RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549940.5

GNPTAB-206, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 1,678 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-206ENST00000549940 FBLN2P98095 1184 aa43.97■■■■■ 4.63
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GNPTAB-206ENST00000549940 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa43.7■■■■■ 4.59
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GNPTAB-206ENST00000549940 NUP160Q12769 1436 aa43.66■■■■■ 4.58
GNPTAB-206ENST00000549940 CEP170Q5SW79 1584 aa43.65■■■■■ 4.58
GNPTAB-206ENST00000549940 EFCAB5A4FU69 1503 aa43.64■■■■■ 4.58
GNPTAB-206ENST00000549940 CHD1O14646 1710 aa43.64■■■■■ 4.58
GNPTAB-206ENST00000549940 ARAP1Q96P48 1450 aa43.61■■■■■ 4.57
GNPTAB-206ENST00000549940 VPS8Q8N3P4 1428 aa43.59■■■■■ 4.57
GNPTAB-206ENST00000549940 P3H3Q8IVL6 736 aa43.53■■■■■ 4.56
GNPTAB-206ENST00000549940 SAMD9Q5K651 1589 aa43.48■■■■■ 4.55
GNPTAB-206ENST00000549940 UGGT2Q9NYU1 1516 aa43.48■■■■■ 4.55
GNPTAB-206ENST00000549940 FHOD3Q2V2M9 1422 aa43.42■■■■■ 4.54
GNPTAB-206ENST00000549940 JPH4Q96JJ6 628 aa43.37■■■■■ 4.53
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GNPTAB-206ENST00000549940 FMN1Q68DA7 1419 aa43.28■■■■■ 4.52
GNPTAB-206ENST00000549940 DISP1Q96F81 1524 aa43.26■■■■■ 4.52
GNPTAB-206ENST00000549940 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa43.24■■■■■ 4.51
GNPTAB-206ENST00000549940 KIAA0556O60303 1618 aa43.24■■■■■ 4.51
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GNPTAB-206ENST00000549940 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa43.09■■■■■ 4.49
GNPTAB-206ENST00000549940 SHROOM2Q13796 1616 aa43.09■■■■■ 4.49
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GNPTAB-206ENST00000549940 PTPRGP23470 1445 aa42.83■■■■■ 4.45
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GNPTAB-206ENST00000549940 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa42.77■■■■■ 4.44
GNPTAB-206ENST00000549940 CFAP43Q8NDM7 1665 aa42.77■■■■■ 4.44
GNPTAB-206ENST00000549940 CCDC18Q5T9S5 1454 aa42.74■■■■■ 4.43
GNPTAB-206ENST00000549940 PLB1Q6P1J6 1458 aa42.72■■■■■ 4.43
GNPTAB-206ENST00000549940 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa42.68■■■■■ 4.42
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GNPTAB-206ENST00000549940 PCGF6Q9BYE7 350 aa42.63■■■■■ 4.41
GNPTAB-206ENST00000549940 ARID3CA6NKF2 412 aa42.6■■■■■ 4.41
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GNPTAB-206ENST00000549940 UACAQ9BZF9 1416 aa42.55■■■■■ 4.4
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GNPTAB-206ENST00000549940 NCOA2Q15596 1464 aa42.24■■■■■ 4.35
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GNPTAB-206ENST00000549940 ADCY10Q96PN6 1610 aa42.14■■■■■ 4.34
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GNPTAB-206ENST00000549940 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.08■■■■■ 4.33
GNPTAB-206ENST00000549940 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.08■■■■■ 4.33
GNPTAB-206ENST00000549940 MYOM3Q5VTT5 1437 aa42.06■■■■■ 4.32
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GNPTAB-206ENST00000549940 PTPN23Q9H3S7 1636 aa41.81■■■■■ 4.28
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GNPTAB-206ENST00000549940 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP41.8■■■■■ 4.28
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GNPTAB-206ENST00000549940 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP41.71■■■■■ 4.27
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GNPTAB-206ENST00000549940 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP41.58■■■■■ 4.25
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GNPTAB-206ENST00000549940 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa41.56■■■■■ 4.24
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