RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517886.1

CHCHD10-203, Transcript of coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 10, human

TSL 3

Gene CHCHD10, Length 494 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHCHD10-203	ENST00000517886	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		33.38	■■■□□ 2.93
CHCHD10-203	ENST00000517886	PRX	Q9BXM0	1461 aa		33.36	■■■□□ 2.93
CHCHD10-203	ENST00000517886	JPH4	Q96JJ6	628 aa		33.34	■■■□□ 2.93
CHCHD10-203	ENST00000517886	SHROOM2	Q13796	1616 aa		33.33	■■■□□ 2.93
CHCHD10-203	ENST00000517886	ARAP1	Q96P48	1450 aa		33.31	■■■□□ 2.92
CHCHD10-203	ENST00000517886	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		33.29	■■■□□ 2.92
CHCHD10-203	ENST00000517886	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	33.27	■■■□□ 2.92
CHCHD10-203	ENST00000517886	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	33.26	■■■□□ 2.91
CHCHD10-203	ENST00000517886	IQGAP2	Q13576	1575 aa		33.18	■■■□□ 2.9
CHCHD10-203	ENST00000517886	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		33.18	■■■□□ 2.9
CHCHD10-203	ENST00000517886	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		33.07	■■■□□ 2.88
CHCHD10-203	ENST00000517886	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		33.03	■■■□□ 2.88
CHCHD10-203	ENST00000517886	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		33.02	■■■□□ 2.88
CHCHD10-203	ENST00000517886	KIF21B	O75037	1637 aa		33.02	■■■□□ 2.88
CHCHD10-203	ENST00000517886	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		32.94	■■■□□ 2.86
CHCHD10-203	ENST00000517886	DISP1	Q96F81	1524 aa		32.92	■■■□□ 2.86
CHCHD10-203	ENST00000517886	GOLGA3	Q08378	1498 aa		32.91	■■■□□ 2.86
CHCHD10-203	ENST00000517886	PTPRG	P23470	1445 aa		32.9	■■■□□ 2.86
CHCHD10-203	ENST00000517886	KIAA0556	O60303	1618 aa		32.85	■■■□□ 2.85
CHCHD10-203	ENST00000517886	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	32.83	■■■□□ 2.85
CHCHD10-203	ENST00000517886	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	32.81	■■■□□ 2.84
CHCHD10-203	ENST00000517886	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		32.8	■■■□□ 2.84
CHCHD10-203	ENST00000517886	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	32.71	■■■□□ 2.83
CHCHD10-203	ENST00000517886	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	32.68	■■■□□ 2.82
CHCHD10-203	ENST00000517886	UACA	Q9BZF9	1416 aa		32.68	■■■□□ 2.82
CHCHD10-203	ENST00000517886	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		32.66	■■■□□ 2.82
CHCHD10-203	ENST00000517886	SAMD9	Q5K651	1589 aa		32.66	■■■□□ 2.82
CHCHD10-203	ENST00000517886	P3H3	Q8IVL6	736 aa		32.64	■■■□□ 2.82
CHCHD10-203	ENST00000517886	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		32.63	■■■□□ 2.81
CHCHD10-203	ENST00000517886	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		32.61	■■■□□ 2.81
CHCHD10-203	ENST00000517886	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	32.6	■■■□□ 2.81
CHCHD10-203	ENST00000517886	ABCC2	Q92887	1545 aa		32.59	■■■□□ 2.81
CHCHD10-203	ENST00000517886	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		32.53	■■■□□ 2.8
CHCHD10-203	ENST00000517886	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		32.51	■■■□□ 2.8
CHCHD10-203	ENST00000517886	MAPKBP1	O60336	1514 aa		32.5	■■■□□ 2.79
CHCHD10-203	ENST00000517886	ABCA8	O94911	1581 aa		32.49	■■■□□ 2.79
CHCHD10-203	ENST00000517886	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		32.46	■■■□□ 2.79
CHCHD10-203	ENST00000517886	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		32.42	■■■□□ 2.78
CHCHD10-203	ENST00000517886	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		32.35	■■■□□ 2.77
CHCHD10-203	ENST00000517886	ASXL2	Q76L83	1435 aa		32.34	■■■□□ 2.77
CHCHD10-203	ENST00000517886	FMN1	Q68DA7	1419 aa		32.33	■■■□□ 2.77
CHCHD10-203	ENST00000517886	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	32.33	■■■□□ 2.77
CHCHD10-203	ENST00000517886	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		32.33	■■■□□ 2.77
CHCHD10-203	ENST00000517886	CLIP1	P30622	1438 aa		32.31	■■■□□ 2.76
CHCHD10-203	ENST00000517886	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		32.29	■■■□□ 2.76
CHCHD10-203	ENST00000517886	ARID3C	A6NKF2	412 aa		32.25	■■■□□ 2.75
CHCHD10-203	ENST00000517886	DIP2B	Q9P265	1576 aa		32.24	■■■□□ 2.75
CHCHD10-203	ENST00000517886	ATP10B	O94823	1461 aa		32.24	■■■□□ 2.75
CHCHD10-203	ENST00000517886	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		32.24	■■■□□ 2.75
CHCHD10-203	ENST00000517886	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	32.23	■■■□□ 2.75
CHCHD10-203	ENST00000517886	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		32.22	■■■□□ 2.75
CHCHD10-203	ENST00000517886	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	32.19	■■■□□ 2.74
CHCHD10-203	ENST00000517886	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	32.19	■■■□□ 2.74
CHCHD10-203	ENST00000517886	CEP162	Q5TB80	1403 aa		32.17	■■■□□ 2.74
CHCHD10-203	ENST00000517886	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		32.17	■■■□□ 2.74
CHCHD10-203	ENST00000517886	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	32.15	■■■□□ 2.74
CHCHD10-203	ENST00000517886	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	32.13	■■■□□ 2.73
CHCHD10-203	ENST00000517886	GLI2	P10070	1586 aa		32.12	■■■□□ 2.73
CHCHD10-203	ENST00000517886	HECW1	Q76N89	1606 aa		32.11	■■■□□ 2.73
CHCHD10-203	ENST00000517886	KCNH8	Q96L42	1107 aa		32.07	■■■□□ 2.72
CHCHD10-203	ENST00000517886	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		32.06	■■■□□ 2.72
CHCHD10-203	ENST00000517886	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		32.04	■■■□□ 2.72
CHCHD10-203	ENST00000517886	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	32	■■■□□ 2.71
CHCHD10-203	ENST00000517886	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	31.99	■■■□□ 2.71
CHCHD10-203	ENST00000517886	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		31.99	■■■□□ 2.71
CHCHD10-203	ENST00000517886	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	31.98	■■■□□ 2.71
CHCHD10-203	ENST00000517886	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		31.94	■■■□□ 2.7
CHCHD10-203	ENST00000517886	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		31.93	■■■□□ 2.7
CHCHD10-203	ENST00000517886	CD109	Q6YHK3	1445 aa		31.92	■■■□□ 2.7
CHCHD10-203	ENST00000517886	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		31.89	■■■□□ 2.7
CHCHD10-203	ENST00000517886	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		31.88	■■■□□ 2.69
CHCHD10-203	ENST00000517886	TSPOAP1	O95153	1857 aa		31.88	■■■□□ 2.69
CHCHD10-203	ENST00000517886	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		31.84	■■■□□ 2.69
CHCHD10-203	ENST00000517886	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		31.83	■■■□□ 2.69
CHCHD10-203	ENST00000517886	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	31.82	■■■□□ 2.68
CHCHD10-203	ENST00000517886	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	31.8	■■■□□ 2.68
CHCHD10-203	ENST00000517886	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		31.8	■■■□□ 2.68
CHCHD10-203	ENST00000517886	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		31.78	■■■□□ 2.68
CHCHD10-203	ENST00000517886	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	31.73	■■■□□ 2.67	5e-8	■■■□□ 15.9
CHCHD10-203	ENST00000517886	KDM6B	O15054	1643 aa		31.72	■■■□□ 2.67
CHCHD10-203	ENST00000517886	KIF14	Q15058	1648 aa		31.71	■■■□□ 2.67
CHCHD10-203	ENST00000517886	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		31.67	■■■□□ 2.66
CHCHD10-203	ENST00000517886	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		31.66	■■■□□ 2.66
CHCHD10-203	ENST00000517886	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		31.64	■■■□□ 2.66
CHCHD10-203	ENST00000517886	NEO1	Q92859	1461 aa		31.63	■■■□□ 2.65
CHCHD10-203	ENST00000517886	PLCH2	O75038	1416 aa		31.6	■■■□□ 2.65
CHCHD10-203	ENST00000517886	FANCA	O15360	1455 aa		31.57	■■■□□ 2.64
CHCHD10-203	ENST00000517886	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	31.57	■■■□□ 2.64
CHCHD10-203	ENST00000517886	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		31.55	■■■□□ 2.64
CHCHD10-203	ENST00000517886	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		31.54	■■■□□ 2.64
CHCHD10-203	ENST00000517886	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		31.54	■■■□□ 2.64
CHCHD10-203	ENST00000517886	TIAM1	Q13009	1591 aa		31.53	■■■□□ 2.64
CHCHD10-203	ENST00000517886	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		31.53	■■■□□ 2.64
CHCHD10-203	ENST00000517886	APLP2	Q06481	763 aa		31.51	■■■□□ 2.63
CHCHD10-203	ENST00000517886	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		31.51	■■■□□ 2.63
CHCHD10-203	ENST00000517886	AKNA	Q7Z591	1439 aa		31.5	■■■□□ 2.63
CHCHD10-203	ENST00000517886	MAP3K1	Q13233	1512 aa		31.5	■■■□□ 2.63
CHCHD10-203	ENST00000517886	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		31.47	■■■□□ 2.63
CHCHD10-203	ENST00000517886	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		31.43	■■■□□ 2.62
CHCHD10-203	ENST00000517886	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		31.42	■■■□□ 2.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 134.3 ms