RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520912.1

TBC1D9B-211, Transcript of TBC1 domain family member 9B, humanhuman

TSL 2

Gene TBC1D9B, Length 1,931 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBC1D9B-211ENST00000520912 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
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TBC1D9B-211ENST00000520912 GRIN2AQ12879 1464 aa24.48■■□□□ 1.51
TBC1D9B-211ENST00000520912 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.44■■□□□ 1.5
TBC1D9B-211ENST00000520912 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
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TBC1D9B-211ENST00000520912 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
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TBC1D9B-211ENST00000520912 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.01■■□□□ 1.43
TBC1D9B-211ENST00000520912 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
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TBC1D9B-211ENST00000520912 MAP3K1Q13233 1512 aa23.97■■□□□ 1.43
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TBC1D9B-211ENST00000520912 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
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TBC1D9B-211ENST00000520912 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.95■■□□□ 1.42
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TBC1D9B-211ENST00000520912 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
TBC1D9B-211ENST00000520912 HECW1Q76N89 1606 aa23.9■■□□□ 1.42
TBC1D9B-211ENST00000520912 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.87■■□□□ 1.41
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TBC1D9B-211ENST00000520912 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa23.86■■□□□ 1.41
TBC1D9B-211ENST00000520912 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.85■■□□□ 1.41
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TBC1D9B-211ENST00000520912 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
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TBC1D9B-211ENST00000520912 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23.72■■□□□ 1.39
TBC1D9B-211ENST00000520912 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.71■■□□□ 1.39
TBC1D9B-211ENST00000520912 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.69■■□□□ 1.38
TBC1D9B-211ENST00000520912 UACAQ9BZF9 1416 aa23.66■■□□□ 1.38
TBC1D9B-211ENST00000520912 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.63■■□□□ 1.37
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TBC1D9B-211ENST00000520912 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
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TBC1D9B-211ENST00000520912 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23.47■■□□□ 1.35
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TBC1D9B-211ENST00000520912 PLEKHD1A6NEE1 506 aa23.47■■□□□ 1.35
TBC1D9B-211ENST00000520912 KIF14Q15058 1648 aa23.46■■□□□ 1.35
TBC1D9B-211ENST00000520912 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.39■■□□□ 1.33
TBC1D9B-211ENST00000520912 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.39■■□□□ 1.33
TBC1D9B-211ENST00000520912 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.39■■□□□ 1.33
TBC1D9B-211ENST00000520912 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.38■■□□□ 1.33
TBC1D9B-211ENST00000520912 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
TBC1D9B-211ENST00000520912 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.37■■□□□ 1.33
TBC1D9B-211ENST00000520912 ABCC10Q5T3U5 1492 aa23.36■■□□□ 1.33
TBC1D9B-211ENST00000520912 MIA2Q96PC5 1412 aa23.36■■□□□ 1.33
TBC1D9B-211ENST00000520912 ITSN2Q9NZM3 1697 aa23.34■■□□□ 1.33
TBC1D9B-211ENST00000520912 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
TBC1D9B-211ENST00000520912 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
TBC1D9B-211ENST00000520912 MIER1Q8N108 512 aa23.32■■□□□ 1.32
TBC1D9B-211ENST00000520912 ITGAEP38570 1179 aa23.31■■□□□ 1.32
TBC1D9B-211ENST00000520912 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa23.31■■□□□ 1.32
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