RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575701.4

SRRM2-223, Transcript of serine/arginine repetitive matrix 2, human

TSL 3

Gene SRRM2, Length 860 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SRRM2-223	ENST00000575701	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		42.7	■■■■■ 4.43
SRRM2-223	ENST00000575701	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		42.69	■■■■■ 4.42
SRRM2-223	ENST00000575701	JPH4	Q96JJ6	628 aa		42.68	■■■■■ 4.42
SRRM2-223	ENST00000575701	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	42.63	■■■■■ 4.42
SRRM2-223	ENST00000575701	EEA1	Q15075	1411 aa		42.54	■■■■■ 4.4
SRRM2-223	ENST00000575701	PRX	Q9BXM0	1461 aa		42.51	■■■■■ 4.4
SRRM2-223	ENST00000575701	IQGAP2	Q13576	1575 aa		42.5	■■■■■ 4.39
SRRM2-223	ENST00000575701	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		42.48	■■■■■ 4.39
SRRM2-223	ENST00000575701	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		42.39	■■■■■ 4.38
SRRM2-223	ENST00000575701	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		42.35	■■■■■ 4.37
SRRM2-223	ENST00000575701	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		42.32	■■■■■ 4.37
SRRM2-223	ENST00000575701	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		42.27	■■■■■ 4.36
SRRM2-223	ENST00000575701	DISP1	Q96F81	1524 aa		42.16	■■■■■ 4.34
SRRM2-223	ENST00000575701	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		42.15	■■■■■ 4.34
SRRM2-223	ENST00000575701	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	42.12	■■■■■ 4.33
SRRM2-223	ENST00000575701	PTPRG	P23470	1445 aa		42.12	■■■■■ 4.33
SRRM2-223	ENST00000575701	KIAA0556	O60303	1618 aa		42.09	■■■■■ 4.33
SRRM2-223	ENST00000575701	KIF21B	O75037	1637 aa		42.09	■■■■■ 4.33
SRRM2-223	ENST00000575701	GOLGA3	Q08378	1498 aa		42.05	■■■■■ 4.32
SRRM2-223	ENST00000575701	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		42.03	■■■■■ 4.32
SRRM2-223	ENST00000575701	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	42.03	■■■■■ 4.32
SRRM2-223	ENST00000575701	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	41.93	■■■■■ 4.3
SRRM2-223	ENST00000575701	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	41.9	■■■■■ 4.3
SRRM2-223	ENST00000575701	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		41.86	■■■■■ 4.29
SRRM2-223	ENST00000575701	MAPKBP1	O60336	1514 aa		41.85	■■■■■ 4.29
SRRM2-223	ENST00000575701	UACA	Q9BZF9	1416 aa		41.85	■■■■■ 4.29
SRRM2-223	ENST00000575701	ABCC2	Q92887	1545 aa		41.81	■■■■■ 4.28
SRRM2-223	ENST00000575701	SAMD9	Q5K651	1589 aa		41.79	■■■■■ 4.28
SRRM2-223	ENST00000575701	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		41.64	■■■■■ 4.26
SRRM2-223	ENST00000575701	ABCA8	O94911	1581 aa		41.63	■■■■■ 4.26
SRRM2-223	ENST00000575701	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		41.63	■■■■■ 4.26
SRRM2-223	ENST00000575701	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		41.63	■■■■■ 4.25
SRRM2-223	ENST00000575701	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		41.63	■■■■■ 4.25
SRRM2-223	ENST00000575701	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	41.62	■■■■■ 4.25
SRRM2-223	ENST00000575701	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		41.62	■■■■■ 4.25
SRRM2-223	ENST00000575701	P3H3	Q8IVL6	736 aa		41.57	■■■■■ 4.25
SRRM2-223	ENST00000575701	DIP2B	Q9P265	1576 aa		41.57	■■■■■ 4.25
SRRM2-223	ENST00000575701	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	41.55	■■■■■ 4.24
SRRM2-223	ENST00000575701	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		41.52	■■■■■ 4.24
SRRM2-223	ENST00000575701	ASXL2	Q76L83	1435 aa		41.51	■■■■■ 4.24
SRRM2-223	ENST00000575701	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	41.5	■■■■■ 4.23
SRRM2-223	ENST00000575701	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		41.47	■■■■■ 4.23
SRRM2-223	ENST00000575701	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		41.44	■■■■■ 4.23
SRRM2-223	ENST00000575701	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		41.4	■■■■■ 4.22
SRRM2-223	ENST00000575701	GLI2	P10070	1586 aa		41.35	■■■■■ 4.21
SRRM2-223	ENST00000575701	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		41.31	■■■■■ 4.2
SRRM2-223	ENST00000575701	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	41.28	■■■■■ 4.2
SRRM2-223	ENST00000575701	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		41.28	■■■■■ 4.2
SRRM2-223	ENST00000575701	ATP10B	O94823	1461 aa		41.25	■■■■■ 4.19
SRRM2-223	ENST00000575701	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	41.21	■■■■■ 4.19
SRRM2-223	ENST00000575701	FMN1	Q68DA7	1419 aa		41.2	■■■■■ 4.19
SRRM2-223	ENST00000575701	TSPOAP1	O95153	1857 aa		41.15	■■■■■ 4.18
SRRM2-223	ENST00000575701	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		41.14	■■■■■ 4.18
SRRM2-223	ENST00000575701	ARID3C	A6NKF2	412 aa		41.12	■■■■■ 4.17
SRRM2-223	ENST00000575701	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	41.05	■■■■■ 4.16
SRRM2-223	ENST00000575701	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		41.04	■■■■■ 4.16
SRRM2-223	ENST00000575701	HECW1	Q76N89	1606 aa		41.04	■■■■■ 4.16
SRRM2-223	ENST00000575701	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	41.03	■■■■■ 4.16
SRRM2-223	ENST00000575701	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	41.03	■■■■■ 4.16
SRRM2-223	ENST00000575701	CLIP1	P30622	1438 aa		41.01	■■■■■ 4.15
SRRM2-223	ENST00000575701	KCNH8	Q96L42	1107 aa		41	■■■■■ 4.15
SRRM2-223	ENST00000575701	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		40.99	■■■■■ 4.15
SRRM2-223	ENST00000575701	KDM6B	O15054	1643 aa		40.95	■■■■■ 4.15
SRRM2-223	ENST00000575701	CD109	Q6YHK3	1445 aa		40.92	■■■■■ 4.14
SRRM2-223	ENST00000575701	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		40.9	■■■■■ 4.14
SRRM2-223	ENST00000575701	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		40.89	■■■■■ 4.14
SRRM2-223	ENST00000575701	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		40.89	■■■■■ 4.14
SRRM2-223	ENST00000575701	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	40.88	■■■■■ 4.13
SRRM2-223	ENST00000575701	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	40.83	■■■■■ 4.13
SRRM2-223	ENST00000575701	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		40.83	■■■■■ 4.13
SRRM2-223	ENST00000575701	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	40.82	■■■■■ 4.12
SRRM2-223	ENST00000575701	CEP162	Q5TB80	1403 aa		40.79	■■■■■ 4.12
SRRM2-223	ENST00000575701	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		40.77	■■■■■ 4.12
SRRM2-223	ENST00000575701	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	40.74	■■■■■ 4.11
SRRM2-223	ENST00000575701	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		40.74	■■■■■ 4.11
SRRM2-223	ENST00000575701	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		40.73	■■■■■ 4.11
SRRM2-223	ENST00000575701	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		40.66	■■■■■ 4.1
SRRM2-223	ENST00000575701	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	40.65	■■■■■ 4.1	9e-17	■□□□□ 9.3
SRRM2-223	ENST00000575701	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	40.62	■■■■■ 4.09
SRRM2-223	ENST00000575701	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		40.61	■■■■■ 4.09
SRRM2-223	ENST00000575701	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	40.6	■■■■■ 4.09
SRRM2-223	ENST00000575701	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		40.59	■■■■■ 4.09
SRRM2-223	ENST00000575701	NEO1	Q92859	1461 aa		40.58	■■■■■ 4.09
SRRM2-223	ENST00000575701	KIF14	Q15058	1648 aa		40.56	■■■■■ 4.08
SRRM2-223	ENST00000575701	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		40.54	■■■■■ 4.08
SRRM2-223	ENST00000575701	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		40.52	■■■■■ 4.08
SRRM2-223	ENST00000575701	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		40.44	■■■■■ 4.06
SRRM2-223	ENST00000575701	FANCA	O15360	1455 aa		40.44	■■■■■ 4.06
SRRM2-223	ENST00000575701	PLCH2	O75038	1416 aa		40.42	■■■■■ 4.06
SRRM2-223	ENST00000575701	AKNA	Q7Z591	1439 aa		40.35	■■■■■ 4.05
SRRM2-223	ENST00000575701	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		40.33	■■■■■ 4.05
SRRM2-223	ENST00000575701	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	40.26	■■■■■ 4.03
SRRM2-223	ENST00000575701	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		40.25	■■■■■ 4.03
SRRM2-223	ENST00000575701	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		40.24	■■■■■ 4.03
SRRM2-223	ENST00000575701	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		40.24	■■■■■ 4.03
SRRM2-223	ENST00000575701	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		40.24	■■■■■ 4.03
SRRM2-223	ENST00000575701	PREX2	Q70Z35	1606 aa		40.24	■■■■■ 4.03
SRRM2-223	ENST00000575701	ADGRL1	O94910	1474 aa		40.22	■■■■■ 4.03
SRRM2-223	ENST00000575701	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		40.21	■■■■■ 4.03
SRRM2-223	ENST00000575701	RICTOR	Q6R327	1708 aa		40.21	■■■■■ 4.03

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