RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525151.5

TRAF3IP2-AS1-208, TRAF3IP2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAF3IP2-AS1, Length 609 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 KDM6BO15054 1643 aa31.42■■■□□ 2.62
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 TSPOAP1O95153 1857 aa31.4■■■□□ 2.62
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 ADCY10Q96PN6 1610 aa31.38■■■□□ 2.61
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP31.33■■■□□ 2.61
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 ERICH3Q5RHP9 1530 aa31.33■■■□□ 2.61
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa31.31■■■□□ 2.6
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 JPH4Q96JJ6 628 aa31.31■■■□□ 2.6
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa31.29■■■□□ 2.6
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 TOP2BQ02880 1626 aa31.26■■■□□ 2.59
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP31.17■■■□□ 2.58
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP31.12■■■□□ 2.57
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 ADGRL1O94910 1474 aa31.07■■■□□ 2.56
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 HECW2Q9P2P5 1572 aa31.02■■■□□ 2.56
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP30.91■■■□□ 2.54
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa30.91■■■□□ 2.54
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 GLI2P10070 1586 aa30.89■■■□□ 2.54
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 CUL7Q14999 1698 aa30.83■■■□□ 2.53
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 ABCC2Q92887 1545 aa30.81■■■□□ 2.52
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 ASXL2Q76L83 1435 aa30.81■■■□□ 2.52
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 PTPRGP23470 1445 aa30.77■■■□□ 2.52
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa30.76■■■□□ 2.51
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 PLB1Q6P1J6 1458 aa30.73■■■□□ 2.51
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 IGF1RP08069 1367 aa30.69■■■□□ 2.5
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP30.67■■■□□ 2.5
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa30.64■■■□□ 2.5
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP30.64■■■□□ 2.5
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 TNIKQ9UKE5 1360 aa30.63■■■□□ 2.49
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.62■■■□□ 2.49
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP30.55■■■□□ 2.48
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 KDM5BQ9UGL1 1544 aa30.54■■■□□ 2.48
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 UACAQ9BZF9 1416 aa30.54■■■□□ 2.48
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 TEX14Q8IWB6 1497 aa30.53■■■□□ 2.48
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 FBXO41Q8TF61 875 aa30.53■■■□□ 2.48
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa30.52■■■□□ 2.48
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 IQGAP2Q13576 1575 aa30.5■■■□□ 2.47
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 DISP1Q96F81 1524 aa30.5■■■□□ 2.47
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 KIF27Q86VH2 1401 aa30.47■■■□□ 2.47
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 KIF21BO75037 1637 aa30.43■■■□□ 2.46
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa30.41■■■□□ 2.46
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 WDR7Q9Y4E6 1490 aa30.32■■■□□ 2.44
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 CFAP43Q8NDM7 1665 aa30.31■■■□□ 2.44
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa30.29■■■□□ 2.44
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 KIAA0556O60303 1618 aa30.29■■■□□ 2.44
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 UGGT2Q9NYU1 1516 aa30.28■■■□□ 2.44
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 ADAMTSL3P82987 1691 aa30.23■■■□□ 2.43
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 CD109Q6YHK3 1445 aa30.22■■■□□ 2.43
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 PTPRMP28827 1452 aa30.18■■■□□ 2.42
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 ARAP3Q8WWN8 1544 aa30.1■■■□□ 2.41
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 ABCA8O94911 1581 aa30.09■■■□□ 2.41
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 KCNH8Q96L42 1107 aa30.08■■■□□ 2.41
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP30.07■■■□□ 2.4
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 LMTK3Q96Q04 1460 aa30.06■■■□□ 2.4
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 BCORL1Q5H9F3 1711 aa30.05■■■□□ 2.4
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 MADDQ8WXG6 1647 aa30.03■■■□□ 2.4
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa30.02■■■□□ 2.4
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa29.99■■■□□ 2.39
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa29.92■■■□□ 2.38
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 ABCA9Q8IUA7 1624 aa29.89■■■□□ 2.38
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP29.89■■■□□ 2.38
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 RAPGEF3O95398 923 aa29.87■■■□□ 2.37
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 ILDR2Q71H61 639 aa29.87■■■□□ 2.37
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 GOLGA3Q08378 1498 aa29.8■■■□□ 2.36
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 HSPA2P54652 639 aa29.8■■■□□ 2.36
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 ATP10BO94823 1461 aa29.8■■■□□ 2.36
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa29.77■■■□□ 2.36
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 PHLDB1Q86UU1 1377 aa29.77■■■□□ 2.36
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 CERKQ8TCT0 537 aa29.76■■■□□ 2.35
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 ARID3CA6NKF2 412 aa29.75■■■□□ 2.35
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 NEO1Q92859 1461 aa29.74■■■□□ 2.35
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa29.72■■■□□ 2.35
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 RICTORQ6R327 1708 aa29.71■■■□□ 2.35
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 SOCS7O14512 581 aa29.71■■■□□ 2.35
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 DISP3Q9P2K9 1392 aa29.65■■■□□ 2.34
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 PLPPR3Q6T4P5 718 aa29.57■■■□□ 2.32
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa29.56■■■□□ 2.32
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 STRCQ7RTU9 1775 aa29.54■■■□□ 2.32
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa29.54■■■□□ 2.32
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 P3H3Q8IVL6 736 aa29.53■■■□□ 2.32
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 PRXQ9BXM0 1461 aa29.52■■■□□ 2.32
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 TTC37Q6PGP7 1564 aa29.52■■■□□ 2.32
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 FHOD3Q2V2M9 1422 aa29.51■■■□□ 2.31
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP29.5■■■□□ 2.31
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa29.49■■■□□ 2.31
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa29.49■■■□□ 2.31
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 SAMD9Q5K651 1589 aa29.48■■■□□ 2.31
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 YEATS2Q9ULM3 1422 aa29.48■■■□□ 2.31
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 FANCAO15360 1455 aa29.48■■■□□ 2.31
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 PREX1Q8TCU6 1659 aa29.47■■■□□ 2.31
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 AKNAQ7Z591 1439 aa29.45■■■□□ 2.31
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa29.44■■■□□ 2.3
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP29.43■■■□□ 2.3
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 POGZQ7Z3K3 1410 aa29.42■■■□□ 2.3
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 EFCAB5A4FU69 1503 aa29.39■■■□□ 2.3
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 CFAP74Q9C0B2 1584 aa29.39■■■□□ 2.29
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 HECW1Q76N89 1606 aa29.38■■■□□ 2.29
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP29.38■■■□□ 2.29
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa29.36■■■□□ 2.29
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 MLECQ14165 292 aa29.36■■■□□ 2.29
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms