RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575701.4

SRRM2-223, Transcript of serine/arginine repetitive matrix 2, human

TSL 3

Gene SRRM2, Length 860 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SRRM2-223	ENST00000575701	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		61.72	■■■■■ 7.47
SRRM2-223	ENST00000575701	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		55.02	■■■■■ 6.4
SRRM2-223	ENST00000575701	ABCC9	O60706	1549 aa		53.78	■■■■■ 6.2
SRRM2-223	ENST00000575701	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		51.8	■■■■■ 5.88
SRRM2-223	ENST00000575701	NACAD	O15069	1562 aa		51.72	■■■■■ 5.87
SRRM2-223	ENST00000575701	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		51.46	■■■■■ 5.83
SRRM2-223	ENST00000575701	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		51.43	■■■■■ 5.82
SRRM2-223	ENST00000575701	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	51.41	■■■■■ 5.82
SRRM2-223	ENST00000575701	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		51.14	■■■■■ 5.78
SRRM2-223	ENST00000575701	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		50.57	■■■■■ 5.69
SRRM2-223	ENST00000575701	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		50.17	■■■■■ 5.62
SRRM2-223	ENST00000575701	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	50.15	■■■■■ 5.62
SRRM2-223	ENST00000575701	SCRIB	Q14160	1630 aa		50.07	■■■■■ 5.61
SRRM2-223	ENST00000575701	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		49.8	■■■■■ 5.56
SRRM2-223	ENST00000575701	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		49.35	■■■■■ 5.49
SRRM2-223	ENST00000575701	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	48.88	■■■■■ 5.42
SRRM2-223	ENST00000575701	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		48.69	■■■■■ 5.39
SRRM2-223	ENST00000575701	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		48.37	■■■■■ 5.33
SRRM2-223	ENST00000575701	SMARCA4	P51532	1647 aa		47.92	■■■■■ 5.26
SRRM2-223	ENST00000575701	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	47.89	■■■■■ 5.26
SRRM2-223	ENST00000575701	NCAPD3	P42695	1498 aa		47.69	■■■■■ 5.22
SRRM2-223	ENST00000575701	SMARCA2	P51531	1590 aa		47.67	■■■■■ 5.22
SRRM2-223	ENST00000575701	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		47.66	■■■■■ 5.22
SRRM2-223	ENST00000575701	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		47.51	■■■■■ 5.2
SRRM2-223	ENST00000575701	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		47.51	■■■■■ 5.2
SRRM2-223	ENST00000575701	HMGXB3	Q12766	1538 aa		47.49	■■■■■ 5.19
SRRM2-223	ENST00000575701	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	47.29	■■■■■ 5.16
SRRM2-223	ENST00000575701	WIZ	O95785	1651 aa		47	■■■■■ 5.12
SRRM2-223	ENST00000575701	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	46.93	■■■■■ 5.1
SRRM2-223	ENST00000575701	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	46.57	■■■■■ 5.05
SRRM2-223	ENST00000575701	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		46.49	■■■■■ 5.03
SRRM2-223	ENST00000575701	NES	P48681	1621 aa		46.48	■■■■■ 5.03
SRRM2-223	ENST00000575701	ERCC6	Q03468	1493 aa		46.42	■■■■■ 5.02
SRRM2-223	ENST00000575701	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		46.27	■■■■■ 5
SRRM2-223	ENST00000575701	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		46.16	■■■■■ 4.98
SRRM2-223	ENST00000575701	CUX2	O14529	1486 aa		46.02	■■■■■ 4.96
SRRM2-223	ENST00000575701	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		46	■■■■■ 4.95
SRRM2-223	ENST00000575701	CFTR	P13569	1480 aa		45.99	■■■■■ 4.95
SRRM2-223	ENST00000575701	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		45.95	■■■■■ 4.95
SRRM2-223	ENST00000575701	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	45.91	■■■■■ 4.94
SRRM2-223	ENST00000575701	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		45.74	■■■■■ 4.91
SRRM2-223	ENST00000575701	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		45.72	■■■■■ 4.91
SRRM2-223	ENST00000575701	PRDM2	Q13029	1718 aa		45.72	■■■■■ 4.91
SRRM2-223	ENST00000575701	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		45.68	■■■■■ 4.9
SRRM2-223	ENST00000575701	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	45.57	■■■■■ 4.89
SRRM2-223	ENST00000575701	WDR62	O43379	1518 aa		45.55	■■■■■ 4.88
SRRM2-223	ENST00000575701	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	45.26	■■■■■ 4.84
SRRM2-223	ENST00000575701	ABCC8	Q09428	1581 aa		45.07	■■■■■ 4.8
SRRM2-223	ENST00000575701	TOPBP1	Q92547	1522 aa		45	■■■■■ 4.79
SRRM2-223	ENST00000575701	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		44.98	■■■■■ 4.79
SRRM2-223	ENST00000575701	IFT140	Q96RY7	1462 aa		44.78	■■■■■ 4.76
SRRM2-223	ENST00000575701	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		44.63	■■■■■ 4.74
SRRM2-223	ENST00000575701	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	44.6	■■■■■ 4.73
SRRM2-223	ENST00000575701	CUX1	P39880	1505 aa		44.6	■■■■■ 4.73
SRRM2-223	ENST00000575701	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	44.53	■■■■■ 4.72
SRRM2-223	ENST00000575701	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	44.5	■■■■■ 4.71
SRRM2-223	ENST00000575701	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		44.47	■■■■■ 4.71
SRRM2-223	ENST00000575701	SOGA1	O94964	1423 aa		44.41	■■■■■ 4.7
SRRM2-223	ENST00000575701	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	44.39	■■■■■ 4.7
SRRM2-223	ENST00000575701	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		44.35	■■■■■ 4.69
SRRM2-223	ENST00000575701	WDR97	A6NE52	1622 aa		44.29	■■■■■ 4.68
SRRM2-223	ENST00000575701	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	44.29	■■■■■ 4.68
SRRM2-223	ENST00000575701	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		44.25	■■■■■ 4.67
SRRM2-223	ENST00000575701	TOP2B	Q02880	1626 aa		44.24	■■■■■ 4.67
SRRM2-223	ENST00000575701	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	44.22	■■■■■ 4.67	7e-17	■■■■■ 28.9
SRRM2-223	ENST00000575701	SYNJ1	O43426	1573 aa		44.17	■■■■■ 4.66
SRRM2-223	ENST00000575701	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	44.12	■■■■■ 4.65
SRRM2-223	ENST00000575701	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		44.08	■■■■■ 4.65
SRRM2-223	ENST00000575701	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		44.01	■■■■■ 4.64
SRRM2-223	ENST00000575701	GRIN2B	Q13224	1484 aa		43.95	■■■■■ 4.63
SRRM2-223	ENST00000575701	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		43.92	■■■■■ 4.62
SRRM2-223	ENST00000575701	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		43.91	■■■■■ 4.62
SRRM2-223	ENST00000575701	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		43.87	■■■■■ 4.61
SRRM2-223	ENST00000575701	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	43.87	■■■■■ 4.61
SRRM2-223	ENST00000575701	PBRM1	Q86U86	1689 aa		43.86	■■■■■ 4.61
SRRM2-223	ENST00000575701	CHD1	O14646	1710 aa		43.84	■■■■■ 4.61
SRRM2-223	ENST00000575701	FBLN2	P98095	1184 aa		43.69	■■■■■ 4.58
SRRM2-223	ENST00000575701	SYNJ2	O15056	1496 aa		43.68	■■■■■ 4.58
SRRM2-223	ENST00000575701	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	43.6	■■■■■ 4.57
SRRM2-223	ENST00000575701	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		43.58	■■■■■ 4.57
SRRM2-223	ENST00000575701	ADAMTS12	P58397	1594 aa		43.51	■■■■■ 4.56
SRRM2-223	ENST00000575701	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		43.42	■■■■■ 4.54
SRRM2-223	ENST00000575701	KIF27	Q86VH2	1401 aa		43.39	■■■■■ 4.54
SRRM2-223	ENST00000575701	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		43.38	■■■■■ 4.54
SRRM2-223	ENST00000575701	GRIN2A	Q12879	1464 aa		43.37	■■■■■ 4.53
SRRM2-223	ENST00000575701	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		43.34	■■■■■ 4.53
SRRM2-223	ENST00000575701	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		43.34	■■■■■ 4.53
SRRM2-223	ENST00000575701	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		43.34	■■■■■ 4.53
SRRM2-223	ENST00000575701	ARHGEF11	O15085	1522 aa		43.33	■■■■■ 4.53
SRRM2-223	ENST00000575701	CUL7	Q14999	1698 aa		43.18	■■■■■ 4.5
SRRM2-223	ENST00000575701	NUP160	Q12769	1436 aa		43.18	■■■■■ 4.5
SRRM2-223	ENST00000575701	IGF1R	P08069	1367 aa		43.16	■■■■■ 4.5
SRRM2-223	ENST00000575701	CEP170	Q5SW79	1584 aa		43.14	■■■■■ 4.5
SRRM2-223	ENST00000575701	TRIM41	Q8WV44	630 aa		43.11	■■■■■ 4.49
SRRM2-223	ENST00000575701	ARAP1	Q96P48	1450 aa		42.95	■■■■■ 4.47
SRRM2-223	ENST00000575701	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		42.92	■■■■■ 4.46
SRRM2-223	ENST00000575701	SHROOM2	Q13796	1616 aa		42.9	■■■■■ 4.46
SRRM2-223	ENST00000575701	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		42.87	■■■■■ 4.45
SRRM2-223	ENST00000575701	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		42.85	■■■■■ 4.45
SRRM2-223	ENST00000575701	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		42.75	■■■■■ 4.43

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