RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569248.5

STUB1-211, Transcript of STIP1 homology and U-box containing protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene STUB1, Length 1,853 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STUB1-211ENST00000569248 FHAD1B1AJZ9 1412 aa44.85■■■■■ 4.77
STUB1-211ENST00000569248 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP44.84■■■■■ 4.771e-6■■■■□ 24.9
STUB1-211ENST00000569248 GRIN2BQ13224 1484 aa44.8■■■■■ 4.76
STUB1-211ENST00000569248 MAP3K1Q13233 1512 aa44.79■■■■■ 4.76
STUB1-211ENST00000569248 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.79■■■■■ 4.76
STUB1-211ENST00000569248 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP44.75■■■■■ 4.75
STUB1-211ENST00000569248 ADAMTS12P58397 1594 aa44.73■■■■■ 4.75
STUB1-211ENST00000569248 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.67■■■■■ 4.74
STUB1-211ENST00000569248 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP44.66■■■■■ 4.74
STUB1-211ENST00000569248 P3H3Q8IVL6 736 aa44.66■■■■■ 4.74
STUB1-211ENST00000569248 FHOD3Q2V2M9 1422 aa44.66■■■■■ 4.74
STUB1-211ENST00000569248 TIAM1Q13009 1591 aa44.65■■■■■ 4.74
STUB1-211ENST00000569248 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP44.63■■■■■ 4.73
STUB1-211ENST00000569248 SAMD9Q5K651 1589 aa44.61■■■■■ 4.73
STUB1-211ENST00000569248 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP44.59■■■■■ 4.73
STUB1-211ENST00000569248 FYCO1Q9BQS8 1478 aa44.56■■■■■ 4.72
STUB1-211ENST00000569248 FMN1Q68DA7 1419 aa44.55■■■■■ 4.72
STUB1-211ENST00000569248 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP44.53■■■■■ 4.72
STUB1-211ENST00000569248 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa44.53■■■■■ 4.72
STUB1-211ENST00000569248 CFAP43Q8NDM7 1665 aa44.5■■■■■ 4.71
STUB1-211ENST00000569248 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP44.49■■■■■ 4.71
STUB1-211ENST00000569248 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP44.48■■■■■ 4.71
STUB1-211ENST00000569248 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa44.46■■■■■ 4.71
STUB1-211ENST00000569248 IQGAP2Q13576 1575 aa44.42■■■■■ 4.7
STUB1-211ENST00000569248 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.41■■■■■ 4.7
STUB1-211ENST00000569248 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP44.34■■■■■ 4.69
STUB1-211ENST00000569248 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44.33■■■■■ 4.69
STUB1-211ENST00000569248 CCNB3Q8WWL7 1395 aa44.29■■■■■ 4.68
STUB1-211ENST00000569248 GRIN2AQ12879 1464 aa44.26■■■■■ 4.68
STUB1-211ENST00000569248 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa44.23■■■■■ 4.67
STUB1-211ENST00000569248 UGGT2Q9NYU1 1516 aa44.22■■■■■ 4.67
STUB1-211ENST00000569248 SYNJ2O15056 1496 aa44.16■■■■■ 4.66
STUB1-211ENST00000569248 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP44.08■■■■■ 4.65
STUB1-211ENST00000569248 PHLDB1Q86UU1 1377 aa44.08■■■■■ 4.65
STUB1-211ENST00000569248 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa44.06■■■■■ 4.64
STUB1-211ENST00000569248 CCDC18Q5T9S5 1454 aa43.98■■■■■ 4.63
STUB1-211ENST00000569248 MTUS2Q5JR59 1369 aa43.97■■■■■ 4.63
STUB1-211ENST00000569248 HECW1Q76N89 1606 aa43.97■■■■■ 4.63
STUB1-211ENST00000569248 KIAA0556O60303 1618 aa43.95■■■■■ 4.63
STUB1-211ENST00000569248 CEP170Q5SW79 1584 aa43.94■■■■■ 4.63
STUB1-211ENST00000569248 DISP1Q96F81 1524 aa43.93■■■■■ 4.62
STUB1-211ENST00000569248 NUP160Q12769 1436 aa43.89■■■■■ 4.62
STUB1-211ENST00000569248 FBLN2P98095 1184 aa43.87■■■■■ 4.61
STUB1-211ENST00000569248 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa43.87■■■■■ 4.61
STUB1-211ENST00000569248 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP43.86■■■■■ 4.61
STUB1-211ENST00000569248 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP43.81■■■■■ 4.6
STUB1-211ENST00000569248 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP43.79■■■■■ 4.6
STUB1-211ENST00000569248 ITGAEP38570 1179 aa43.79■■■■■ 4.6
STUB1-211ENST00000569248 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP43.78■■■■■ 4.6
STUB1-211ENST00000569248 CLSPNQ9HAW4 1339 aa43.76■■■■■ 4.6
STUB1-211ENST00000569248 NCOA2Q15596 1464 aa43.74■■■■■ 4.59
STUB1-211ENST00000569248 FGD6Q6ZV73 1430 aa43.73■■■■■ 4.59
STUB1-211ENST00000569248 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP43.7■■■■■ 4.59
STUB1-211ENST00000569248 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa43.67■■■■■ 4.58
STUB1-211ENST00000569248 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa43.67■■■■■ 4.58
STUB1-211ENST00000569248 JPH4Q96JJ6 628 aa43.66■■■■■ 4.58
STUB1-211ENST00000569248 ARHGEF11O15085 1522 aa43.65■■■■■ 4.58
STUB1-211ENST00000569248 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa43.64■■■■■ 4.58
STUB1-211ENST00000569248 MYOM3Q5VTT5 1437 aa43.64■■■■■ 4.58
STUB1-211ENST00000569248 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP43.61■■■■■ 4.57
STUB1-211ENST00000569248 SETD5Q9C0A6 1442 aa43.59■■■■■ 4.57
STUB1-211ENST00000569248 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa43.56■■■■■ 4.56
STUB1-211ENST00000569248 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP43.54■■■■■ 4.56
STUB1-211ENST00000569248 CHD1O14646 1710 aa43.45■■■■■ 4.55
STUB1-211ENST00000569248 PTPN23Q9H3S7 1636 aa43.44■■■■■ 4.54
STUB1-211ENST00000569248 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP43.42■■■■■ 4.54
STUB1-211ENST00000569248 ARID3CA6NKF2 412 aa43.39■■■■■ 4.54
STUB1-211ENST00000569248 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP43.37■■■■■ 4.53
STUB1-211ENST00000569248 PLB1Q6P1J6 1458 aa43.36■■■■■ 4.53
STUB1-211ENST00000569248 MIA2Q96PC5 1412 aa43.36■■■■■ 4.53
STUB1-211ENST00000569248 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP43.26■■■■■ 4.52
STUB1-211ENST00000569248 ABCA8O94911 1581 aa43.26■■■■■ 4.52
STUB1-211ENST00000569248 PTPRKQ15262 1439 aa43.25■■■■■ 4.51
STUB1-211ENST00000569248 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP43.22■■■■■ 4.51
STUB1-211ENST00000569248 HFM1A2PYH4 1435 aa43.22■■■■■ 4.51
STUB1-211ENST00000569248 SHROOM2Q13796 1616 aa43.18■■■■■ 4.5
STUB1-211ENST00000569248 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP43.15■■■■■ 4.5
STUB1-211ENST00000569248 MAPKBP1O60336 1514 aa43.15■■■■■ 4.5
STUB1-211ENST00000569248 PTPRGP23470 1445 aa43.12■■■■■ 4.49
STUB1-211ENST00000569248 ADCY10Q96PN6 1610 aa43.12■■■■■ 4.49
STUB1-211ENST00000569248 NAIPQ13075 1403 aa43.07■■■■■ 4.49
STUB1-211ENST00000569248 ATP10BO94823 1461 aa43.03■■■■■ 4.48
STUB1-211ENST00000569248 AKNAQ7Z591 1439 aa43.02■■■■■ 4.48
STUB1-211ENST00000569248 ITSN2Q9NZM3 1697 aa43.01■■■■■ 4.48
STUB1-211ENST00000569248 PLEKHD1A6NEE1 506 aa42.99■■■■■ 4.47
STUB1-211ENST00000569248 GCC2Q8IWJ2 1684 aa42.95■■■■■ 4.47
STUB1-211ENST00000569248 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP42.95■■■■■ 4.47
STUB1-211ENST00000569248 KIF14Q15058 1648 aa42.94■■■■■ 4.47
STUB1-211ENST00000569248 UACAQ9BZF9 1416 aa42.94■■■■■ 4.46
STUB1-211ENST00000569248 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.91■■■■■ 4.46
STUB1-211ENST00000569248 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP42.9■■■■■ 4.46
STUB1-211ENST00000569248 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP42.9■■■■■ 4.46
STUB1-211ENST00000569248 DAPK1P53355 1430 aa42.88■■■■■ 4.45
STUB1-211ENST00000569248 CHIC2Q9UKJ5 165 aa42.87■■■■■ 4.45
STUB1-211ENST00000569248 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP42.85■■■■■ 4.45
STUB1-211ENST00000569248 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa42.84■■■■■ 4.45
STUB1-211ENST00000569248 ROCK1Q13464 1354 aa42.83■■■■■ 4.45
STUB1-211ENST00000569248 ABCC5O15440 1437 aa42.81■■■■■ 4.44
STUB1-211ENST00000569248 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP42.8■■■■■ 4.44
STUB1-211ENST00000569248 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa42.8■■■■■ 4.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.5 ms