RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525274.5

TSTA3-203, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 3

Gene TSTA3, Length 671 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-203ENST00000525274 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.6■■■■■ 7.29
TSTA3-203ENST00000525274 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.78■■■■■ 6.2
TSTA3-203ENST00000525274 ABCC9O60706 1549 aa52.47■■■■■ 5.99
TSTA3-203ENST00000525274 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.63■■■■■ 5.7
TSTA3-203ENST00000525274 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.52■■■■■ 5.68
TSTA3-203ENST00000525274 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.49■■■■■ 5.67
TSTA3-203ENST00000525274 NACADO15069 1562 aa50.46■■■■■ 5.67
TSTA3-203ENST00000525274 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.16■■■■■ 5.62
TSTA3-203ENST00000525274 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.06■■■■■ 5.6
TSTA3-203ENST00000525274 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.54■■■■■ 5.52
TSTA3-203ENST00000525274 SCRIBQ14160 1630 aa49.18■■■■■ 5.46
TSTA3-203ENST00000525274 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.09■■■■■ 5.456e-9■□□□□ 10.6
TSTA3-203ENST00000525274 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.03■■■■■ 5.44
TSTA3-203ENST00000525274 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.32■■■■■ 5.33
TSTA3-203ENST00000525274 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.98■■■■■ 5.27
TSTA3-203ENST00000525274 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.67■■■■■ 5.22
TSTA3-203ENST00000525274 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.47■■■■■ 5.19
TSTA3-203ENST00000525274 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.26■■■■■ 5.16
TSTA3-203ENST00000525274 SMARCA4P51532 1647 aa47.01■■■■■ 5.12
TSTA3-203ENST00000525274 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.93■■■■■ 5.1
TSTA3-203ENST00000525274 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.77■■■■■ 5.08
TSTA3-203ENST00000525274 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.65■■■■■ 5.06
TSTA3-203ENST00000525274 SMARCA2P51531 1590 aa46.58■■■■■ 5.05
TSTA3-203ENST00000525274 NCAPD3P42695 1498 aa46.55■■■■■ 5.04
TSTA3-203ENST00000525274 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.47■■■■■ 5.03
TSTA3-203ENST00000525274 HMGXB3Q12766 1538 aa46.35■■■■■ 5.01
TSTA3-203ENST00000525274 WIZO95785 1651 aa46.33■■■■■ 5.01
TSTA3-203ENST00000525274 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.28■■■■■ 5
TSTA3-203ENST00000525274 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.27■■■■■ 5
TSTA3-203ENST00000525274 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.75■■■■■ 4.91
TSTA3-203ENST00000525274 NESP48681 1621 aa45.5■■■■■ 4.87
TSTA3-203ENST00000525274 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.36■■■■■ 4.85
TSTA3-203ENST00000525274 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.31■■■■■ 4.84
TSTA3-203ENST00000525274 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.23■■■■■ 4.83
TSTA3-203ENST00000525274 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.22■■■■■ 4.83
TSTA3-203ENST00000525274 ERCC6Q03468 1493 aa45.14■■■■■ 4.82
TSTA3-203ENST00000525274 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.01■■■■■ 4.8
TSTA3-203ENST00000525274 CFTRP13569 1480 aa45■■■■■ 4.79
TSTA3-203ENST00000525274 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.96■■■■■ 4.79
TSTA3-203ENST00000525274 PRDM2Q13029 1718 aa44.81■■■■■ 4.76
TSTA3-203ENST00000525274 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.74■■■■■ 4.75
TSTA3-203ENST00000525274 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.73■■■■■ 4.75
TSTA3-203ENST00000525274 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.65■■■■■ 4.74
TSTA3-203ENST00000525274 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.53■■■■■ 4.72
TSTA3-203ENST00000525274 CUX2O14529 1486 aa44.53■■■■■ 4.72
TSTA3-203ENST00000525274 WDR62O43379 1518 aa44.39■■■■■ 4.7
TSTA3-203ENST00000525274 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.31■■■■■ 4.68
TSTA3-203ENST00000525274 TOPBP1Q92547 1522 aa44.07■■■■■ 4.65
TSTA3-203ENST00000525274 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.02■■■■■ 4.64
TSTA3-203ENST00000525274 ABCC8Q09428 1581 aa43.97■■■■■ 4.63
TSTA3-203ENST00000525274 CUX1P39880 1505 aa43.85■■■■■ 4.61
TSTA3-203ENST00000525274 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.7■■■■■ 4.59
TSTA3-203ENST00000525274 IFT140Q96RY7 1462 aa43.68■■■■■ 4.58
TSTA3-203ENST00000525274 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.65■■■■■ 4.58
TSTA3-203ENST00000525274 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.6■■■■■ 4.57
TSTA3-203ENST00000525274 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.59■■■■■ 4.57
TSTA3-203ENST00000525274 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.57■■■■■ 4.56
TSTA3-203ENST00000525274 SYNJ1O43426 1573 aa43.56■■■■■ 4.56
TSTA3-203ENST00000525274 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.55■■■■■ 4.56
TSTA3-203ENST00000525274 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.53■■■■■ 4.56
TSTA3-203ENST00000525274 SOGA1O94964 1423 aa43.52■■■■■ 4.56
TSTA3-203ENST00000525274 TOP2BQ02880 1626 aa43.51■■■■■ 4.56
TSTA3-203ENST00000525274 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.38■■■■■ 4.54
TSTA3-203ENST00000525274 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.32■■■■■ 4.534e-8■■■■■ 34.1
TSTA3-203ENST00000525274 WDR97A6NE52 1622 aa43.32■■■■■ 4.53
TSTA3-203ENST00000525274 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.29■■■■■ 4.52
TSTA3-203ENST00000525274 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.18■■■■■ 4.5
TSTA3-203ENST00000525274 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.05■■■■■ 4.48
TSTA3-203ENST00000525274 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.02■■■■■ 4.48
TSTA3-203ENST00000525274 PBRM1Q86U86 1689 aa43.02■■■■■ 4.48
TSTA3-203ENST00000525274 GRIN2BQ13224 1484 aa42.95■■■■■ 4.47
TSTA3-203ENST00000525274 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.92■■■■■ 4.46
TSTA3-203ENST00000525274 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.92■■■■■ 4.46
TSTA3-203ENST00000525274 CHD1O14646 1710 aa42.88■■■■■ 4.45
TSTA3-203ENST00000525274 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.8■■■■■ 4.44
TSTA3-203ENST00000525274 FBLN2P98095 1184 aa42.77■■■■■ 4.44
TSTA3-203ENST00000525274 OSCARQ8IYS5 282 aa42.75■■■■■ 4.43
TSTA3-203ENST00000525274 TRIM41Q8WV44 630 aa42.75■■■■■ 4.43
TSTA3-203ENST00000525274 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.66■■■■■ 4.42
TSTA3-203ENST00000525274 SYNJ2O15056 1496 aa42.65■■■■■ 4.42
TSTA3-203ENST00000525274 KIF27Q86VH2 1401 aa42.64■■■■■ 4.42
TSTA3-203ENST00000525274 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.63■■■■■ 4.41
TSTA3-203ENST00000525274 ADAMTS12P58397 1594 aa42.62■■■■■ 4.41
TSTA3-203ENST00000525274 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.5■■■■■ 4.39
TSTA3-203ENST00000525274 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.49■■■■■ 4.39
TSTA3-203ENST00000525274 IGF1RP08069 1367 aa42.47■■■■■ 4.39
TSTA3-203ENST00000525274 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.43■■■■■ 4.38
TSTA3-203ENST00000525274 GRIN2AQ12879 1464 aa42.43■■■■■ 4.38
TSTA3-203ENST00000525274 CUL7Q14999 1698 aa42.36■■■■■ 4.37
TSTA3-203ENST00000525274 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.3■■■■■ 4.36
TSTA3-203ENST00000525274 CEP170Q5SW79 1584 aa42.27■■■■■ 4.36
TSTA3-203ENST00000525274 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.23■■■■■ 4.35
TSTA3-203ENST00000525274 NUP160Q12769 1436 aa42.2■■■■■ 4.35
TSTA3-203ENST00000525274 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.14■■■■■ 4.34
TSTA3-203ENST00000525274 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.14■■■■■ 4.34
TSTA3-203ENST00000525274 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.14■■■■■ 4.34
TSTA3-203ENST00000525274 ARHGEF11O15085 1522 aa42.1■■■■■ 4.33
TSTA3-203ENST00000525274 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42■■■■■ 4.31
TSTA3-203ENST00000525274 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.98■■■■■ 4.31
TSTA3-203ENST00000525274 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.94■■■■■ 4.3
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