RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559322.5

SEMA4B-211, Transcript of semaphorin 4B, humanhuman

TSL 4

Gene SEMA4B, Length 559 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4B-211ENST00000559322 TOP2BQ02880 1626 aa34.9■■■■□ 3.18
SEMA4B-211ENST00000559322 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.89■■■■□ 3.18
SEMA4B-211ENST00000559322 MAPKBP1O60336 1514 aa34.81■■■■□ 3.16
SEMA4B-211ENST00000559322 DIP2BQ9P265 1576 aa34.78■■■■□ 3.16
SEMA4B-211ENST00000559322 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.74■■■■□ 3.15
SEMA4B-211ENST00000559322 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.74■■■■□ 3.15
SEMA4B-211ENST00000559322 KDM6BO15054 1643 aa34.73■■■■□ 3.15
SEMA4B-211ENST00000559322 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa34.73■■■■□ 3.15
SEMA4B-211ENST00000559322 ADCY10Q96PN6 1610 aa34.69■■■■□ 3.14
SEMA4B-211ENST00000559322 TSPOAP1O95153 1857 aa34.58■■■■□ 3.13
SEMA4B-211ENST00000559322 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP34.57■■■■□ 3.12
SEMA4B-211ENST00000559322 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa34.5■■■■□ 3.11
SEMA4B-211ENST00000559322 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP34.39■■■■□ 3.1
SEMA4B-211ENST00000559322 PTPRGP23470 1445 aa34.38■■■■□ 3.09
SEMA4B-211ENST00000559322 IGF1RP08069 1367 aa34.31■■■■□ 3.08
SEMA4B-211ENST00000559322 CUL7Q14999 1698 aa34.29■■■■□ 3.08
SEMA4B-211ENST00000559322 ADGRL1O94910 1474 aa34.28■■■■□ 3.08
SEMA4B-211ENST00000559322 ABCC2Q92887 1545 aa34.27■■■■□ 3.08
SEMA4B-211ENST00000559322 ASXL2Q76L83 1435 aa34.26■■■■□ 3.07
SEMA4B-211ENST00000559322 KIF27Q86VH2 1401 aa34.26■■■■□ 3.07
SEMA4B-211ENST00000559322 PLB1Q6P1J6 1458 aa34.25■■■■□ 3.07
SEMA4B-211ENST00000559322 TNIKQ9UKE5 1360 aa34.23■■■■□ 3.07
SEMA4B-211ENST00000559322 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa34.23■■■■□ 3.07
SEMA4B-211ENST00000559322 GLI2P10070 1586 aa34.21■■■■□ 3.07
SEMA4B-211ENST00000559322 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP34.19■■■■□ 3.06
SEMA4B-211ENST00000559322 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.11■■■■□ 3.05
SEMA4B-211ENST00000559322 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa34.09■■■■□ 3.05
SEMA4B-211ENST00000559322 HECW2Q9P2P5 1572 aa34.07■■■■□ 3.05
SEMA4B-211ENST00000559322 UACAQ9BZF9 1416 aa34.07■■■■□ 3.04
SEMA4B-211ENST00000559322 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP34.07■■■■□ 3.04
SEMA4B-211ENST00000559322 IQGAP2Q13576 1575 aa34.05■■■■□ 3.04
SEMA4B-211ENST00000559322 TEX14Q8IWB6 1497 aa34.04■■■■□ 3.04
SEMA4B-211ENST00000559322 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP34.02■■■■□ 3.04
SEMA4B-211ENST00000559322 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa34■■■■□ 3.03
SEMA4B-211ENST00000559322 KDM5BQ9UGL1 1544 aa33.95■■■■□ 3.03
SEMA4B-211ENST00000559322 DISP1Q96F81 1524 aa33.93■■■■□ 3.02
SEMA4B-211ENST00000559322 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP33.88■■■■□ 3.01
SEMA4B-211ENST00000559322 WDR7Q9Y4E6 1490 aa33.78■■■■□ 3
SEMA4B-211ENST00000559322 UGGT2Q9NYU1 1516 aa33.77■■■■□ 3
SEMA4B-211ENST00000559322 KIAA0556O60303 1618 aa33.74■■■□□ 2.99
SEMA4B-211ENST00000559322 CD109Q6YHK3 1445 aa33.69■■■□□ 2.98
SEMA4B-211ENST00000559322 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa33.69■■■□□ 2.98
SEMA4B-211ENST00000559322 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa33.66■■■□□ 2.98
SEMA4B-211ENST00000559322 KCNH8Q96L42 1107 aa33.66■■■□□ 2.98
SEMA4B-211ENST00000559322 FBXO41Q8TF61 875 aa33.63■■■□□ 2.97
SEMA4B-211ENST00000559322 CFAP43Q8NDM7 1665 aa33.62■■■□□ 2.97
SEMA4B-211ENST00000559322 KIF21BO75037 1637 aa33.57■■■□□ 2.96
SEMA4B-211ENST00000559322 GOLGA3Q08378 1498 aa33.49■■■□□ 2.95
SEMA4B-211ENST00000559322 ABCA8O94911 1581 aa33.47■■■□□ 2.95
SEMA4B-211ENST00000559322 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa33.42■■■□□ 2.94
SEMA4B-211ENST00000559322 ARAP3Q8WWN8 1544 aa33.41■■■□□ 2.94
SEMA4B-211ENST00000559322 PTPRMP28827 1452 aa33.38■■■□□ 2.93
SEMA4B-211ENST00000559322 ARID3CA6NKF2 412 aa33.33■■■□□ 2.93
SEMA4B-211ENST00000559322 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP33.33■■■□□ 2.93
SEMA4B-211ENST00000559322 ADAMTSL3P82987 1691 aa33.31■■■□□ 2.92
SEMA4B-211ENST00000559322 PHLDB1Q86UU1 1377 aa33.28■■■□□ 2.92
SEMA4B-211ENST00000559322 RAPGEF3O95398 923 aa33.25■■■□□ 2.91
SEMA4B-211ENST00000559322 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP33.25■■■□□ 2.91
SEMA4B-211ENST00000559322 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP33.21■■■□□ 2.91
SEMA4B-211ENST00000559322 ATP10BO94823 1461 aa33.2■■■□□ 2.91
SEMA4B-211ENST00000559322 ABCA9Q8IUA7 1624 aa33.2■■■□□ 2.9
SEMA4B-211ENST00000559322 BCORL1Q5H9F3 1711 aa33.16■■■□□ 2.9
SEMA4B-211ENST00000559322 P3H3Q8IVL6 736 aa33.16■■■□□ 2.9
SEMA4B-211ENST00000559322 MADDQ8WXG6 1647 aa33.15■■■□□ 2.9
SEMA4B-211ENST00000559322 NEO1Q92859 1461 aa33.15■■■□□ 2.9
SEMA4B-211ENST00000559322 LMTK3Q96Q04 1460 aa33.14■■■□□ 2.9
SEMA4B-211ENST00000559322 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP33.1■■■□□ 2.89
SEMA4B-211ENST00000559322 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP33.1■■■□□ 2.89
SEMA4B-211ENST00000559322 PRXQ9BXM0 1461 aa33.08■■■□□ 2.89
SEMA4B-211ENST00000559322 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa33.06■■■□□ 2.88
SEMA4B-211ENST00000559322 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP33.02■■■□□ 2.88
SEMA4B-211ENST00000559322 PLPPR3Q6T4P5 718 aa33.01■■■□□ 2.87
SEMA4B-211ENST00000559322 HSPA2P54652 639 aa33■■■□□ 2.87
SEMA4B-211ENST00000559322 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa32.97■■■□□ 2.87
SEMA4B-211ENST00000559322 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa32.97■■■□□ 2.87
SEMA4B-211ENST00000559322 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP32.94■■■□□ 2.86
SEMA4B-211ENST00000559322 POGZQ7Z3K3 1410 aa32.92■■■□□ 2.86
SEMA4B-211ENST00000559322 CERKQ8TCT0 537 aa32.9■■■□□ 2.86
SEMA4B-211ENST00000559322 SAMD9Q5K651 1589 aa32.88■■■□□ 2.85
SEMA4B-211ENST00000559322 FANCAO15360 1455 aa32.87■■■□□ 2.85
SEMA4B-211ENST00000559322 AKNAQ7Z591 1439 aa32.86■■■□□ 2.85
SEMA4B-211ENST00000559322 RICTORQ6R327 1708 aa32.85■■■□□ 2.85
SEMA4B-211ENST00000559322 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP32.84■■■□□ 2.85
SEMA4B-211ENST00000559322 FHOD3Q2V2M9 1422 aa32.84■■■□□ 2.85
SEMA4B-211ENST00000559322 PLEKHD1A6NEE1 506 aa32.83■■■□□ 2.85
SEMA4B-211ENST00000559322 CFAP74Q9C0B2 1584 aa32.81■■■□□ 2.84
SEMA4B-211ENST00000559322 MLECQ14165 292 aa32.79■■■□□ 2.84
SEMA4B-211ENST00000559322 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa32.78■■■□□ 2.84
SEMA4B-211ENST00000559322 EFCAB5A4FU69 1503 aa32.77■■■□□ 2.84
SEMA4B-211ENST00000559322 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP32.76■■■□□ 2.83
SEMA4B-211ENST00000559322 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa32.75■■■□□ 2.83
SEMA4B-211ENST00000559322 YEATS2Q9ULM3 1422 aa32.74■■■□□ 2.83
SEMA4B-211ENST00000559322 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP32.71■■■□□ 2.832e-6■■■■■ 51.7
SEMA4B-211ENST00000559322 MAGI2Q86UL8 1455 aa32.7■■■□□ 2.83
SEMA4B-211ENST00000559322 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa32.7■■■□□ 2.83
SEMA4B-211ENST00000559322 DISP3Q9P2K9 1392 aa32.7■■■□□ 2.82
SEMA4B-211ENST00000559322 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa32.69■■■□□ 2.82
SEMA4B-211ENST00000559322 CSRNP3Q8WYN3 585 aa32.68■■■□□ 2.82
SEMA4B-211ENST00000559322 TTC37Q6PGP7 1564 aa32.66■■■□□ 2.82
SEMA4B-211ENST00000559322 HECW1Q76N89 1606 aa32.64■■■□□ 2.82
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