RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558085.6

TPTEP1-205, Transcript of TPTE pseudogene 1, humanhuman

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Gene TPTEP1, Length 1,738 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP1-205ENST00000558085 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.55■■■□□ 2.8
TPTEP1-205ENST00000558085 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP32.53■■■□□ 2.8
TPTEP1-205ENST00000558085 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa32.47■■■□□ 2.79
TPTEP1-205ENST00000558085 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP32.47■■■□□ 2.79
TPTEP1-205ENST00000558085 APLP2Q06481 763 aa32.4■■■□□ 2.78
TPTEP1-205ENST00000558085 SYNJ2O15056 1496 aa32.39■■■□□ 2.78
TPTEP1-205ENST00000558085 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP32.35■■■□□ 2.77
TPTEP1-205ENST00000558085 GRIN2AQ12879 1464 aa32.35■■■□□ 2.77
TPTEP1-205ENST00000558085 ARAP1Q96P48 1450 aa32.35■■■□□ 2.77
TPTEP1-205ENST00000558085 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa32.31■■■□□ 2.76
TPTEP1-205ENST00000558085 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP32.27■■■□□ 2.76
TPTEP1-205ENST00000558085 EFCAB5A4FU69 1503 aa32.24■■■□□ 2.75
TPTEP1-205ENST00000558085 IQGAP2Q13576 1575 aa32.2■■■□□ 2.75
TPTEP1-205ENST00000558085 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa32.18■■■□□ 2.74
TPTEP1-205ENST00000558085 FBLN2P98095 1184 aa32.15■■■□□ 2.74
TPTEP1-205ENST00000558085 NUP160Q12769 1436 aa32.15■■■□□ 2.74
TPTEP1-205ENST00000558085 CEP170Q5SW79 1584 aa32.14■■■□□ 2.74
TPTEP1-205ENST00000558085 SAMD9Q5K651 1589 aa32.13■■■□□ 2.73
TPTEP1-205ENST00000558085 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP32.08■■■□□ 2.73
TPTEP1-205ENST00000558085 CHD1O14646 1710 aa32.07■■■□□ 2.73
TPTEP1-205ENST00000558085 UGGT2Q9NYU1 1516 aa32.07■■■□□ 2.72
TPTEP1-205ENST00000558085 MAP3K1Q13233 1512 aa32.07■■■□□ 2.72
TPTEP1-205ENST00000558085 FHOD3Q2V2M9 1422 aa32.01■■■□□ 2.72
TPTEP1-205ENST00000558085 P3H3Q8IVL6 736 aa31.99■■■□□ 2.71
TPTEP1-205ENST00000558085 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP31.92■■■□□ 2.7
TPTEP1-205ENST00000558085 FMN1Q68DA7 1419 aa31.92■■■□□ 2.7
TPTEP1-205ENST00000558085 DISP1Q96F81 1524 aa31.88■■■□□ 2.69
TPTEP1-205ENST00000558085 KIAA0556O60303 1618 aa31.88■■■□□ 2.69
TPTEP1-205ENST00000558085 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP31.84■■■□□ 2.69
TPTEP1-205ENST00000558085 JPH4Q96JJ6 628 aa31.84■■■□□ 2.69
TPTEP1-205ENST00000558085 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP31.83■■■□□ 2.69
TPTEP1-205ENST00000558085 TIAM1Q13009 1591 aa31.83■■■□□ 2.69
TPTEP1-205ENST00000558085 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa31.83■■■□□ 2.69
TPTEP1-205ENST00000558085 FYCO1Q9BQS8 1478 aa31.82■■■□□ 2.69
TPTEP1-205ENST00000558085 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP31.8■■■□□ 2.68
TPTEP1-205ENST00000558085 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP31.8■■■□□ 2.68
TPTEP1-205ENST00000558085 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa31.78■■■□□ 2.68
TPTEP1-205ENST00000558085 SHROOM2Q13796 1616 aa31.75■■■□□ 2.67
TPTEP1-205ENST00000558085 CLASP1Q7Z460 1538 aa31.74■■■□□ 2.67
TPTEP1-205ENST00000558085 CFAP43Q8NDM7 1665 aa31.73■■■□□ 2.67
TPTEP1-205ENST00000558085 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa31.69■■■□□ 2.66
TPTEP1-205ENST00000558085 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP31.66■■■□□ 2.66
TPTEP1-205ENST00000558085 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP31.66■■■□□ 2.66
TPTEP1-205ENST00000558085 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP31.63■■■□□ 2.65
TPTEP1-205ENST00000558085 HECW1Q76N89 1606 aa31.62■■■□□ 2.65
TPTEP1-205ENST00000558085 CCNB3Q8WWL7 1395 aa31.62■■■□□ 2.65
TPTEP1-205ENST00000558085 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa31.57■■■□□ 2.64
TPTEP1-205ENST00000558085 CCDC18Q5T9S5 1454 aa31.56■■■□□ 2.64
TPTEP1-205ENST00000558085 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa31.55■■■□□ 2.64
TPTEP1-205ENST00000558085 OSCARQ8IYS5 282 aa31.49■■■□□ 2.63
TPTEP1-205ENST00000558085 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP31.48■■■□□ 2.63
TPTEP1-205ENST00000558085 CLSPNQ9HAW4 1339 aa31.47■■■□□ 2.63
TPTEP1-205ENST00000558085 PTPRGP23470 1445 aa31.46■■■□□ 2.63
TPTEP1-205ENST00000558085 ERCC6L2Q5T890 1561 aa31.45■■■□□ 2.63
TPTEP1-205ENST00000558085 ABCA8O94911 1581 aa31.45■■■□□ 2.62
TPTEP1-205ENST00000558085 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP31.45■■■□□ 2.62
TPTEP1-205ENST00000558085 PLB1Q6P1J6 1458 aa31.44■■■□□ 2.62
TPTEP1-205ENST00000558085 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP31.42■■■□□ 2.626e-7■□□□□ 10.7
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TPTEP1-205ENST00000558085 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP31.37■■■□□ 2.61
TPTEP1-205ENST00000558085 MTUS2Q5JR59 1369 aa31.36■■■□□ 2.61
TPTEP1-205ENST00000558085 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa31.36■■■□□ 2.61
TPTEP1-205ENST00000558085 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa31.3■■■□□ 2.6
TPTEP1-205ENST00000558085 UACAQ9BZF9 1416 aa31.29■■■□□ 2.6
TPTEP1-205ENST00000558085 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP31.26■■■□□ 2.59
TPTEP1-205ENST00000558085 ARID3CA6NKF2 412 aa31.25■■■□□ 2.59
TPTEP1-205ENST00000558085 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP31.23■■■□□ 2.59
TPTEP1-205ENST00000558085 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP31.23■■■□□ 2.59
TPTEP1-205ENST00000558085 ABCC2Q92887 1545 aa31.21■■■□□ 2.59
TPTEP1-205ENST00000558085 ATP10BO94823 1461 aa31.2■■■□□ 2.59
TPTEP1-205ENST00000558085 NCOA2Q15596 1464 aa31.2■■■□□ 2.58
TPTEP1-205ENST00000558085 ARHGEF11O15085 1522 aa31.18■■■□□ 2.58
TPTEP1-205ENST00000558085 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa31.18■■■□□ 2.58
TPTEP1-205ENST00000558085 FGD6Q6ZV73 1430 aa31.18■■■□□ 2.58
TPTEP1-205ENST00000558085 SETD5Q9C0A6 1442 aa31.15■■■□□ 2.58
TPTEP1-205ENST00000558085 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP31.14■■■□□ 2.57
TPTEP1-205ENST00000558085 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP31.13■■■□□ 2.57
TPTEP1-205ENST00000558085 MYOM3Q5VTT5 1437 aa31.12■■■□□ 2.57
TPTEP1-205ENST00000558085 ADCY10Q96PN6 1610 aa31.08■■■□□ 2.57
TPTEP1-205ENST00000558085 ITGAEP38570 1179 aa31.07■■■□□ 2.56
TPTEP1-205ENST00000558085 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa31.07■■■□□ 2.56
TPTEP1-205ENST00000558085 PLEKHD1A6NEE1 506 aa31.05■■■□□ 2.56
TPTEP1-205ENST00000558085 KDM5BQ9UGL1 1544 aa31.03■■■□□ 2.56
TPTEP1-205ENST00000558085 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP30.99■■■□□ 2.55
TPTEP1-205ENST00000558085 KIF14Q15058 1648 aa30.97■■■□□ 2.55
TPTEP1-205ENST00000558085 MIA2Q96PC5 1412 aa30.96■■■□□ 2.55
TPTEP1-205ENST00000558085 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP30.96■■■□□ 2.55
TPTEP1-205ENST00000558085 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP30.96■■■□□ 2.55
TPTEP1-205ENST00000558085 PTPN23Q9H3S7 1636 aa30.93■■■□□ 2.54
TPTEP1-205ENST00000558085 ITSN2Q9NZM3 1697 aa30.89■■■□□ 2.54
TPTEP1-205ENST00000558085 ABCC10Q5T3U5 1492 aa30.88■■■□□ 2.53
TPTEP1-205ENST00000558085 HFM1A2PYH4 1435 aa30.87■■■□□ 2.53
TPTEP1-205ENST00000558085 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa30.84■■■□□ 2.53
TPTEP1-205ENST00000558085 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.84■■■□□ 2.53
TPTEP1-205ENST00000558085 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.84■■■□□ 2.53
TPTEP1-205ENST00000558085 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP30.84■■■□□ 2.53
TPTEP1-205ENST00000558085 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP30.81■■■□□ 2.52
TPTEP1-205ENST00000558085 AKNAQ7Z591 1439 aa30.8■■■□□ 2.52
TPTEP1-205ENST00000558085 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP30.8■■■□□ 2.52
TPTEP1-205ENST00000558085 MAPKBP1O60336 1514 aa30.79■■■□□ 2.52
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