RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527549.5

TSTA3-206, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 2

Gene TSTA3, Length 575 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-206ENST00000527549 FAM69CQ0P6D2 419 aa28.56■■■□□ 2.16
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TSTA3-206ENST00000527549 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.51■■■□□ 2.15
TSTA3-206ENST00000527549 KDM6BO15054 1643 aa28.5■■■□□ 2.15
TSTA3-206ENST00000527549 TOP2BQ02880 1626 aa28.48■■■□□ 2.15
TSTA3-206ENST00000527549 ADCY10Q96PN6 1610 aa28.47■■■□□ 2.15
TSTA3-206ENST00000527549 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.44■■■□□ 2.14
TSTA3-206ENST00000527549 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP28.4■■■□□ 2.14
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TSTA3-206ENST00000527549 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
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TSTA3-206ENST00000527549 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.91
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TSTA3-206ENST00000527549 HSPA2P54652 639 aa26.95■■□□□ 1.9
TSTA3-206ENST00000527549 ILDR2Q71H61 639 aa26.93■■□□□ 1.9
TSTA3-206ENST00000527549 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.92■■□□□ 1.9
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TSTA3-206ENST00000527549 TTC37Q6PGP7 1564 aa26.85■■□□□ 1.89
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TSTA3-206ENST00000527549 P3H3Q8IVL6 736 aa26.73■■□□□ 1.87
TSTA3-206ENST00000527549 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26.73■■□□□ 1.87
TSTA3-206ENST00000527549 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP26.7■■□□□ 1.87
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TSTA3-206ENST00000527549 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa26.68■■□□□ 1.86
TSTA3-206ENST00000527549 DMRT2Q9Y5R5 561 aa26.65■■□□□ 1.86
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