RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533817.5

TSTA3-216, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 3

Gene TSTA3, Length 871 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-216ENST00000533817 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.01■■■■□ 3.36
TSTA3-216ENST00000533817 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa31.98■■■□□ 2.71
TSTA3-216ENST00000533817 ABCC9O60706 1549 aa31.14■■■□□ 2.57
TSTA3-216ENST00000533817 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
TSTA3-216ENST00000533817 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.02■■■□□ 2.4
TSTA3-216ENST00000533817 NACADO15069 1562 aa30.01■■■□□ 2.39
TSTA3-216ENST00000533817 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.91■■■□□ 2.38
TSTA3-216ENST00000533817 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.9■■■□□ 2.38
TSTA3-216ENST00000533817 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.81■■■□□ 2.36
TSTA3-216ENST00000533817 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.4■■■□□ 2.3
TSTA3-216ENST00000533817 SCRIBQ14160 1630 aa29.17■■■□□ 2.26
TSTA3-216ENST00000533817 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.15■■■□□ 2.26
TSTA3-216ENST00000533817 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.09■■■□□ 2.256e-9■□□□□ 10.6
TSTA3-216ENST00000533817 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.84■■■□□ 2.21
TSTA3-216ENST00000533817 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.48■■■□□ 2.15
TSTA3-216ENST00000533817 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
TSTA3-216ENST00000533817 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.19■■■□□ 2.1
TSTA3-216ENST00000533817 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.04■■■□□ 2.08
TSTA3-216ENST00000533817 SMARCA4P51532 1647 aa27.92■■■□□ 2.06
TSTA3-216ENST00000533817 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
TSTA3-216ENST00000533817 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.77■■■□□ 2.04
TSTA3-216ENST00000533817 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.73■■■□□ 2.03
TSTA3-216ENST00000533817 SMARCA2P51531 1590 aa27.69■■■□□ 2.02
TSTA3-216ENST00000533817 NCAPD3P42695 1498 aa27.69■■■□□ 2.02
TSTA3-216ENST00000533817 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.67■■■□□ 2.02
TSTA3-216ENST00000533817 HMGXB3Q12766 1538 aa27.58■■■□□ 2.01
TSTA3-216ENST00000533817 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
TSTA3-216ENST00000533817 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.48■■□□□ 1.99
TSTA3-216ENST00000533817 WIZO95785 1651 aa27.47■■□□□ 1.99
TSTA3-216ENST00000533817 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
TSTA3-216ENST00000533817 NESP48681 1621 aa27■■□□□ 1.91
TSTA3-216ENST00000533817 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.95■■□□□ 1.9
TSTA3-216ENST00000533817 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.87■■□□□ 1.89
TSTA3-216ENST00000533817 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.85■■□□□ 1.89
TSTA3-216ENST00000533817 ERCC6Q03468 1493 aa26.8■■□□□ 1.88
TSTA3-216ENST00000533817 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
TSTA3-216ENST00000533817 CFTRP13569 1480 aa26.76■■□□□ 1.87
TSTA3-216ENST00000533817 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.73■■□□□ 1.87
TSTA3-216ENST00000533817 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.7■■□□□ 1.87
TSTA3-216ENST00000533817 PRDM2Q13029 1718 aa26.6■■□□□ 1.85
TSTA3-216ENST00000533817 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
TSTA3-216ENST00000533817 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.57■■□□□ 1.84
TSTA3-216ENST00000533817 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.53■■□□□ 1.84
TSTA3-216ENST00000533817 CUX2O14529 1486 aa26.51■■□□□ 1.83
TSTA3-216ENST00000533817 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.48■■□□□ 1.83
TSTA3-216ENST00000533817 WDR62O43379 1518 aa26.4■■□□□ 1.82
TSTA3-216ENST00000533817 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
TSTA3-216ENST00000533817 TOPBP1Q92547 1522 aa26.18■■□□□ 1.78
TSTA3-216ENST00000533817 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.16■■□□□ 1.78
TSTA3-216ENST00000533817 ABCC8Q09428 1581 aa26.15■■□□□ 1.78
TSTA3-216ENST00000533817 CUX1P39880 1505 aa26.04■■□□□ 1.76
TSTA3-216ENST00000533817 IFT140Q96RY7 1462 aa25.98■■□□□ 1.75
TSTA3-216ENST00000533817 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
TSTA3-216ENST00000533817 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.91■■□□□ 1.74
TSTA3-216ENST00000533817 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
TSTA3-216ENST00000533817 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.88■■□□□ 1.73
TSTA3-216ENST00000533817 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
TSTA3-216ENST00000533817 SYNJ1O43426 1573 aa25.86■■□□□ 1.73
TSTA3-216ENST00000533817 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.85■■□□□ 1.73
TSTA3-216ENST00000533817 TOP2BQ02880 1626 aa25.85■■□□□ 1.73
TSTA3-216ENST00000533817 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.84■■□□□ 1.73
TSTA3-216ENST00000533817 SOGA1O94964 1423 aa25.82■■□□□ 1.72
TSTA3-216ENST00000533817 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
TSTA3-216ENST00000533817 WDR97A6NE52 1622 aa25.74■■□□□ 1.71
TSTA3-216ENST00000533817 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.71■■□□□ 1.714e-8■■■■■ 34.1
TSTA3-216ENST00000533817 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.68■■□□□ 1.7
TSTA3-216ENST00000533817 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
TSTA3-216ENST00000533817 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.59■■□□□ 1.69
TSTA3-216ENST00000533817 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.54■■□□□ 1.68
TSTA3-216ENST00000533817 GRIN2BQ13224 1484 aa25.53■■□□□ 1.68
TSTA3-216ENST00000533817 PBRM1Q86U86 1689 aa25.52■■□□□ 1.68
TSTA3-216ENST00000533817 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.52■■□□□ 1.68
TSTA3-216ENST00000533817 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.49■■□□□ 1.67
TSTA3-216ENST00000533817 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
TSTA3-216ENST00000533817 CHD1O14646 1710 aa25.43■■□□□ 1.66
TSTA3-216ENST00000533817 OSCARQ8IYS5 282 aa25.38■■□□□ 1.65
TSTA3-216ENST00000533817 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.37■■□□□ 1.65
TSTA3-216ENST00000533817 SYNJ2O15056 1496 aa25.35■■□□□ 1.65
TSTA3-216ENST00000533817 ADAMTS12P58397 1594 aa25.33■■□□□ 1.65
TSTA3-216ENST00000533817 KIF27Q86VH2 1401 aa25.32■■□□□ 1.64
TSTA3-216ENST00000533817 FBLN2P98095 1184 aa25.31■■□□□ 1.64
TSTA3-216ENST00000533817 TRIM41Q8WV44 630 aa25.29■■□□□ 1.64
TSTA3-216ENST00000533817 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
TSTA3-216ENST00000533817 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.26■■□□□ 1.63
TSTA3-216ENST00000533817 IGF1RP08069 1367 aa25.21■■□□□ 1.63
TSTA3-216ENST00000533817 GRIN2AQ12879 1464 aa25.21■■□□□ 1.63
TSTA3-216ENST00000533817 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.17■■□□□ 1.62
TSTA3-216ENST00000533817 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.17■■□□□ 1.62
TSTA3-216ENST00000533817 CUL7Q14999 1698 aa25.17■■□□□ 1.62
TSTA3-216ENST00000533817 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.11■■□□□ 1.61
TSTA3-216ENST00000533817 NUP160Q12769 1436 aa25.11■■□□□ 1.61
TSTA3-216ENST00000533817 CEP170Q5SW79 1584 aa25.1■■□□□ 1.61
TSTA3-216ENST00000533817 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.05■■□□□ 1.6
TSTA3-216ENST00000533817 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.04■■□□□ 1.6
TSTA3-216ENST00000533817 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.04■■□□□ 1.6
TSTA3-216ENST00000533817 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.04■■□□□ 1.6
TSTA3-216ENST00000533817 ARHGEF11O15085 1522 aa25.03■■□□□ 1.6
TSTA3-216ENST00000533817 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa24.93■■□□□ 1.58
TSTA3-216ENST00000533817 SHROOM2Q13796 1616 aa24.93■■□□□ 1.58
TSTA3-216ENST00000533817 EEA1Q15075 1411 aa24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 384.2 ms