RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525274.5

TSTA3-203, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 3

Gene TSTA3, Length 671 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-203ENST00000525274 EEA1Q15075 1411 aa41.94■■■■■ 4.3
TSTA3-203ENST00000525274 SHROOM2Q13796 1616 aa41.91■■■■■ 4.3
TSTA3-203ENST00000525274 PRXQ9BXM0 1461 aa41.9■■■■■ 4.3
TSTA3-203ENST00000525274 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa41.85■■■■■ 4.29
TSTA3-203ENST00000525274 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.84■■■■■ 4.29
TSTA3-203ENST00000525274 JPH4Q96JJ6 628 aa41.8■■■■■ 4.28
TSTA3-203ENST00000525274 ARAP1Q96P48 1450 aa41.79■■■■■ 4.28
TSTA3-203ENST00000525274 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.72■■■■■ 4.27
TSTA3-203ENST00000525274 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.71■■■■■ 4.27
TSTA3-203ENST00000525274 IQGAP2Q13576 1575 aa41.7■■■■■ 4.27
TSTA3-203ENST00000525274 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.7■■■■■ 4.27
TSTA3-203ENST00000525274 KIF21BO75037 1637 aa41.58■■■■■ 4.25
TSTA3-203ENST00000525274 EHMT2Q96KQ7 1210 aa41.48■■■■■ 4.23
TSTA3-203ENST00000525274 UGGT2Q9NYU1 1516 aa41.45■■■■■ 4.23
TSTA3-203ENST00000525274 DISP1Q96F81 1524 aa41.39■■■■■ 4.22
TSTA3-203ENST00000525274 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa41.37■■■■■ 4.21
TSTA3-203ENST00000525274 GOLGA3Q08378 1498 aa41.33■■■■■ 4.21
TSTA3-203ENST00000525274 KIAA0556O60303 1618 aa41.32■■■■■ 4.2
TSTA3-203ENST00000525274 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP41.3■■■■■ 4.2
TSTA3-203ENST00000525274 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.25■■■■■ 4.19
TSTA3-203ENST00000525274 UBTFP17480 764 aaKnown RBP41.24■■■■■ 4.19
TSTA3-203ENST00000525274 PTPRGP23470 1445 aa41.22■■■■■ 4.19
TSTA3-203ENST00000525274 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP41.19■■■■■ 4.18
TSTA3-203ENST00000525274 P3H3Q8IVL6 736 aa41.11■■■■■ 4.17
TSTA3-203ENST00000525274 SAMD9Q5K651 1589 aa41.11■■■■■ 4.17
TSTA3-203ENST00000525274 ADCY10Q96PN6 1610 aa41.1■■■■■ 4.17
TSTA3-203ENST00000525274 UACAQ9BZF9 1416 aa40.95■■■■■ 4.15
TSTA3-203ENST00000525274 EFCAB5A4FU69 1503 aa40.9■■■■■ 4.14
TSTA3-203ENST00000525274 FHOD3Q2V2M9 1422 aa40.9■■■■■ 4.14
TSTA3-203ENST00000525274 PLB1Q6P1J6 1458 aa40.89■■■■■ 4.14
TSTA3-203ENST00000525274 ABCC2Q92887 1545 aa40.88■■■■■ 4.14
TSTA3-203ENST00000525274 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa40.88■■■■■ 4.13
TSTA3-203ENST00000525274 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP40.87■■■■■ 4.13
TSTA3-203ENST00000525274 ABCA8O94911 1581 aa40.84■■■■■ 4.13
TSTA3-203ENST00000525274 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.8■■■■■ 4.12
TSTA3-203ENST00000525274 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.8■■■■■ 4.12
TSTA3-203ENST00000525274 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa40.77■■■■■ 4.12
TSTA3-203ENST00000525274 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP40.71■■■■■ 4.11
TSTA3-203ENST00000525274 MAPKBP1O60336 1514 aa40.71■■■■■ 4.11
TSTA3-203ENST00000525274 KDM5BQ9UGL1 1544 aa40.7■■■■■ 4.11
TSTA3-203ENST00000525274 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa40.69■■■■■ 4.1
TSTA3-203ENST00000525274 KIF13AQ9H1H9 1805 aa40.61■■■■■ 4.09
TSTA3-203ENST00000525274 ARID3CA6NKF2 412 aa40.61■■■■■ 4.09
TSTA3-203ENST00000525274 CLIP1P30622 1438 aa40.6■■■■■ 4.09
TSTA3-203ENST00000525274 ASXL2Q76L83 1435 aa40.57■■■■■ 4.08
TSTA3-203ENST00000525274 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP40.51■■■■■ 4.08
TSTA3-203ENST00000525274 ATP10BO94823 1461 aa40.51■■■■■ 4.07
TSTA3-203ENST00000525274 ABCC10Q5T3U5 1492 aa40.51■■■■■ 4.07
TSTA3-203ENST00000525274 FMN1Q68DA7 1419 aa40.5■■■■■ 4.07
TSTA3-203ENST00000525274 DIP2BQ9P265 1576 aa40.5■■■■■ 4.07
TSTA3-203ENST00000525274 CEP162Q5TB80 1403 aa40.48■■■■■ 4.07
TSTA3-203ENST00000525274 FAM69CQ0P6D2 419 aa40.45■■■■■ 4.07
TSTA3-203ENST00000525274 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP40.39■■■■■ 4.06
TSTA3-203ENST00000525274 WDR7Q9Y4E6 1490 aa40.38■■■■■ 4.05
TSTA3-203ENST00000525274 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP40.37■■■■■ 4.05
TSTA3-203ENST00000525274 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP40.37■■■■■ 4.05
TSTA3-203ENST00000525274 HECW1Q76N89 1606 aa40.36■■■■■ 4.05
TSTA3-203ENST00000525274 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP40.33■■■■■ 4.05
TSTA3-203ENST00000525274 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP40.32■■■■■ 4.05
TSTA3-203ENST00000525274 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP40.32■■■■■ 4.04
TSTA3-203ENST00000525274 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa40.31■■■■■ 4.04
TSTA3-203ENST00000525274 TSPOAP1O95153 1857 aa40.31■■■■■ 4.04
TSTA3-203ENST00000525274 GLI2P10070 1586 aa40.27■■■■■ 4.04
TSTA3-203ENST00000525274 KCNH8Q96L42 1107 aa40.27■■■■■ 4.04
TSTA3-203ENST00000525274 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa40.25■■■■■ 4.03
TSTA3-203ENST00000525274 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa40.16■■■■■ 4.02
TSTA3-203ENST00000525274 FYCO1Q9BQS8 1478 aa40.15■■■■■ 4.02
TSTA3-203ENST00000525274 PLEKHD1A6NEE1 506 aa40.13■■■■■ 4.01
TSTA3-203ENST00000525274 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP40.11■■■■■ 4.01
TSTA3-203ENST00000525274 CFAP43Q8NDM7 1665 aa40.08■■■■■ 4.01
TSTA3-203ENST00000525274 CCDC18Q5T9S5 1454 aa40.04■■■■■ 4
TSTA3-203ENST00000525274 ABCA9Q8IUA7 1624 aa40.02■■■■■ 4
TSTA3-203ENST00000525274 CD109Q6YHK3 1445 aa39.99■■■■□ 3.99
TSTA3-203ENST00000525274 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP39.97■■■■□ 3.99
TSTA3-203ENST00000525274 VPS8Q8N3P4 1428 aa39.96■■■■□ 3.99
TSTA3-203ENST00000525274 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa39.92■■■■□ 3.98
TSTA3-203ENST00000525274 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP39.91■■■■□ 3.98
TSTA3-203ENST00000525274 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP39.91■■■■□ 3.98
TSTA3-203ENST00000525274 KIF14Q15058 1648 aa39.9■■■■□ 3.98
TSTA3-203ENST00000525274 TTC37Q6PGP7 1564 aa39.89■■■■□ 3.98
TSTA3-203ENST00000525274 TEX14Q8IWB6 1497 aa39.86■■■■□ 3.97
TSTA3-203ENST00000525274 KDM6BO15054 1643 aa39.81■■■■□ 3.96
TSTA3-203ENST00000525274 MYO5CQ9NQX4 1742 aa39.71■■■■□ 3.95
TSTA3-203ENST00000525274 TIAM1Q13009 1591 aa39.71■■■■□ 3.95
TSTA3-203ENST00000525274 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP39.68■■■■□ 3.94
TSTA3-203ENST00000525274 MTUS2Q5JR59 1369 aa39.68■■■■□ 3.94
TSTA3-203ENST00000525274 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa39.62■■■■□ 3.93
TSTA3-203ENST00000525274 PLCH2O75038 1416 aa39.62■■■■□ 3.93
TSTA3-203ENST00000525274 NEO1Q92859 1461 aa39.6■■■■□ 3.93
TSTA3-203ENST00000525274 FANCAO15360 1455 aa39.59■■■■□ 3.93
TSTA3-203ENST00000525274 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa39.58■■■■□ 3.93
TSTA3-203ENST00000525274 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa39.58■■■■□ 3.93
TSTA3-203ENST00000525274 CFAP74Q9C0B2 1584 aa39.56■■■■□ 3.92
TSTA3-203ENST00000525274 MAP3K1Q13233 1512 aa39.55■■■■□ 3.92
TSTA3-203ENST00000525274 PREX2Q70Z35 1606 aa39.54■■■■□ 3.92
TSTA3-203ENST00000525274 ARAP3Q8WWN8 1544 aa39.52■■■■□ 3.92
TSTA3-203ENST00000525274 AKNAQ7Z591 1439 aa39.52■■■■□ 3.92
TSTA3-203ENST00000525274 ARHGAP5Q13017 1502 aa39.51■■■■□ 3.92
TSTA3-203ENST00000525274 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa39.51■■■■□ 3.92
TSTA3-203ENST00000525274 PHLDB1Q86UU1 1377 aa39.51■■■■□ 3.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.1 ms