RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576955.5

PHF23-212, Transcript of PHD finger protein 23, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PHF23, Length 1,944 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF23-212ENST00000576955 ARAP1Q96P48 1450 aa37.84■■■■□ 3.65
PHF23-212ENST00000576955 SYNJ2O15056 1496 aa37.79■■■■□ 3.64
PHF23-212ENST00000576955 GRIN2AQ12879 1464 aa37.76■■■■□ 3.64
PHF23-212ENST00000576955 EFCAB5A4FU69 1503 aa37.74■■■■□ 3.63
PHF23-212ENST00000576955 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.7■■■■□ 3.63
PHF23-212ENST00000576955 IQGAP2Q13576 1575 aa37.66■■■■□ 3.62
PHF23-212ENST00000576955 SAMD9Q5K651 1589 aa37.59■■■■□ 3.61
PHF23-212ENST00000576955 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa37.58■■■■□ 3.61
PHF23-212ENST00000576955 FBLN2P98095 1184 aa37.58■■■■□ 3.61
PHF23-212ENST00000576955 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP37.57■■■■□ 3.61
PHF23-212ENST00000576955 APLP2Q06481 763 aa37.54■■■■□ 3.6
PHF23-212ENST00000576955 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP37.54■■■■□ 3.6
PHF23-212ENST00000576955 P3H3Q8IVL6 736 aa37.51■■■■□ 3.6
PHF23-212ENST00000576955 CEP170Q5SW79 1584 aa37.51■■■■□ 3.6
PHF23-212ENST00000576955 FHOD3Q2V2M9 1422 aa37.51■■■■□ 3.59
PHF23-212ENST00000576955 NUP160Q12769 1436 aa37.49■■■■□ 3.59
PHF23-212ENST00000576955 PCGF6Q9BYE7 350 aa37.48■■■■□ 3.59
PHF23-212ENST00000576955 UGGT2Q9NYU1 1516 aa37.46■■■■□ 3.59
PHF23-212ENST00000576955 FMN1Q68DA7 1419 aa37.4■■■■□ 3.58
PHF23-212ENST00000576955 CHD1O14646 1710 aa37.4■■■■□ 3.58
PHF23-212ENST00000576955 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP37.32■■■■□ 3.57
PHF23-212ENST00000576955 FYCO1Q9BQS8 1478 aa37.29■■■■□ 3.56
PHF23-212ENST00000576955 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa37.29■■■■□ 3.56
PHF23-212ENST00000576955 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP37.28■■■■□ 3.56
PHF23-212ENST00000576955 KIAA0556O60303 1618 aa37.27■■■■□ 3.56
PHF23-212ENST00000576955 MAP3K1Q13233 1512 aa37.26■■■■□ 3.56
PHF23-212ENST00000576955 DISP1Q96F81 1524 aa37.25■■■■□ 3.55
PHF23-212ENST00000576955 JPH4Q96JJ6 628 aa37.2■■■■□ 3.55
PHF23-212ENST00000576955 TIAM1Q13009 1591 aa37.19■■■■□ 3.54
PHF23-212ENST00000576955 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa37.15■■■■□ 3.54
PHF23-212ENST00000576955 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP37.14■■■■□ 3.54
PHF23-212ENST00000576955 CFAP43Q8NDM7 1665 aa37.14■■■■□ 3.54
PHF23-212ENST00000576955 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP37.11■■■■□ 3.53
PHF23-212ENST00000576955 HECW1Q76N89 1606 aa37.02■■■■□ 3.52
PHF23-212ENST00000576955 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa37.01■■■■□ 3.52
PHF23-212ENST00000576955 SHROOM2Q13796 1616 aa37■■■■□ 3.51
PHF23-212ENST00000576955 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa36.97■■■■□ 3.51
PHF23-212ENST00000576955 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP36.97■■■■□ 3.51
PHF23-212ENST00000576955 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.96■■■■□ 3.51
PHF23-212ENST00000576955 CCDC18Q5T9S5 1454 aa36.95■■■■□ 3.51
PHF23-212ENST00000576955 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa36.9■■■■□ 3.5
PHF23-212ENST00000576955 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP36.85■■■■□ 3.49
PHF23-212ENST00000576955 MTUS2Q5JR59 1369 aa36.79■■■■□ 3.48
PHF23-212ENST00000576955 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP36.77■■■■□ 3.48
PHF23-212ENST00000576955 PLB1Q6P1J6 1458 aa36.77■■■■□ 3.48
PHF23-212ENST00000576955 PTPRGP23470 1445 aa36.75■■■■□ 3.47
PHF23-212ENST00000576955 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa36.74■■■■□ 3.47
PHF23-212ENST00000576955 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP36.73■■■■□ 3.47
PHF23-212ENST00000576955 ABCA8O94911 1581 aa36.72■■■■□ 3.47
PHF23-212ENST00000576955 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP36.71■■■■□ 3.47
PHF23-212ENST00000576955 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.68■■■■□ 3.46
PHF23-212ENST00000576955 OSCARQ8IYS5 282 aa36.67■■■■□ 3.46
PHF23-212ENST00000576955 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP36.65■■■■□ 3.46
PHF23-212ENST00000576955 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa36.64■■■■□ 3.46
PHF23-212ENST00000576955 PHLDB1Q86UU1 1377 aa36.64■■■■□ 3.46
PHF23-212ENST00000576955 ARID3CA6NKF2 412 aa36.63■■■■□ 3.45
PHF23-212ENST00000576955 CCNB3Q8WWL7 1395 aa36.62■■■■□ 3.45
PHF23-212ENST00000576955 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP36.59■■■■□ 3.45
PHF23-212ENST00000576955 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP36.57■■■■□ 3.44
PHF23-212ENST00000576955 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP36.57■■■■□ 3.44
PHF23-212ENST00000576955 NCOA2Q15596 1464 aa36.56■■■■□ 3.44
PHF23-212ENST00000576955 UACAQ9BZF9 1416 aa36.54■■■■□ 3.44
PHF23-212ENST00000576955 ARHGEF11O15085 1522 aa36.51■■■■□ 3.44
PHF23-212ENST00000576955 ATP10BO94823 1461 aa36.47■■■■□ 3.43
PHF23-212ENST00000576955 ABCC2Q92887 1545 aa36.44■■■■□ 3.42
PHF23-212ENST00000576955 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP36.43■■■■□ 3.42
PHF23-212ENST00000576955 MYOM3Q5VTT5 1437 aa36.43■■■■□ 3.42
PHF23-212ENST00000576955 FGD6Q6ZV73 1430 aa36.42■■■■□ 3.42
PHF23-212ENST00000576955 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP36.38■■■■□ 3.412e-6■■■□□ 17.5
PHF23-212ENST00000576955 PLEKHD1A6NEE1 506 aa36.36■■■■□ 3.41
PHF23-212ENST00000576955 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa36.36■■■■□ 3.41
PHF23-212ENST00000576955 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP36.34■■■■□ 3.41
PHF23-212ENST00000576955 ADCY10Q96PN6 1610 aa36.34■■■■□ 3.41
PHF23-212ENST00000576955 HRCP23327 699 aa36.32■■■■□ 3.4
PHF23-212ENST00000576955 MIA2Q96PC5 1412 aa36.26■■■■□ 3.39
PHF23-212ENST00000576955 PTPN23Q9H3S7 1636 aa36.25■■■■□ 3.39
PHF23-212ENST00000576955 KIF14Q15058 1648 aa36.24■■■■□ 3.39
PHF23-212ENST00000576955 ITGAEP38570 1179 aa36.23■■■■□ 3.39
PHF23-212ENST00000576955 KDM5BQ9UGL1 1544 aa36.2■■■■□ 3.39
PHF23-212ENST00000576955 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP36.19■■■■□ 3.38
PHF23-212ENST00000576955 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP36.19■■■■□ 3.38
PHF23-212ENST00000576955 ITSN2Q9NZM3 1697 aa36.17■■■■□ 3.38
PHF23-212ENST00000576955 ABCC10Q5T3U5 1492 aa36.1■■■■□ 3.37
PHF23-212ENST00000576955 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP36.09■■■■□ 3.37
PHF23-212ENST00000576955 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP36.09■■■■□ 3.37
PHF23-212ENST00000576955 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP36.04■■■■□ 3.36
PHF23-212ENST00000576955 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa36.03■■■■□ 3.36
PHF23-212ENST00000576955 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP36.02■■■■□ 3.36
PHF23-212ENST00000576955 SETD5Q9C0A6 1442 aa35.95■■■■□ 3.35
PHF23-212ENST00000576955 PTPRKQ15262 1439 aa35.94■■■■□ 3.34
PHF23-212ENST00000576955 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa35.93■■■■□ 3.34
PHF23-212ENST00000576955 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP35.92■■■■□ 3.34
PHF23-212ENST00000576955 PREX2Q70Z35 1606 aa35.89■■■■□ 3.34
PHF23-212ENST00000576955 TTC37Q6PGP7 1564 aa35.89■■■■□ 3.34
PHF23-212ENST00000576955 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP35.89■■■■□ 3.34
PHF23-212ENST00000576955 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP35.89■■■■□ 3.34
PHF23-212ENST00000576955 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa35.89■■■■□ 3.34
PHF23-212ENST00000576955 KCNH8Q96L42 1107 aa35.88■■■■□ 3.33
PHF23-212ENST00000576955 WDR7Q9Y4E6 1490 aa35.87■■■■□ 3.33
PHF23-212ENST00000576955 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP35.87■■■■□ 3.33
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