RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529806.5

RPS2-209, Transcript of ribosomal protein S2, human

TSL 3 BASIC

Gene RPS2, Length 993 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS2-209	ENST00000529806	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		44.7	■■■■■ 4.75
RPS2-209	ENST00000529806	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		44.7	■■■■■ 4.75
RPS2-209	ENST00000529806	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	44.62	■■■■■ 4.73
RPS2-209	ENST00000529806	JPH4	Q96JJ6	628 aa		44.6	■■■■■ 4.73
RPS2-209	ENST00000529806	IQGAP2	Q13576	1575 aa		44.58	■■■■■ 4.73
RPS2-209	ENST00000529806	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		44.58	■■■■■ 4.73
RPS2-209	ENST00000529806	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		44.56	■■■■■ 4.72
RPS2-209	ENST00000529806	EEA1	Q15075	1411 aa		44.56	■■■■■ 4.72
RPS2-209	ENST00000529806	PRX	Q9BXM0	1461 aa		44.47	■■■■■ 4.71
RPS2-209	ENST00000529806	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		44.4	■■■■■ 4.7
RPS2-209	ENST00000529806	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		44.32	■■■■■ 4.68
RPS2-209	ENST00000529806	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	44.31	■■■■■ 4.68
RPS2-209	ENST00000529806	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		44.24	■■■■■ 4.67
RPS2-209	ENST00000529806	KIF21B	O75037	1637 aa		44.18	■■■■■ 4.66
RPS2-209	ENST00000529806	KIAA0556	O60303	1618 aa		44.14	■■■■■ 4.66
RPS2-209	ENST00000529806	DISP1	Q96F81	1524 aa		44.12	■■■■■ 4.65
RPS2-209	ENST00000529806	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		44.09	■■■■■ 4.65
RPS2-209	ENST00000529806	GOLGA3	Q08378	1498 aa		44.06	■■■■■ 4.64
RPS2-209	ENST00000529806	PTPRG	P23470	1445 aa		44.06	■■■■■ 4.64
RPS2-209	ENST00000529806	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	44.04	■■■■■ 4.64
RPS2-209	ENST00000529806	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		44.03	■■■■■ 4.64
RPS2-209	ENST00000529806	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	44.01	■■■■■ 4.64
RPS2-209	ENST00000529806	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	43.9	■■■■■ 4.62
RPS2-209	ENST00000529806	SAMD9	Q5K651	1589 aa		43.8	■■■■■ 4.6
RPS2-209	ENST00000529806	UACA	Q9BZF9	1416 aa		43.78	■■■■■ 4.6
RPS2-209	ENST00000529806	ABCC2	Q92887	1545 aa		43.78	■■■■■ 4.6
RPS2-209	ENST00000529806	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		43.77	■■■■■ 4.6
RPS2-209	ENST00000529806	MAPKBP1	O60336	1514 aa		43.75	■■■■■ 4.59
RPS2-209	ENST00000529806	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		43.74	■■■■■ 4.59
RPS2-209	ENST00000529806	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	43.71	■■■■■ 4.59
RPS2-209	ENST00000529806	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		43.7	■■■■■ 4.59
RPS2-209	ENST00000529806	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	43.68	■■■■■ 4.58
RPS2-209	ENST00000529806	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		43.63	■■■■■ 4.58
RPS2-209	ENST00000529806	P3H3	Q8IVL6	736 aa		43.63	■■■■■ 4.57
RPS2-209	ENST00000529806	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	43.6	■■■■■ 4.57
RPS2-209	ENST00000529806	ABCA8	O94911	1581 aa		43.59	■■■■■ 4.57
RPS2-209	ENST00000529806	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		43.59	■■■■■ 4.57
RPS2-209	ENST00000529806	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		43.53	■■■■■ 4.56
RPS2-209	ENST00000529806	DIP2B	Q9P265	1576 aa		43.53	■■■■■ 4.56
RPS2-209	ENST00000529806	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		43.5	■■■■■ 4.55
RPS2-209	ENST00000529806	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		43.47	■■■■■ 4.55
RPS2-209	ENST00000529806	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		43.47	■■■■■ 4.55
RPS2-209	ENST00000529806	ASXL2	Q76L83	1435 aa		43.43	■■■■■ 4.54
RPS2-209	ENST00000529806	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		43.38	■■■■■ 4.53
RPS2-209	ENST00000529806	TSPOAP1	O95153	1857 aa		43.34	■■■■■ 4.53
RPS2-209	ENST00000529806	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		43.26	■■■■■ 4.52
RPS2-209	ENST00000529806	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		43.24	■■■■■ 4.51
RPS2-209	ENST00000529806	GLI2	P10070	1586 aa		43.23	■■■■■ 4.51
RPS2-209	ENST00000529806	ARID3C	A6NKF2	412 aa		43.19	■■■■■ 4.5
RPS2-209	ENST00000529806	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	43.17	■■■■■ 4.5
RPS2-209	ENST00000529806	FMN1	Q68DA7	1419 aa		43.17	■■■■■ 4.5
RPS2-209	ENST00000529806	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	43.15	■■■■■ 4.5
RPS2-209	ENST00000529806	ATP10B	O94823	1461 aa		43.14	■■■■■ 4.5
RPS2-209	ENST00000529806	HECW1	Q76N89	1606 aa		43.11	■■■■■ 4.49
RPS2-209	ENST00000529806	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		43.11	■■■■■ 4.49
RPS2-209	ENST00000529806	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	43.09	■■■■■ 4.49
RPS2-209	ENST00000529806	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	43.09	■■■■■ 4.49
RPS2-209	ENST00000529806	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		43.05	■■■■■ 4.48
RPS2-209	ENST00000529806	CLIP1	P30622	1438 aa		43.04	■■■■■ 4.48
RPS2-209	ENST00000529806	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	43.02	■■■■■ 4.48
RPS2-209	ENST00000529806	KCNH8	Q96L42	1107 aa		42.98	■■■■■ 4.47
RPS2-209	ENST00000529806	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	42.95	■■■■■ 4.47
RPS2-209	ENST00000529806	KDM6B	O15054	1643 aa		42.93	■■■■■ 4.46
RPS2-209	ENST00000529806	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		42.9	■■■■■ 4.46
RPS2-209	ENST00000529806	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	42.9	■■■■■ 4.46
RPS2-209	ENST00000529806	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	42.9	■■■■■ 4.46
RPS2-209	ENST00000529806	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		42.85	■■■■■ 4.45
RPS2-209	ENST00000529806	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		42.85	■■■■■ 4.45
RPS2-209	ENST00000529806	CEP162	Q5TB80	1403 aa		42.82	■■■■■ 4.45
RPS2-209	ENST00000529806	CD109	Q6YHK3	1445 aa		42.81	■■■■■ 4.44
RPS2-209	ENST00000529806	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		42.81	■■■■■ 4.44
RPS2-209	ENST00000529806	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		42.77	■■■■■ 4.44
RPS2-209	ENST00000529806	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		42.74	■■■■■ 4.43
RPS2-209	ENST00000529806	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		42.73	■■■■■ 4.43
RPS2-209	ENST00000529806	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		42.72	■■■■■ 4.43
RPS2-209	ENST00000529806	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		42.71	■■■■■ 4.43
RPS2-209	ENST00000529806	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	42.68	■■■■■ 4.42
RPS2-209	ENST00000529806	KIF14	Q15058	1648 aa		42.6	■■■■■ 4.41
RPS2-209	ENST00000529806	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		42.6	■■■■■ 4.41
RPS2-209	ENST00000529806	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	42.59	■■■■■ 4.41	not detected	■□□□□ 9.1
RPS2-209	ENST00000529806	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		42.53	■■■■■ 4.4
RPS2-209	ENST00000529806	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		42.53	■■■■■ 4.4
RPS2-209	ENST00000529806	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	42.52	■■■■■ 4.4
RPS2-209	ENST00000529806	NEO1	Q92859	1461 aa		42.44	■■■■■ 4.38
RPS2-209	ENST00000529806	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	42.41	■■■■■ 4.38
RPS2-209	ENST00000529806	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		42.4	■■■■■ 4.38
RPS2-209	ENST00000529806	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		42.36	■■■■■ 4.37
RPS2-209	ENST00000529806	FANCA	O15360	1455 aa		42.36	■■■■■ 4.37
RPS2-209	ENST00000529806	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		42.31	■■■■■ 4.36
RPS2-209	ENST00000529806	PLCH2	O75038	1416 aa		42.27	■■■■■ 4.36
RPS2-209	ENST00000529806	PREX2	Q70Z35	1606 aa		42.24	■■■■■ 4.35
RPS2-209	ENST00000529806	AKNA	Q7Z591	1439 aa		42.23	■■■■■ 4.35
RPS2-209	ENST00000529806	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		42.23	■■■■■ 4.35
RPS2-209	ENST00000529806	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		42.23	■■■■■ 4.35
RPS2-209	ENST00000529806	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		42.23	■■■■■ 4.35
RPS2-209	ENST00000529806	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		42.22	■■■■■ 4.35
RPS2-209	ENST00000529806	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		42.21	■■■■■ 4.35
RPS2-209	ENST00000529806	RICTOR	Q6R327	1708 aa		42.18	■■■■■ 4.34
RPS2-209	ENST00000529806	TIAM1	Q13009	1591 aa		42.16	■■■■■ 4.34
RPS2-209	ENST00000529806	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		42.14	■■■■■ 4.34

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