RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574331.5

SRRM2-218, Transcript of serine/arginine repetitive matrix 2, humanhuman

TSL 2

Gene SRRM2, Length 1,759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM2-218ENST00000574331 GRIN2AQ12879 1464 aa27.67■■■□□ 2.02
SRRM2-218ENST00000574331 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.66■■■□□ 2.02
SRRM2-218ENST00000574331 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP27.65■■■□□ 2.02
SRRM2-218ENST00000574331 FBLN2P98095 1184 aa27.6■■■□□ 2.01
SRRM2-218ENST00000574331 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa27.53■■■□□ 2
SRRM2-218ENST00000574331 CHD1O14646 1710 aa27.52■■■□□ 2
SRRM2-218ENST00000574331 IQGAP2Q13576 1575 aa27.52■■■□□ 2
SRRM2-218ENST00000574331 CEP170Q5SW79 1584 aa27.5■■□□□ 1.99
SRRM2-218ENST00000574331 HRCP23327 699 aa27.5■■□□□ 1.99
SRRM2-218ENST00000574331 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa27.5■■□□□ 1.99
SRRM2-218ENST00000574331 NUP160Q12769 1436 aa27.49■■□□□ 1.99
SRRM2-218ENST00000574331 EFCAB5A4FU69 1503 aa27.47■■□□□ 1.99
SRRM2-218ENST00000574331 ARAP1Q96P48 1450 aa27.46■■□□□ 1.99
SRRM2-218ENST00000574331 VPS8Q8N3P4 1428 aa27.42■■□□□ 1.98
SRRM2-218ENST00000574331 SAMD9Q5K651 1589 aa27.41■■□□□ 1.98
SRRM2-218ENST00000574331 UGGT2Q9NYU1 1516 aa27.38■■□□□ 1.97
SRRM2-218ENST00000574331 P3H3Q8IVL6 736 aa27.34■■□□□ 1.97
SRRM2-218ENST00000574331 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.31■■□□□ 1.96
SRRM2-218ENST00000574331 JPH4Q96JJ6 628 aa27.27■■□□□ 1.96
SRRM2-218ENST00000574331 DISP1Q96F81 1524 aa27.25■■□□□ 1.95
SRRM2-218ENST00000574331 KIAA0556O60303 1618 aa27.24■■□□□ 1.95
SRRM2-218ENST00000574331 FMN1Q68DA7 1419 aa27.22■■□□□ 1.95
SRRM2-218ENST00000574331 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.18■■□□□ 1.94
SRRM2-218ENST00000574331 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa27.17■■□□□ 1.94
SRRM2-218ENST00000574331 SHROOM2Q13796 1616 aa27.17■■□□□ 1.94
SRRM2-218ENST00000574331 APLP2Q06481 763 aa27.16■■□□□ 1.94
SRRM2-218ENST00000574331 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.93
SRRM2-218ENST00000574331 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.12■■□□□ 1.93
SRRM2-218ENST00000574331 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
SRRM2-218ENST00000574331 FYCO1Q9BQS8 1478 aa27.11■■□□□ 1.93
SRRM2-218ENST00000574331 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
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SRRM2-218ENST00000574331 OSCARQ8IYS5 282 aa27.07■■□□□ 1.92
SRRM2-218ENST00000574331 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
SRRM2-218ENST00000574331 MAP3K1Q13233 1512 aa27.02■■□□□ 1.92
SRRM2-218ENST00000574331 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
SRRM2-218ENST00000574331 TIAM1Q13009 1591 aa26.99■■□□□ 1.91
SRRM2-218ENST00000574331 HECW1Q76N89 1606 aa26.97■■□□□ 1.91
SRRM2-218ENST00000574331 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.96■■□□□ 1.91
SRRM2-218ENST00000574331 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.95■■□□□ 1.91
SRRM2-218ENST00000574331 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.94■■□□□ 1.9
SRRM2-218ENST00000574331 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa26.94■■□□□ 1.9
SRRM2-218ENST00000574331 PTPRGP23470 1445 aa26.92■■□□□ 1.9
SRRM2-218ENST00000574331 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
SRRM2-218ENST00000574331 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.89■■□□□ 1.9
SRRM2-218ENST00000574331 PLB1Q6P1J6 1458 aa26.89■■□□□ 1.9
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SRRM2-218ENST00000574331 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.86■■□□□ 1.89
SRRM2-218ENST00000574331 ABCA8O94911 1581 aa26.86■■□□□ 1.89
SRRM2-218ENST00000574331 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
SRRM2-218ENST00000574331 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
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SRRM2-218ENST00000574331 ARID3CA6NKF2 412 aa26.75■■□□□ 1.87
SRRM2-218ENST00000574331 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.75■■□□□ 1.87
SRRM2-218ENST00000574331 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.71■■□□□ 1.87
SRRM2-218ENST00000574331 ABCC2Q92887 1545 aa26.69■■□□□ 1.86
SRRM2-218ENST00000574331 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.69■■□□□ 1.86
SRRM2-218ENST00000574331 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
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SRRM2-218ENST00000574331 ATP10BO94823 1461 aa26.67■■□□□ 1.86
SRRM2-218ENST00000574331 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa26.65■■□□□ 1.86
SRRM2-218ENST00000574331 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
SRRM2-218ENST00000574331 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
SRRM2-218ENST00000574331 ARHGEF11O15085 1522 aa26.62■■□□□ 1.85
SRRM2-218ENST00000574331 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.58■■□□□ 1.85
SRRM2-218ENST00000574331 NCOA2Q15596 1464 aa26.58■■□□□ 1.85
SRRM2-218ENST00000574331 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
SRRM2-218ENST00000574331 ADCY10Q96PN6 1610 aa26.56■■□□□ 1.84
SRRM2-218ENST00000574331 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
SRRM2-218ENST00000574331 PLEKHD1A6NEE1 506 aa26.55■■□□□ 1.84
SRRM2-218ENST00000574331 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.54■■□□□ 1.84
SRRM2-218ENST00000574331 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
SRRM2-218ENST00000574331 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.51■■□□□ 1.83
SRRM2-218ENST00000574331 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.51■■□□□ 1.83
SRRM2-218ENST00000574331 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.51■■□□□ 1.83
SRRM2-218ENST00000574331 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26.5■■□□□ 1.83
SRRM2-218ENST00000574331 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.47■■□□□ 1.83
SRRM2-218ENST00000574331 KIF14Q15058 1648 aa26.44■■□□□ 1.82
SRRM2-218ENST00000574331 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.43■■□□□ 1.82
SRRM2-218ENST00000574331 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.36■■□□□ 1.819e-26■■□□□ 12.1
SRRM2-218ENST00000574331 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.36■■□□□ 1.81
SRRM2-218ENST00000574331 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP26.35■■□□□ 1.81
SRRM2-218ENST00000574331 MIA2Q96PC5 1412 aa26.35■■□□□ 1.81
SRRM2-218ENST00000574331 ABCC10Q5T3U5 1492 aa26.35■■□□□ 1.81
SRRM2-218ENST00000574331 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.34■■□□□ 1.81
SRRM2-218ENST00000574331 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
SRRM2-218ENST00000574331 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.33■■□□□ 1.81
SRRM2-218ENST00000574331 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
SRRM2-218ENST00000574331 WDR7Q9Y4E6 1490 aa26.3■■□□□ 1.8
SRRM2-218ENST00000574331 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.3■■□□□ 1.8
SRRM2-218ENST00000574331 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
SRRM2-218ENST00000574331 KCNH8Q96L42 1107 aa26.28■■□□□ 1.8
SRRM2-218ENST00000574331 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP26.27■■□□□ 1.82e-7■□□□□ 9
SRRM2-218ENST00000574331 ASXL2Q76L83 1435 aa26.27■■□□□ 1.8
SRRM2-218ENST00000574331 TTC37Q6PGP7 1564 aa26.25■■□□□ 1.79
SRRM2-218ENST00000574331 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
SRRM2-218ENST00000574331 ITGAEP38570 1179 aa26.23■■□□□ 1.79
SRRM2-218ENST00000574331 PREX2Q70Z35 1606 aa26.21■■□□□ 1.79
SRRM2-218ENST00000574331 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.2■■□□□ 1.78
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