RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533817.5

TSTA3-216, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 3

Gene TSTA3, Length 871 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-216ENST00000533817 PRXQ9BXM0 1461 aa24.9■■□□□ 1.58
TSTA3-216ENST00000533817 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.87■■□□□ 1.57
TSTA3-216ENST00000533817 ARAP1Q96P48 1450 aa24.85■■□□□ 1.57
TSTA3-216ENST00000533817 CSRNP3Q8WYN3 585 aa24.85■■□□□ 1.57
TSTA3-216ENST00000533817 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.83■■□□□ 1.57
TSTA3-216ENST00000533817 JPH4Q96JJ6 628 aa24.8■■□□□ 1.56
TSTA3-216ENST00000533817 IQGAP2Q13576 1575 aa24.76■■□□□ 1.55
TSTA3-216ENST00000533817 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
TSTA3-216ENST00000533817 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
TSTA3-216ENST00000533817 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.73■■□□□ 1.55
TSTA3-216ENST00000533817 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.72■■□□□ 1.55
TSTA3-216ENST00000533817 KIF21BO75037 1637 aa24.69■■□□□ 1.54
TSTA3-216ENST00000533817 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.64■■□□□ 1.53
TSTA3-216ENST00000533817 DISP1Q96F81 1524 aa24.6■■□□□ 1.53
TSTA3-216ENST00000533817 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.57■■□□□ 1.52
TSTA3-216ENST00000533817 KIAA0556O60303 1618 aa24.54■■□□□ 1.52
TSTA3-216ENST00000533817 GOLGA3Q08378 1498 aa24.52■■□□□ 1.52
TSTA3-216ENST00000533817 TNIKQ9UKE5 1360 aa24.51■■□□□ 1.51
TSTA3-216ENST00000533817 PTPRGP23470 1445 aa24.46■■□□□ 1.51
TSTA3-216ENST00000533817 SAMD9Q5K651 1589 aa24.42■■□□□ 1.5
TSTA3-216ENST00000533817 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.42■■□□□ 1.5
TSTA3-216ENST00000533817 ADCY10Q96PN6 1610 aa24.42■■□□□ 1.5
TSTA3-216ENST00000533817 UBTFP17480 764 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
TSTA3-216ENST00000533817 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
TSTA3-216ENST00000533817 UACAQ9BZF9 1416 aa24.33■■□□□ 1.49
TSTA3-216ENST00000533817 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa24.32■■□□□ 1.48
TSTA3-216ENST00000533817 EFCAB5A4FU69 1503 aa24.31■■□□□ 1.48
TSTA3-216ENST00000533817 P3H3Q8IVL6 736 aa24.3■■□□□ 1.48
TSTA3-216ENST00000533817 ABCC2Q92887 1545 aa24.3■■□□□ 1.48
TSTA3-216ENST00000533817 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
TSTA3-216ENST00000533817 ABCA8O94911 1581 aa24.27■■□□□ 1.48
TSTA3-216ENST00000533817 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.26■■□□□ 1.47
TSTA3-216ENST00000533817 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.25■■□□□ 1.47
TSTA3-216ENST00000533817 MAPKBP1O60336 1514 aa24.23■■□□□ 1.47
TSTA3-216ENST00000533817 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.21■■□□□ 1.47
TSTA3-216ENST00000533817 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP24.21■■□□□ 1.47
TSTA3-216ENST00000533817 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.2■■□□□ 1.47
TSTA3-216ENST00000533817 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
TSTA3-216ENST00000533817 TRHP20396 242 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
TSTA3-216ENST00000533817 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.15■■□□□ 1.46
TSTA3-216ENST00000533817 KIF13AQ9H1H9 1805 aa24.1■■□□□ 1.45
TSTA3-216ENST00000533817 ABCC10Q5T3U5 1492 aa24.09■■□□□ 1.45
TSTA3-216ENST00000533817 ASXL2Q76L83 1435 aa24.09■■□□□ 1.45
TSTA3-216ENST00000533817 DIP2BQ9P265 1576 aa24.08■■□□□ 1.45
TSTA3-216ENST00000533817 CLIP1P30622 1438 aa24.07■■□□□ 1.44
TSTA3-216ENST00000533817 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.06■■□□□ 1.44
TSTA3-216ENST00000533817 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
TSTA3-216ENST00000533817 FMN1Q68DA7 1419 aa24.05■■□□□ 1.44
TSTA3-216ENST00000533817 ATP10BO94823 1461 aa24.04■■□□□ 1.44
TSTA3-216ENST00000533817 CEP162Q5TB80 1403 aa24■■□□□ 1.43
TSTA3-216ENST00000533817 ARID3CA6NKF2 412 aa23.99■■□□□ 1.43
TSTA3-216ENST00000533817 WDR7Q9Y4E6 1490 aa23.99■■□□□ 1.43
TSTA3-216ENST00000533817 FAM69CQ0P6D2 419 aa23.98■■□□□ 1.43
TSTA3-216ENST00000533817 HECW1Q76N89 1606 aa23.96■■□□□ 1.43
TSTA3-216ENST00000533817 GLI2P10070 1586 aa23.96■■□□□ 1.43
TSTA3-216ENST00000533817 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
TSTA3-216ENST00000533817 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
TSTA3-216ENST00000533817 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
TSTA3-216ENST00000533817 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.9■■□□□ 1.42
TSTA3-216ENST00000533817 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.88■■□□□ 1.41
TSTA3-216ENST00000533817 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa23.87■■□□□ 1.41
TSTA3-216ENST00000533817 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
TSTA3-216ENST00000533817 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
TSTA3-216ENST00000533817 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.86■■□□□ 1.41
TSTA3-216ENST00000533817 TSPOAP1O95153 1857 aa23.84■■□□□ 1.41
TSTA3-216ENST00000533817 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
TSTA3-216ENST00000533817 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
TSTA3-216ENST00000533817 KCNH8Q96L42 1107 aa23.82■■□□□ 1.4
TSTA3-216ENST00000533817 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.8■■□□□ 1.4
TSTA3-216ENST00000533817 PLEKHD1A6NEE1 506 aa23.79■■□□□ 1.4
TSTA3-216ENST00000533817 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.79■■□□□ 1.4
TSTA3-216ENST00000533817 ABCA9Q8IUA7 1624 aa23.77■■□□□ 1.4
TSTA3-216ENST00000533817 CD109Q6YHK3 1445 aa23.74■■□□□ 1.39
TSTA3-216ENST00000533817 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23.72■■□□□ 1.39
TSTA3-216ENST00000533817 VPS8Q8N3P4 1428 aa23.71■■□□□ 1.39
TSTA3-216ENST00000533817 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
TSTA3-216ENST00000533817 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
TSTA3-216ENST00000533817 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP23.69■■□□□ 1.38
TSTA3-216ENST00000533817 TEX14Q8IWB6 1497 aa23.69■■□□□ 1.38
TSTA3-216ENST00000533817 TTC37Q6PGP7 1564 aa23.67■■□□□ 1.38
TSTA3-216ENST00000533817 KIF14Q15058 1648 aa23.66■■□□□ 1.38
TSTA3-216ENST00000533817 KDM6BO15054 1643 aa23.64■■□□□ 1.38
TSTA3-216ENST00000533817 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
TSTA3-216ENST00000533817 TIAM1Q13009 1591 aa23.56■■□□□ 1.36
TSTA3-216ENST00000533817 MYO5CQ9NQX4 1742 aa23.55■■□□□ 1.36
TSTA3-216ENST00000533817 NEO1Q92859 1461 aa23.55■■□□□ 1.36
TSTA3-216ENST00000533817 PLCH2O75038 1416 aa23.53■■□□□ 1.36
TSTA3-216ENST00000533817 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.53■■□□□ 1.36
TSTA3-216ENST00000533817 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.52■■□□□ 1.36
TSTA3-216ENST00000533817 ARAP3Q8WWN8 1544 aa23.52■■□□□ 1.36
TSTA3-216ENST00000533817 MAP3K1Q13233 1512 aa23.51■■□□□ 1.35
TSTA3-216ENST00000533817 CFAP74Q9C0B2 1584 aa23.51■■□□□ 1.35
TSTA3-216ENST00000533817 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.51■■□□□ 1.35
TSTA3-216ENST00000533817 FANCAO15360 1455 aa23.5■■□□□ 1.35
TSTA3-216ENST00000533817 PREX2Q70Z35 1606 aa23.48■■□□□ 1.35
TSTA3-216ENST00000533817 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa23.47■■□□□ 1.35
TSTA3-216ENST00000533817 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa23.46■■□□□ 1.35
TSTA3-216ENST00000533817 AKNAQ7Z591 1439 aa23.46■■□□□ 1.35
TSTA3-216ENST00000533817 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.44■■□□□ 1.34
TSTA3-216ENST00000533817 ARHGAP5Q13017 1502 aa23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.1 ms