RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557495.5

ZNF410-222, Transcript of zinc finger protein 410, human

TSL 4

Gene ZNF410, Length 587 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF410-222	ENST00000557495	ARAP1	Q96P48	1450 aa		14.27	□□□□□ -0.12
ZNF410-222	ENST00000557495	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		14.26	□□□□□ -0.13
ZNF410-222	ENST00000557495	SHROOM2	Q13796	1616 aa		14.24	□□□□□ -0.13
ZNF410-222	ENST00000557495	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		14.23	□□□□□ -0.13
ZNF410-222	ENST00000557495	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		14.23	□□□□□ -0.13
ZNF410-222	ENST00000557495	JPH4	Q96JJ6	628 aa		14.15	□□□□□ -0.14
ZNF410-222	ENST00000557495	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		14.15	□□□□□ -0.14
ZNF410-222	ENST00000557495	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		14.14	□□□□□ -0.15
ZNF410-222	ENST00000557495	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	14.14	□□□□□ -0.15
ZNF410-222	ENST00000557495	PRX	Q9BXM0	1461 aa		14.1	□□□□□ -0.15
ZNF410-222	ENST00000557495	IQGAP2	Q13576	1575 aa		14.09	□□□□□ -0.15
ZNF410-222	ENST00000557495	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		14.07	□□□□□ -0.16
ZNF410-222	ENST00000557495	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	14.06	□□□□□ -0.16
ZNF410-222	ENST00000557495	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		14.06	□□□□□ -0.16
ZNF410-222	ENST00000557495	EEA1	Q15075	1411 aa		14.02	□□□□□ -0.16
ZNF410-222	ENST00000557495	DISP1	Q96F81	1524 aa		14.01	□□□□□ -0.17
ZNF410-222	ENST00000557495	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		14	□□□□□ -0.17
ZNF410-222	ENST00000557495	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		13.98	□□□□□ -0.17
ZNF410-222	ENST00000557495	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
ZNF410-222	ENST00000557495	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		13.97	□□□□□ -0.17
ZNF410-222	ENST00000557495	KIAA0556	O60303	1618 aa		13.97	□□□□□ -0.17
ZNF410-222	ENST00000557495	KIF21B	O75037	1637 aa		13.96	□□□□□ -0.17
ZNF410-222	ENST00000557495	PTPRG	P23470	1445 aa		13.95	□□□□□ -0.18
ZNF410-222	ENST00000557495	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		13.95	□□□□□ -0.18
ZNF410-222	ENST00000557495	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
ZNF410-222	ENST00000557495	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ZNF410-222	ENST00000557495	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ZNF410-222	ENST00000557495	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ZNF410-222	ENST00000557495	GOLGA3	Q08378	1498 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ZNF410-222	ENST00000557495	SAMD9	Q5K651	1589 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ZNF410-222	ENST00000557495	P3H3	Q8IVL6	736 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ZNF410-222	ENST00000557495	UACA	Q9BZF9	1416 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ZNF410-222	ENST00000557495	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
ZNF410-222	ENST00000557495	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ZNF410-222	ENST00000557495	ABCC2	Q92887	1545 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ZNF410-222	ENST00000557495	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ZNF410-222	ENST00000557495	MAPKBP1	O60336	1514 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ZNF410-222	ENST00000557495	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	13.83	□□□□□ -0.2
ZNF410-222	ENST00000557495	ABCA8	O94911	1581 aa		13.82	□□□□□ -0.2
ZNF410-222	ENST00000557495	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
ZNF410-222	ENST00000557495	MSH5	O43196	834 aa		13.81	□□□□□ -0.2
ZNF410-222	ENST00000557495	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
ZNF410-222	ENST00000557495	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ZNF410-222	ENST00000557495	DIP2B	Q9P265	1576 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ZNF410-222	ENST00000557495	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ZNF410-222	ENST00000557495	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ZNF410-222	ENST00000557495	ASXL2	Q76L83	1435 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ZNF410-222	ENST00000557495	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ZNF410-222	ENST00000557495	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ZNF410-222	ENST00000557495	TSPOAP1	O95153	1857 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ZNF410-222	ENST00000557495	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ZNF410-222	ENST00000557495	ARID3C	A6NKF2	412 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ZNF410-222	ENST00000557495	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ZNF410-222	ENST00000557495	PIAS4	Q8N2W9	510 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
ZNF410-222	ENST00000557495	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ZNF410-222	ENST00000557495	ATP10B	O94823	1461 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ZNF410-222	ENST00000557495	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
ZNF410-222	ENST00000557495	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
ZNF410-222	ENST00000557495	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ZNF410-222	ENST00000557495	GLI2	P10070	1586 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ZNF410-222	ENST00000557495	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
ZNF410-222	ENST00000557495	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ZNF410-222	ENST00000557495	ADRA2B	P18089	450 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ZNF410-222	ENST00000557495	POTED	Q86YR6	584 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ZNF410-222	ENST00000557495	KCNH8	Q96L42	1107 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ZNF410-222	ENST00000557495	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ZNF410-222	ENST00000557495	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
ZNF410-222	ENST00000557495	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ZNF410-222	ENST00000557495	FMN1	Q68DA7	1419 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ZNF410-222	ENST00000557495	CLIP1	P30622	1438 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ZNF410-222	ENST00000557495	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ZNF410-222	ENST00000557495	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
ZNF410-222	ENST00000557495	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
ZNF410-222	ENST00000557495	HECW1	Q76N89	1606 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ZNF410-222	ENST00000557495	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
ZNF410-222	ENST00000557495	KDM6B	O15054	1643 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ZNF410-222	ENST00000557495	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
ZNF410-222	ENST00000557495	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ZNF410-222	ENST00000557495	CD109	Q6YHK3	1445 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ZNF410-222	ENST00000557495	CEP162	Q5TB80	1403 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ZNF410-222	ENST00000557495	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
ZNF410-222	ENST00000557495	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ZNF410-222	ENST00000557495	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ZNF410-222	ENST00000557495	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ZNF410-222	ENST00000557495	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ZNF410-222	ENST00000557495	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ZNF410-222	ENST00000557495	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	13.5	□□□□□ -0.25
ZNF410-222	ENST00000557495	KIF14	Q15058	1648 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ZNF410-222	ENST00000557495	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		13.48	□□□□□ -0.25
ZNF410-222	ENST00000557495	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		13.45	□□□□□ -0.26
ZNF410-222	ENST00000557495	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
ZNF410-222	ENST00000557495	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ZNF410-222	ENST00000557495	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
ZNF410-222	ENST00000557495	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ZNF410-222	ENST00000557495	NEO1	Q92859	1461 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ZNF410-222	ENST00000557495	FANCA	O15360	1455 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ZNF410-222	ENST00000557495	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ZNF410-222	ENST00000557495	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ZNF410-222	ENST00000557495	PLCH2	O75038	1416 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ZNF410-222	ENST00000557495	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		13.38	□□□□□ -0.27

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