RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525861.5

ACER3-204, Transcript of alkaline ceramidase 3, humanhuman

TSL 2

Gene ACER3, Length 2,058 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3-204ENST00000525861 ADAMTS12P58397 1594 aa36.26■■■■□ 3.39
ACER3-204ENST00000525861 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP36.25■■■■□ 3.39
ACER3-204ENST00000525861 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.09■■■■□ 3.37
ACER3-204ENST00000525861 EFCAB5A4FU69 1503 aa36.08■■■■□ 3.37
ACER3-204ENST00000525861 APLP2Q06481 763 aa36.03■■■■□ 3.36
ACER3-204ENST00000525861 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.02■■■■□ 3.36
ACER3-204ENST00000525861 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP35.94■■■■□ 3.34
ACER3-204ENST00000525861 SAMD9Q5K651 1589 aa35.92■■■■□ 3.34
ACER3-204ENST00000525861 GRIN2AQ12879 1464 aa35.91■■■■□ 3.34
ACER3-204ENST00000525861 FHOD3Q2V2M9 1422 aa35.89■■■■□ 3.34
ACER3-204ENST00000525861 IQGAP2Q13576 1575 aa35.89■■■■□ 3.34
ACER3-204ENST00000525861 SYNJ2O15056 1496 aa35.88■■■■□ 3.33
ACER3-204ENST00000525861 P3H3Q8IVL6 736 aa35.87■■■■□ 3.33
ACER3-204ENST00000525861 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa35.78■■■■□ 3.32
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ACER3-204ENST00000525861 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP35.77■■■■□ 3.32
ACER3-204ENST00000525861 FMN1Q68DA7 1419 aa35.76■■■■□ 3.31
ACER3-204ENST00000525861 MAP3K1Q13233 1512 aa35.76■■■■□ 3.31
ACER3-204ENST00000525861 UGGT2Q9NYU1 1516 aa35.72■■■■□ 3.31
ACER3-204ENST00000525861 FYCO1Q9BQS8 1478 aa35.71■■■■□ 3.31
ACER3-204ENST00000525861 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa35.7■■■■□ 3.31
ACER3-204ENST00000525861 TIAM1Q13009 1591 aa35.69■■■■□ 3.3
ACER3-204ENST00000525861 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP35.68■■■■□ 3.3
ACER3-204ENST00000525861 CEP170Q5SW79 1584 aa35.67■■■■□ 3.3
ACER3-204ENST00000525861 FBLN2P98095 1184 aa35.64■■■■□ 3.3
ACER3-204ENST00000525861 NUP160Q12769 1436 aa35.64■■■■□ 3.3
ACER3-204ENST00000525861 CFAP43Q8NDM7 1665 aa35.61■■■■□ 3.29
ACER3-204ENST00000525861 HRCP23327 699 aa35.58■■■■□ 3.29
ACER3-204ENST00000525861 DISP1Q96F81 1524 aa35.52■■■■□ 3.28
ACER3-204ENST00000525861 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa35.52■■■■□ 3.28
ACER3-204ENST00000525861 KIAA0556O60303 1618 aa35.52■■■■□ 3.28
ACER3-204ENST00000525861 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP35.51■■■■□ 3.28
ACER3-204ENST00000525861 CHD1O14646 1710 aa35.43■■■■□ 3.26
ACER3-204ENST00000525861 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa35.39■■■■□ 3.26
ACER3-204ENST00000525861 HECW1Q76N89 1606 aa35.36■■■■□ 3.25
ACER3-204ENST00000525861 JPH4Q96JJ6 628 aa35.36■■■■□ 3.25
ACER3-204ENST00000525861 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP35.36■■■■□ 3.25
ACER3-204ENST00000525861 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa35.32■■■■□ 3.24
ACER3-204ENST00000525861 CCDC18Q5T9S5 1454 aa35.32■■■■□ 3.24
ACER3-204ENST00000525861 CCNB3Q8WWL7 1395 aa35.23■■■■□ 3.23
ACER3-204ENST00000525861 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP35.23■■■■□ 3.23
ACER3-204ENST00000525861 MTUS2Q5JR59 1369 aa35.22■■■■□ 3.23
ACER3-204ENST00000525861 PHLDB1Q86UU1 1377 aa35.21■■■■□ 3.23
ACER3-204ENST00000525861 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP35.2■■■■□ 3.22
ACER3-204ENST00000525861 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa35.19■■■■□ 3.22
ACER3-204ENST00000525861 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa35.17■■■■□ 3.22
ACER3-204ENST00000525861 SHROOM2Q13796 1616 aa35.13■■■■□ 3.21
ACER3-204ENST00000525861 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP35.13■■■■□ 3.21
ACER3-204ENST00000525861 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP35.12■■■■□ 3.21
ACER3-204ENST00000525861 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP35.12■■■■□ 3.21
ACER3-204ENST00000525861 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa35.1■■■■□ 3.21
ACER3-204ENST00000525861 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP35.08■■■■□ 3.21
ACER3-204ENST00000525861 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP35.08■■■■□ 3.21
ACER3-204ENST00000525861 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP35.07■■■■□ 3.21
ACER3-204ENST00000525861 PLB1Q6P1J6 1458 aa35.06■■■■□ 3.2
ACER3-204ENST00000525861 NCOA2Q15596 1464 aa35.04■■■■□ 3.2
ACER3-204ENST00000525861 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.03■■■■□ 3.2
ACER3-204ENST00000525861 ARHGEF11O15085 1522 aa35■■■■□ 3.19
ACER3-204ENST00000525861 ABCA8O94911 1581 aa34.99■■■■□ 3.19
ACER3-204ENST00000525861 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP34.98■■■■□ 3.19
ACER3-204ENST00000525861 ARID3CA6NKF2 412 aa34.97■■■■□ 3.19
ACER3-204ENST00000525861 FGD6Q6ZV73 1430 aa34.95■■■■□ 3.19
ACER3-204ENST00000525861 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP34.94■■■■□ 3.186e-7■■■□□ 19.2
ACER3-204ENST00000525861 PTPRGP23470 1445 aa34.93■■■■□ 3.18
ACER3-204ENST00000525861 MYOM3Q5VTT5 1437 aa34.93■■■■□ 3.18
ACER3-204ENST00000525861 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP34.89■■■■□ 3.18
ACER3-204ENST00000525861 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP34.88■■■■□ 3.17
ACER3-204ENST00000525861 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.84■■■■□ 3.17
ACER3-204ENST00000525861 ITGAEP38570 1179 aa34.83■■■■□ 3.17
ACER3-204ENST00000525861 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP34.8■■■■□ 3.16
ACER3-204ENST00000525861 ATP10BO94823 1461 aa34.76■■■■□ 3.16
ACER3-204ENST00000525861 UACAQ9BZF9 1416 aa34.75■■■■□ 3.15
ACER3-204ENST00000525861 PTPN23Q9H3S7 1636 aa34.75■■■■□ 3.15
ACER3-204ENST00000525861 MIA2Q96PC5 1412 aa34.72■■■■□ 3.15
ACER3-204ENST00000525861 ADCY10Q96PN6 1610 aa34.71■■■■□ 3.15
ACER3-204ENST00000525861 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP34.7■■■■□ 3.15
ACER3-204ENST00000525861 ABCC2Q92887 1545 aa34.65■■■■□ 3.14
ACER3-204ENST00000525861 PLEKHD1A6NEE1 506 aa34.63■■■■□ 3.13
ACER3-204ENST00000525861 KIF14Q15058 1648 aa34.62■■■■□ 3.13
ACER3-204ENST00000525861 SETD5Q9C0A6 1442 aa34.61■■■■□ 3.13
ACER3-204ENST00000525861 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa34.59■■■■□ 3.13
ACER3-204ENST00000525861 OSCARQ8IYS5 282 aa34.58■■■■□ 3.13
ACER3-204ENST00000525861 ITSN2Q9NZM3 1697 aa34.55■■■■□ 3.12
ACER3-204ENST00000525861 PTPRKQ15262 1439 aa34.55■■■■□ 3.12
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ACER3-204ENST00000525861 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa34.54■■■■□ 3.12
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ACER3-204ENST00000525861 ABCC10Q5T3U5 1492 aa34.48■■■■□ 3.11
ACER3-204ENST00000525861 CLSPNQ9HAW4 1339 aa34.47■■■■□ 3.11
ACER3-204ENST00000525861 HFM1A2PYH4 1435 aa34.45■■■■□ 3.11
ACER3-204ENST00000525861 KDM5BQ9UGL1 1544 aa34.41■■■■□ 3.1
ACER3-204ENST00000525861 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP34.41■■■■□ 3.1
ACER3-204ENST00000525861 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa34.4■■■■□ 3.1
ACER3-204ENST00000525861 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP34.39■■■■□ 3.1
ACER3-204ENST00000525861 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP34.38■■■■□ 3.09
ACER3-204ENST00000525861 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa34.37■■■■□ 3.09
ACER3-204ENST00000525861 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP34.36■■■■□ 3.09
ACER3-204ENST00000525861 NAIPQ13075 1403 aa34.36■■■■□ 3.09
ACER3-204ENST00000525861 DAPK1P53355 1430 aa34.35■■■■□ 3.09
ACER3-204ENST00000525861 AKNAQ7Z591 1439 aa34.35■■■■□ 3.09
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