RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527549.5

TSTA3-206, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 2

Gene TSTA3, Length 575 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-206ENST00000527549 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.26■■■■■ 4.04
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TSTA3-206ENST00000527549 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.71■■■■□ 3.31
TSTA3-206ENST00000527549 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.13■■■■□ 3.21
TSTA3-206ENST00000527549 NACADO15069 1562 aa34.74■■■■□ 3.15
TSTA3-206ENST00000527549 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.42■■■■□ 3.1
TSTA3-206ENST00000527549 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.38■■■■□ 3.09
TSTA3-206ENST00000527549 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.22■■■■□ 3.07
TSTA3-206ENST00000527549 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.11■■■■□ 3.05
TSTA3-206ENST00000527549 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.99■■■■□ 3.03
TSTA3-206ENST00000527549 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.75■■■□□ 2.99
TSTA3-206ENST00000527549 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.64■■■□□ 2.98
TSTA3-206ENST00000527549 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.64■■■□□ 2.98
TSTA3-206ENST00000527549 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa33.45■■■□□ 2.95
TSTA3-206ENST00000527549 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.38■■■□□ 2.93
TSTA3-206ENST00000527549 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.33■■■□□ 2.93
TSTA3-206ENST00000527549 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.21■■■□□ 2.91
TSTA3-206ENST00000527549 SCRIBQ14160 1630 aa33.07■■■□□ 2.88
TSTA3-206ENST00000527549 CUX2O14529 1486 aa32.54■■■□□ 2.8
TSTA3-206ENST00000527549 ERCC6Q03468 1493 aa32.13■■■□□ 2.73
TSTA3-206ENST00000527549 NCAPD3P42695 1498 aa32.1■■■□□ 2.73
TSTA3-206ENST00000527549 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.83■■■□□ 2.69
TSTA3-206ENST00000527549 HMGXB3Q12766 1538 aa31.78■■■□□ 2.68
TSTA3-206ENST00000527549 NESP48681 1621 aa31.74■■■□□ 2.67
TSTA3-206ENST00000527549 SMARCA2P51531 1590 aa31.69■■■□□ 2.66
TSTA3-206ENST00000527549 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.68■■■□□ 2.66
TSTA3-206ENST00000527549 SMARCA4P51532 1647 aa31.57■■■□□ 2.64
TSTA3-206ENST00000527549 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.47■■■□□ 2.63
TSTA3-206ENST00000527549 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.4■■■□□ 2.62
TSTA3-206ENST00000527549 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.4■■■□□ 2.62
TSTA3-206ENST00000527549 TRIM41Q8WV44 630 aa31.37■■■□□ 2.61
TSTA3-206ENST00000527549 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.33■■■□□ 2.61
TSTA3-206ENST00000527549 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.29■■■□□ 2.6
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TSTA3-206ENST00000527549 WDR62O43379 1518 aa31.07■■■□□ 2.56
TSTA3-206ENST00000527549 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.05■■■□□ 2.56
TSTA3-206ENST00000527549 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.01■■■□□ 2.55
TSTA3-206ENST00000527549 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.97■■■□□ 2.55
TSTA3-206ENST00000527549 OSCARQ8IYS5 282 aa30.8■■■□□ 2.52
TSTA3-206ENST00000527549 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.73■■■□□ 2.51
TSTA3-206ENST00000527549 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.63■■■□□ 2.49
TSTA3-206ENST00000527549 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa30.55■■■□□ 2.48
TSTA3-206ENST00000527549 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.55■■■□□ 2.48
TSTA3-206ENST00000527549 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.55■■■□□ 2.48
TSTA3-206ENST00000527549 WIZO95785 1651 aa30.53■■■□□ 2.48
TSTA3-206ENST00000527549 CFTRP13569 1480 aa30.53■■■□□ 2.48
TSTA3-206ENST00000527549 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.47■■■□□ 2.47
TSTA3-206ENST00000527549 ARHGEF11O15085 1522 aa30.37■■■□□ 2.45
TSTA3-206ENST00000527549 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.19■■■□□ 2.42
TSTA3-206ENST00000527549 IFT140Q96RY7 1462 aa30.19■■■□□ 2.42
TSTA3-206ENST00000527549 PRDM2Q13029 1718 aa30.16■■■□□ 2.42
TSTA3-206ENST00000527549 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.13■■■□□ 2.41
TSTA3-206ENST00000527549 CYB5RLQ6IPT4 315 aa30.06■■■□□ 2.4
TSTA3-206ENST00000527549 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
TSTA3-206ENST00000527549 ARAP1Q96P48 1450 aa30.02■■■□□ 2.4
TSTA3-206ENST00000527549 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
TSTA3-206ENST00000527549 TOPBP1Q92547 1522 aa29.98■■■□□ 2.39
TSTA3-206ENST00000527549 CHD1O14646 1710 aa29.93■■■□□ 2.38
TSTA3-206ENST00000527549 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.9■■■□□ 2.38
TSTA3-206ENST00000527549 ABCC8Q09428 1581 aa29.9■■■□□ 2.38
TSTA3-206ENST00000527549 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
TSTA3-206ENST00000527549 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.81■■■□□ 2.36
TSTA3-206ENST00000527549 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.77■■■□□ 2.36
TSTA3-206ENST00000527549 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.77■■■□□ 2.364e-8■■■■■ 34.1
TSTA3-206ENST00000527549 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP29.65■■■□□ 2.34
TSTA3-206ENST00000527549 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.65■■■□□ 2.34
TSTA3-206ENST00000527549 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.62■■■□□ 2.33
TSTA3-206ENST00000527549 FBLN2P98095 1184 aa29.58■■■□□ 2.33
TSTA3-206ENST00000527549 WDR97A6NE52 1622 aa29.53■■■□□ 2.32
TSTA3-206ENST00000527549 SYNJ1O43426 1573 aa29.47■■■□□ 2.31
TSTA3-206ENST00000527549 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.46■■■□□ 2.31
TSTA3-206ENST00000527549 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.46■■■□□ 2.31
TSTA3-206ENST00000527549 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.43■■■□□ 2.3
TSTA3-206ENST00000527549 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
TSTA3-206ENST00000527549 SOGA1O94964 1423 aa29.42■■■□□ 2.3
TSTA3-206ENST00000527549 SYNJ2O15056 1496 aa29.32■■■□□ 2.28
TSTA3-206ENST00000527549 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.32■■■□□ 2.28
TSTA3-206ENST00000527549 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.3■■■□□ 2.28
TSTA3-206ENST00000527549 GRIN2BQ13224 1484 aa29.29■■■□□ 2.28
TSTA3-206ENST00000527549 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.28■■■□□ 2.28
TSTA3-206ENST00000527549 CUX1P39880 1505 aa29.15■■■□□ 2.26
TSTA3-206ENST00000527549 PBRM1Q86U86 1689 aa29.12■■■□□ 2.25
TSTA3-206ENST00000527549 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.04■■■□□ 2.24
TSTA3-206ENST00000527549 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.02■■■□□ 2.24
TSTA3-206ENST00000527549 KIF13AQ9H1H9 1805 aa28.97■■■□□ 2.23
TSTA3-206ENST00000527549 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.97■■■□□ 2.23
TSTA3-206ENST00000527549 CEP170Q5SW79 1584 aa28.94■■■□□ 2.22
TSTA3-206ENST00000527549 SHROOM2Q13796 1616 aa28.93■■■□□ 2.22
TSTA3-206ENST00000527549 NUP160Q12769 1436 aa28.93■■■□□ 2.22
TSTA3-206ENST00000527549 GRIN2AQ12879 1464 aa28.92■■■□□ 2.22
TSTA3-206ENST00000527549 ADAMTS12P58397 1594 aa28.82■■■□□ 2.2
TSTA3-206ENST00000527549 ABCC10Q5T3U5 1492 aa28.69■■■□□ 2.18
TSTA3-206ENST00000527549 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.69■■■□□ 2.18
TSTA3-206ENST00000527549 MAPKBP1O60336 1514 aa28.64■■■□□ 2.17
TSTA3-206ENST00000527549 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.62■■■□□ 2.17
TSTA3-206ENST00000527549 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa28.62■■■□□ 2.17
TSTA3-206ENST00000527549 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
TSTA3-206ENST00000527549 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.59■■■□□ 2.17
TSTA3-206ENST00000527549 DIP2BQ9P265 1576 aa28.59■■■□□ 2.17
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