RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556247.1

LRP1-210, Transcript of LDL receptor related protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene LRP1, Length 611 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Exosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1-210ENST00000556247 GRIN2AQ12879 1464 aa27.2■■□□□ 1.95
LRP1-210ENST00000556247 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.2■■□□□ 1.94
LRP1-210ENST00000556247 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa27.05■■□□□ 1.92
LRP1-210ENST00000556247 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa27.04■■□□□ 1.92
LRP1-210ENST00000556247 IQGAP2Q13576 1575 aa27.03■■□□□ 1.92
LRP1-210ENST00000556247 NUP160Q12769 1436 aa27.02■■□□□ 1.92
LRP1-210ENST00000556247 CHD1O14646 1710 aa27.02■■□□□ 1.92
LRP1-210ENST00000556247 CEP170Q5SW79 1584 aa27.01■■□□□ 1.92
LRP1-210ENST00000556247 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.99■■□□□ 1.91
LRP1-210ENST00000556247 ARAP1Q96P48 1450 aa26.98■■□□□ 1.91
LRP1-210ENST00000556247 P3H3Q8IVL6 736 aa26.96■■□□□ 1.91
LRP1-210ENST00000556247 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.95■■□□□ 1.9
LRP1-210ENST00000556247 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.9■■□□□ 1.9
LRP1-210ENST00000556247 SAMD9Q5K651 1589 aa26.89■■□□□ 1.9
LRP1-210ENST00000556247 JPH4Q96JJ6 628 aa26.87■■□□□ 1.89
LRP1-210ENST00000556247 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.86■■□□□ 1.89
LRP1-210ENST00000556247 APLP2Q06481 763 aa26.79■■□□□ 1.88
LRP1-210ENST00000556247 FMN1Q68DA7 1419 aa26.77■■□□□ 1.88
LRP1-210ENST00000556247 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.77■■□□□ 1.88
LRP1-210ENST00000556247 DISP1Q96F81 1524 aa26.76■■□□□ 1.87
LRP1-210ENST00000556247 KIAA0556O60303 1618 aa26.75■■□□□ 1.87
LRP1-210ENST00000556247 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.71■■□□□ 1.87
LRP1-210ENST00000556247 OSCARQ8IYS5 282 aa26.7■■□□□ 1.86
LRP1-210ENST00000556247 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
LRP1-210ENST00000556247 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
LRP1-210ENST00000556247 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
LRP1-210ENST00000556247 SHROOM2Q13796 1616 aa26.66■■□□□ 1.86
LRP1-210ENST00000556247 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.65■■□□□ 1.86
LRP1-210ENST00000556247 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
LRP1-210ENST00000556247 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
LRP1-210ENST00000556247 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.63■■□□□ 1.85
LRP1-210ENST00000556247 MAP3K1Q13233 1512 aa26.54■■□□□ 1.84
LRP1-210ENST00000556247 PTPRGP23470 1445 aa26.52■■□□□ 1.84
LRP1-210ENST00000556247 HECW1Q76N89 1606 aa26.5■■□□□ 1.83
LRP1-210ENST00000556247 TIAM1Q13009 1591 aa26.5■■□□□ 1.83
LRP1-210ENST00000556247 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.48■■□□□ 1.83
LRP1-210ENST00000556247 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa26.47■■□□□ 1.83
LRP1-210ENST00000556247 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
LRP1-210ENST00000556247 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
LRP1-210ENST00000556247 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.44■■□□□ 1.82
LRP1-210ENST00000556247 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.43■■□□□ 1.82
LRP1-210ENST00000556247 PLB1Q6P1J6 1458 aa26.42■■□□□ 1.82
LRP1-210ENST00000556247 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
LRP1-210ENST00000556247 ABCA8O94911 1581 aa26.39■■□□□ 1.82
LRP1-210ENST00000556247 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.39■■□□□ 1.82
LRP1-210ENST00000556247 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.39■■□□□ 1.81
LRP1-210ENST00000556247 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
LRP1-210ENST00000556247 ARID3CA6NKF2 412 aa26.36■■□□□ 1.81
LRP1-210ENST00000556247 UACAQ9BZF9 1416 aa26.35■■□□□ 1.81
LRP1-210ENST00000556247 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
LRP1-210ENST00000556247 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
LRP1-210ENST00000556247 PCGF6Q9BYE7 350 aa26.34■■□□□ 1.81
LRP1-210ENST00000556247 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.33■■□□□ 1.81
LRP1-210ENST00000556247 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
LRP1-210ENST00000556247 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
LRP1-210ENST00000556247 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.24■■□□□ 1.79
LRP1-210ENST00000556247 ABCC2Q92887 1545 aa26.24■■□□□ 1.79
LRP1-210ENST00000556247 ATP10BO94823 1461 aa26.23■■□□□ 1.79
LRP1-210ENST00000556247 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa26.21■■□□□ 1.79
LRP1-210ENST00000556247 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.19■■□□□ 1.78
LRP1-210ENST00000556247 PLEKHD1A6NEE1 506 aa26.18■■□□□ 1.78
LRP1-210ENST00000556247 ARHGEF11O15085 1522 aa26.17■■□□□ 1.78
LRP1-210ENST00000556247 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
LRP1-210ENST00000556247 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.77
LRP1-210ENST00000556247 NCOA2Q15596 1464 aa26.12■■□□□ 1.77
LRP1-210ENST00000556247 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.12■■□□□ 1.77
LRP1-210ENST00000556247 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.09■■□□□ 1.77
LRP1-210ENST00000556247 ADCY10Q96PN6 1610 aa26.08■■□□□ 1.77
LRP1-210ENST00000556247 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
LRP1-210ENST00000556247 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.06■■□□□ 1.76
LRP1-210ENST00000556247 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.06■■□□□ 1.76
LRP1-210ENST00000556247 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.06■■□□□ 1.76
LRP1-210ENST00000556247 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
LRP1-210ENST00000556247 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26.05■■□□□ 1.76
LRP1-210ENST00000556247 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP26.03■■□□□ 1.76
LRP1-210ENST00000556247 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.01■■□□□ 1.75
LRP1-210ENST00000556247 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.99■■□□□ 1.75
LRP1-210ENST00000556247 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.97■■□□□ 1.75
LRP1-210ENST00000556247 KIF14Q15058 1648 aa25.97■■□□□ 1.75
LRP1-210ENST00000556247 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
LRP1-210ENST00000556247 KCNH8Q96L42 1107 aa25.92■■□□□ 1.74
LRP1-210ENST00000556247 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.91■■□□□ 1.74
LRP1-210ENST00000556247 MIA2Q96PC5 1412 aa25.9■■□□□ 1.74
LRP1-210ENST00000556247 ABCC10Q5T3U5 1492 aa25.89■■□□□ 1.73
LRP1-210ENST00000556247 WDR7Q9Y4E6 1490 aa25.86■■□□□ 1.73
LRP1-210ENST00000556247 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.86■■□□□ 1.73
LRP1-210ENST00000556247 ITGAEP38570 1179 aa25.86■■□□□ 1.73
LRP1-210ENST00000556247 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
LRP1-210ENST00000556247 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
LRP1-210ENST00000556247 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.86■■□□□ 1.73
LRP1-210ENST00000556247 ASXL2Q76L83 1435 aa25.85■■□□□ 1.73
LRP1-210ENST00000556247 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
LRP1-210ENST00000556247 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP25.81■■□□□ 1.72
LRP1-210ENST00000556247 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.79■■□□□ 1.72
LRP1-210ENST00000556247 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
LRP1-210ENST00000556247 TTC37Q6PGP7 1564 aa25.76■■□□□ 1.71
LRP1-210ENST00000556247 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
LRP1-210ENST00000556247 PREX2Q70Z35 1606 aa25.72■■□□□ 1.71
LRP1-210ENST00000556247 MYO5CQ9NQX4 1742 aa25.71■■□□□ 1.71
LRP1-210ENST00000556247 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.71■■□□□ 1.71
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