RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550376.5

PRDM4-205, Transcript of PR/SET domain 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRDM4, Length 2,591 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4-205ENST00000550376 CUL7Q14999 1698 aa31.91■■■□□ 2.7
PRDM4-205ENST00000550376 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP31.9■■■□□ 2.7
PRDM4-205ENST00000550376 FHOD3Q2V2M9 1422 aa31.85■■■□□ 2.69
PRDM4-205ENST00000550376 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP31.85■■■□□ 2.69
PRDM4-205ENST00000550376 WDR62O43379 1518 aa31.76■■■□□ 2.68
PRDM4-205ENST00000550376 IFT140Q96RY7 1462 aa31.7■■■□□ 2.66
PRDM4-205ENST00000550376 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa31.7■■■□□ 2.66
PRDM4-205ENST00000550376 PBRM1Q86U86 1689 aa31.67■■■□□ 2.66
PRDM4-205ENST00000550376 GRIN2BQ13224 1484 aa31.65■■■□□ 2.66
PRDM4-205ENST00000550376 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.65■■■□□ 2.66
PRDM4-205ENST00000550376 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP31.61■■■□□ 2.65
PRDM4-205ENST00000550376 ITGAEP38570 1179 aa31.6■■■□□ 2.65
PRDM4-205ENST00000550376 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.58■■■□□ 2.65
PRDM4-205ENST00000550376 TIAM1Q13009 1591 aa31.58■■■□□ 2.65
PRDM4-205ENST00000550376 EFCAB5A4FU69 1503 aa31.57■■■□□ 2.64
PRDM4-205ENST00000550376 ADAMTS12P58397 1594 aa31.55■■■□□ 2.64
PRDM4-205ENST00000550376 FBLN2P98095 1184 aa31.53■■■□□ 2.64
PRDM4-205ENST00000550376 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa31.52■■■□□ 2.64
PRDM4-205ENST00000550376 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa31.51■■■□□ 2.64
PRDM4-205ENST00000550376 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31.49■■■□□ 2.63
PRDM4-205ENST00000550376 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa31.48■■■□□ 2.63
PRDM4-205ENST00000550376 CCNB3Q8WWL7 1395 aa31.46■■■□□ 2.63
PRDM4-205ENST00000550376 FMN1Q68DA7 1419 aa31.45■■■□□ 2.63
PRDM4-205ENST00000550376 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP31.45■■■□□ 2.63
PRDM4-205ENST00000550376 PHLDB1Q86UU1 1377 aa31.44■■■□□ 2.62
PRDM4-205ENST00000550376 SAMD9Q5K651 1589 aa31.43■■■□□ 2.62
PRDM4-205ENST00000550376 FYCO1Q9BQS8 1478 aa31.43■■■□□ 2.62
PRDM4-205ENST00000550376 MAP3K1Q13233 1512 aa31.42■■■□□ 2.62
PRDM4-205ENST00000550376 ARID3CA6NKF2 412 aa31.42■■■□□ 2.62
PRDM4-205ENST00000550376 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP31.42■■■□□ 2.62
PRDM4-205ENST00000550376 IQGAP2Q13576 1575 aa31.37■■■□□ 2.61
PRDM4-205ENST00000550376 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP31.37■■■□□ 2.61
PRDM4-205ENST00000550376 GRIN2AQ12879 1464 aa31.32■■■□□ 2.6
PRDM4-205ENST00000550376 CFAP43Q8NDM7 1665 aa31.32■■■□□ 2.6
PRDM4-205ENST00000550376 MTUS2Q5JR59 1369 aa31.26■■■□□ 2.6
PRDM4-205ENST00000550376 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa31.23■■■□□ 2.59
PRDM4-205ENST00000550376 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa31.23■■■□□ 2.59
PRDM4-205ENST00000550376 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP31.21■■■□□ 2.59
PRDM4-205ENST00000550376 SYNJ2O15056 1496 aa31.19■■■□□ 2.58
PRDM4-205ENST00000550376 UGGT2Q9NYU1 1516 aa31.16■■■□□ 2.58
PRDM4-205ENST00000550376 DISP1Q96F81 1524 aa31.15■■■□□ 2.58
PRDM4-205ENST00000550376 CEP170Q5SW79 1584 aa31.14■■■□□ 2.58
PRDM4-205ENST00000550376 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP31.12■■■□□ 2.57
PRDM4-205ENST00000550376 JPH4Q96JJ6 628 aa31.09■■■□□ 2.57
PRDM4-205ENST00000550376 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP31.08■■■□□ 2.57
PRDM4-205ENST00000550376 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa31.08■■■□□ 2.57
PRDM4-205ENST00000550376 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa31.05■■■□□ 2.56
PRDM4-205ENST00000550376 NCOA2Q15596 1464 aa31.04■■■□□ 2.56
PRDM4-205ENST00000550376 KIAA0556O60303 1618 aa31.04■■■□□ 2.56
PRDM4-205ENST00000550376 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP31.04■■■□□ 2.56
PRDM4-205ENST00000550376 FGD6Q6ZV73 1430 aa31.02■■■□□ 2.56
PRDM4-205ENST00000550376 NUP160Q12769 1436 aa30.98■■■□□ 2.55
PRDM4-205ENST00000550376 HECW1Q76N89 1606 aa30.98■■■□□ 2.55
PRDM4-205ENST00000550376 CCDC18Q5T9S5 1454 aa30.96■■■□□ 2.55
PRDM4-205ENST00000550376 SETD5Q9C0A6 1442 aa30.94■■■□□ 2.54
PRDM4-205ENST00000550376 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa30.92■■■□□ 2.54
PRDM4-205ENST00000550376 MYOM3Q5VTT5 1437 aa30.91■■■□□ 2.54
PRDM4-205ENST00000550376 PLB1Q6P1J6 1458 aa30.91■■■□□ 2.54
PRDM4-205ENST00000550376 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP30.89■■■□□ 2.54
PRDM4-205ENST00000550376 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP30.88■■■□□ 2.53
PRDM4-205ENST00000550376 PTPRKQ15262 1439 aa30.88■■■□□ 2.53
PRDM4-205ENST00000550376 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa30.84■■■□□ 2.53
PRDM4-205ENST00000550376 CHIC2Q9UKJ5 165 aa30.83■■■□□ 2.53
PRDM4-205ENST00000550376 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP30.82■■■□□ 2.525e-6■■■■■ 46.2
PRDM4-205ENST00000550376 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa30.81■■■□□ 2.52
PRDM4-205ENST00000550376 CLSPNQ9HAW4 1339 aa30.79■■■□□ 2.52
PRDM4-205ENST00000550376 ARHGEF11O15085 1522 aa30.79■■■□□ 2.52
PRDM4-205ENST00000550376 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP30.77■■■□□ 2.52
PRDM4-205ENST00000550376 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP30.75■■■□□ 2.51
PRDM4-205ENST00000550376 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP30.74■■■□□ 2.51
PRDM4-205ENST00000550376 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa30.74■■■□□ 2.51
PRDM4-205ENST00000550376 PTPN23Q9H3S7 1636 aa30.73■■■□□ 2.51
PRDM4-205ENST00000550376 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP30.73■■■□□ 2.51
PRDM4-205ENST00000550376 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP30.72■■■□□ 2.51
PRDM4-205ENST00000550376 SIN3AQ96ST3 1273 aa30.71■■■□□ 2.51
PRDM4-205ENST00000550376 CHD1O14646 1710 aa30.71■■■□□ 2.51
PRDM4-205ENST00000550376 NEUROD1Q13562 356 aa30.69■■■□□ 2.5
PRDM4-205ENST00000550376 MAPKBP1O60336 1514 aa30.68■■■□□ 2.5
PRDM4-205ENST00000550376 PTPRGP23470 1445 aa30.62■■■□□ 2.49
PRDM4-205ENST00000550376 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP30.6■■■□□ 2.49
PRDM4-205ENST00000550376 NAIPQ13075 1403 aa30.6■■■□□ 2.49
PRDM4-205ENST00000550376 HFM1A2PYH4 1435 aa30.59■■■□□ 2.49
PRDM4-205ENST00000550376 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP30.58■■■□□ 2.49
PRDM4-205ENST00000550376 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP30.57■■■□□ 2.48
PRDM4-205ENST00000550376 PLEKHD1A6NEE1 506 aa30.56■■■□□ 2.48
PRDM4-205ENST00000550376 MIA2Q96PC5 1412 aa30.56■■■□□ 2.48
PRDM4-205ENST00000550376 ATP10BO94823 1461 aa30.55■■■□□ 2.48
PRDM4-205ENST00000550376 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP30.54■■■□□ 2.48
PRDM4-205ENST00000550376 ABCA8O94911 1581 aa30.53■■■□□ 2.48
PRDM4-205ENST00000550376 ERCC6L2Q5T890 1561 aa30.53■■■□□ 2.48
PRDM4-205ENST00000550376 KIF14Q15058 1648 aa30.51■■■□□ 2.47
PRDM4-205ENST00000550376 TRIM52Q96A61 297 aa30.47■■■□□ 2.47
PRDM4-205ENST00000550376 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP30.44■■■□□ 2.46
PRDM4-205ENST00000550376 ABCC5O15440 1437 aa30.42■■■□□ 2.46
PRDM4-205ENST00000550376 DAPK1P53355 1430 aa30.41■■■□□ 2.46
PRDM4-205ENST00000550376 KDM6BO15054 1643 aa30.4■■■□□ 2.46
PRDM4-205ENST00000550376 UACAQ9BZF9 1416 aa30.4■■■□□ 2.46
PRDM4-205ENST00000550376 SHROOM2Q13796 1616 aa30.35■■■□□ 2.45
PRDM4-205ENST00000550376 FOXD1Q16676 465 aa30.34■■■□□ 2.45
PRDM4-205ENST00000550376 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa30.34■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms