG13-223	ENST00000577256	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		28.97	■■■□□ 2.23
ATG13-223	ENST00000577256	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		28.96	■■■□□ 2.23
ATG13-223	ENST00000577256	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	28.96	■■■□□ 2.23
ATG13-223	ENST00000577256	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		28.96	■■■□□ 2.23
ATG13-223	ENST00000577256	ASXL2	Q76L83	1435 aa		28.95	■■■□□ 2.23
ATG13-223	ENST00000577256	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	28.95	■■■□□ 2.23
ATG13-223	ENST00000577256	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		28.88	■■■□□ 2.21
ATG13-223	ENST00000577256	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		28.83	■■■□□ 2.21
ATG13-223	ENST00000577256	GLI2	P10070	1586 aa		28.82	■■■□□ 2.2
ATG13-223	ENST00000577256	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		28.8	■■■□□ 2.2
ATG13-223	ENST00000577256	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	28.79	■■■□□ 2.2
ATG13-223	ENST00000577256	ATP10B	O94823	1461 aa		28.76	■■■□□ 2.19
ATG13-223	ENST00000577256	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		28.75	■■■□□ 2.19
ATG13-223	ENST00000577256	TSPOAP1	O95153	1857 aa		28.74	■■■□□ 2.19
ATG13-223	ENST00000577256	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	28.72	■■■□□ 2.19
ATG13-223	ENST00000577256	ARID3C	A6NKF2	412 aa		28.71	■■■□□ 2.19
ATG13-223	ENST00000577256	FMN1	Q68DA7	1419 aa		28.69	■■■□□ 2.18
ATG13-223	ENST00000577256	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		28.67	■■■□□ 2.18
ATG13-223	ENST00000577256	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	28.63	■■■□□ 2.17
ATG13-223	ENST00000577256	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	28.63	■■■□□ 2.17
ATG13-223	ENST00000577256	KCNH8	Q96L42	1107 aa		28.63	■■■□□ 2.17
ATG13-223	ENST00000577256	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	28.62	■■■□□ 2.17
ATG13-223	ENST00000577256	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		28.59	■■■□□ 2.17
ATG13-223	ENST00000577256	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		28.58	■■■□□ 2.17
ATG13-223	ENST00000577256	KDM6B	O15054	1643 aa		28.56	■■■□□ 2.16
ATG13-223	ENST00000577256	HECW1	Q76N89	1606 aa		28.56	■■■□□ 2.16
ATG13-223	ENST00000577256	CLIP1	P30622	1438 aa		28.55	■■■□□ 2.16
ATG13-223	ENST00000577256	CD109	Q6YHK3	1445 aa		28.54	■■■□□ 2.16
ATG13-223	ENST00000577256	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		28.51	■■■□□ 2.15
ATG13-223	ENST00000577256	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		28.5	■■■□□ 2.15
ATG13-223	ENST00000577256	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	28.49	■■■□□ 2.15
ATG13-223	ENST00000577256	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	28.49	■■■□□ 2.15
ATG13-223	ENST00000577256	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		28.48	■■■□□ 2.15
ATG13-223	ENST00000577256	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		28.43	■■■□□ 2.14
ATG13-223	ENST00000577256	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	28.41	■■■□□ 2.14
ATG13-223	ENST00000577256	CEP162	Q5TB80	1403 aa		28.39	■■■□□ 2.14
ATG13-223	ENST00000577256	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	28.39	■■■□□ 2.14
ATG13-223	ENST00000577256	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		28.37	■■■□□ 2.13
ATG13-223	ENST00000577256	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		28.36	■■■□□ 2.13
ATG13-223	ENST00000577256	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		28.36	■■■□□ 2.13
ATG13-223	ENST00000577256	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	28.35	■■■□□ 2.13
ATG13-223	ENST00000577256	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		28.34	■■■□□ 2.13
ATG13-223	ENST00000577256	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	28.33	■■■□□ 2.13
ATG13-223	ENST00000577256	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		28.31	■■■□□ 2.12
ATG13-223	ENST00000577256	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	28.29	■■■□□ 2.12
ATG13-223	ENST00000577256	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		28.28	■■■□□ 2.12
ATG13-223	ENST00000577256	NEO1	Q92859	1461 aa		28.28	■■■□□ 2.12
ATG13-223	ENST00000577256	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		28.26	■■■□□ 2.11
ATG13-223	ENST00000577256	KIF14	Q15058	1648 aa		28.25	■■■□□ 2.11
ATG13-223	ENST00000577256	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		28.21	■■■□□ 2.11
ATG13-223	ENST00000577256	FANCA	O15360	1455 aa		28.18	■■■□□ 2.1
ATG13-223	ENST00000577256	PLCH2	O75038	1416 aa		28.17	■■■□□ 2.1
ATG13-223	ENST00000577256	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		28.16	■■■□□ 2.1
ATG13-223	ENST00000577256	AKNA	Q7Z591	1439 aa		28.14	■■■□□ 2.1
ATG13-223	ENST00000577256	RAPGEF3	O95398	923 aa		28.07	■■■□□ 2.08
ATG13-223	ENST00000577256	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		28.07	■■■□□ 2.08
ATG13-223	ENST00000577256	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		28.07	■■■□□ 2.08
ATG13-223	ENST00000577256	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	28.07	■■■□□ 2.08
ATG13-223	ENST00000577256	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		28.04	■■■□□ 2.08
ATG13-223	ENST00000577256	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		28.03	■■■□□ 2.08
ATG13-223	ENST00000577256	ADGRL1	O94910	1474 aa		28.03	■■■□□ 2.08
ATG13-223	ENST00000577256	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		28.03	■■■□□ 2.08
ATG13-223	ENST00000577256	RICTOR	Q6R327	1708 aa		28.02	■■■□□ 2.08
ATG13-223	ENST00000577256	PREX2	Q70Z35	1606 aa		28.01	■■■□□ 2.07

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