RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507305.5

FAM200B-211, Transcript of family with sequence similarity 200 member B, humanhuman

TSL 2

Gene FAM200B, Length 800 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200B-211ENST00000507305 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP31.05■■■□□ 2.56
FAM200B-211ENST00000507305 NUP160Q12769 1436 aa30.98■■■□□ 2.55
FAM200B-211ENST00000507305 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa30.98■■■□□ 2.55
FAM200B-211ENST00000507305 PRXQ9BXM0 1461 aa30.93■■■□□ 2.54
FAM200B-211ENST00000507305 CEP170Q5SW79 1584 aa30.92■■■□□ 2.54
FAM200B-211ENST00000507305 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.92■■■□□ 2.54
FAM200B-211ENST00000507305 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa30.8■■■□□ 2.52
FAM200B-211ENST00000507305 JPH4Q96JJ6 628 aa30.78■■■□□ 2.52
FAM200B-211ENST00000507305 KIF21BO75037 1637 aa30.69■■■□□ 2.5
FAM200B-211ENST00000507305 SHROOM2Q13796 1616 aa30.65■■■□□ 2.5
FAM200B-211ENST00000507305 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP30.63■■■□□ 2.49
FAM200B-211ENST00000507305 IQGAP2Q13576 1575 aa30.62■■■□□ 2.49
FAM200B-211ENST00000507305 EHMT2Q96KQ7 1210 aa30.62■■■□□ 2.49
FAM200B-211ENST00000507305 GOLGA3Q08378 1498 aa30.58■■■□□ 2.49
FAM200B-211ENST00000507305 UBTFP17480 764 aaKnown RBP30.58■■■□□ 2.49
FAM200B-211ENST00000507305 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa30.56■■■□□ 2.48
FAM200B-211ENST00000507305 ERCC6L2Q5T890 1561 aa30.53■■■□□ 2.48
FAM200B-211ENST00000507305 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa30.5■■■□□ 2.47
FAM200B-211ENST00000507305 UGGT2Q9NYU1 1516 aa30.49■■■□□ 2.47
FAM200B-211ENST00000507305 DISP1Q96F81 1524 aa30.4■■■□□ 2.46
FAM200B-211ENST00000507305 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP30.39■■■□□ 2.46
FAM200B-211ENST00000507305 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP30.38■■■□□ 2.45
FAM200B-211ENST00000507305 TNIKQ9UKE5 1360 aa30.37■■■□□ 2.45
FAM200B-211ENST00000507305 PTPRGP23470 1445 aa30.33■■■□□ 2.45
FAM200B-211ENST00000507305 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP30.33■■■□□ 2.45
FAM200B-211ENST00000507305 KIAA0556O60303 1618 aa30.32■■■□□ 2.44
FAM200B-211ENST00000507305 P3H3Q8IVL6 736 aa30.29■■■□□ 2.44
FAM200B-211ENST00000507305 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa30.27■■■□□ 2.44
FAM200B-211ENST00000507305 KIF13AQ9H1H9 1805 aa30.22■■■□□ 2.43
FAM200B-211ENST00000507305 SAMD9Q5K651 1589 aa30.22■■■□□ 2.43
FAM200B-211ENST00000507305 EFCAB5A4FU69 1503 aa30.18■■■□□ 2.42
FAM200B-211ENST00000507305 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa30.18■■■□□ 2.42
FAM200B-211ENST00000507305 UACAQ9BZF9 1416 aa30.12■■■□□ 2.41
FAM200B-211ENST00000507305 FHOD3Q2V2M9 1422 aa30.11■■■□□ 2.41
FAM200B-211ENST00000507305 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP30.1■■■□□ 2.41
FAM200B-211ENST00000507305 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa30.1■■■□□ 2.41
FAM200B-211ENST00000507305 CLIP1P30622 1438 aa30.05■■■□□ 2.4
FAM200B-211ENST00000507305 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa30.05■■■□□ 2.4
FAM200B-211ENST00000507305 ADCY10Q96PN6 1610 aa30.03■■■□□ 2.4
FAM200B-211ENST00000507305 PLB1Q6P1J6 1458 aa30.02■■■□□ 2.4
FAM200B-211ENST00000507305 ABCC2Q92887 1545 aa30.01■■■□□ 2.39
FAM200B-211ENST00000507305 FAM69CQ0P6D2 419 aa29.99■■■□□ 2.39
FAM200B-211ENST00000507305 ABCA8O94911 1581 aa29.98■■■□□ 2.39
FAM200B-211ENST00000507305 CEP162Q5TB80 1403 aa29.98■■■□□ 2.39
FAM200B-211ENST00000507305 ABCC10Q5T3U5 1492 aa29.96■■■□□ 2.39
FAM200B-211ENST00000507305 FMN1Q68DA7 1419 aa29.96■■■□□ 2.39
FAM200B-211ENST00000507305 KDM5BQ9UGL1 1544 aa29.89■■■□□ 2.38
FAM200B-211ENST00000507305 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa29.89■■■□□ 2.37
FAM200B-211ENST00000507305 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP29.84■■■□□ 2.37
FAM200B-211ENST00000507305 KDM6BO15054 1643 aa29.83■■■□□ 2.37
FAM200B-211ENST00000507305 ARID3CA6NKF2 412 aa29.83■■■□□ 2.37
FAM200B-211ENST00000507305 DIP2BQ9P265 1576 aa29.82■■■□□ 2.36
FAM200B-211ENST00000507305 MAPKBP1O60336 1514 aa29.81■■■□□ 2.36
FAM200B-211ENST00000507305 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP29.8■■■□□ 2.36
FAM200B-211ENST00000507305 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP29.79■■■□□ 2.36
FAM200B-211ENST00000507305 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
FAM200B-211ENST00000507305 ATP10BO94823 1461 aa29.79■■■□□ 2.36
FAM200B-211ENST00000507305 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP29.78■■■□□ 2.36
FAM200B-211ENST00000507305 ASXL2Q76L83 1435 aa29.75■■■□□ 2.35
FAM200B-211ENST00000507305 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa29.74■■■□□ 2.35
FAM200B-211ENST00000507305 HECW1Q76N89 1606 aa29.71■■■□□ 2.35
FAM200B-211ENST00000507305 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
FAM200B-211ENST00000507305 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
FAM200B-211ENST00000507305 PLEKHD1A6NEE1 506 aa29.65■■■□□ 2.34
FAM200B-211ENST00000507305 FYCO1Q9BQS8 1478 aa29.65■■■□□ 2.34
FAM200B-211ENST00000507305 WDR7Q9Y4E6 1490 aa29.64■■■□□ 2.34
FAM200B-211ENST00000507305 TSPOAP1O95153 1857 aa29.62■■■□□ 2.33
FAM200B-211ENST00000507305 KCNH8Q96L42 1107 aa29.62■■■□□ 2.33
FAM200B-211ENST00000507305 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP29.62■■■□□ 2.33
FAM200B-211ENST00000507305 VPS8Q8N3P4 1428 aa29.61■■■□□ 2.33
FAM200B-211ENST00000507305 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
FAM200B-211ENST00000507305 ADGRL1O94910 1474 aa29.57■■■□□ 2.32
FAM200B-211ENST00000507305 CCDC18Q5T9S5 1454 aa29.57■■■□□ 2.32
FAM200B-211ENST00000507305 HECW2Q9P2P5 1572 aa29.52■■■□□ 2.32
FAM200B-211ENST00000507305 GLI2P10070 1586 aa29.51■■■□□ 2.31
FAM200B-211ENST00000507305 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa29.5■■■□□ 2.31
FAM200B-211ENST00000507305 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
FAM200B-211ENST00000507305 APLP2Q06481 763 aa29.39■■■□□ 2.3
FAM200B-211ENST00000507305 CD109Q6YHK3 1445 aa29.38■■■□□ 2.29
FAM200B-211ENST00000507305 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
FAM200B-211ENST00000507305 MTUS2Q5JR59 1369 aa29.35■■■□□ 2.29
FAM200B-211ENST00000507305 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa29.34■■■□□ 2.29
FAM200B-211ENST00000507305 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP29.33■■■□□ 2.29
FAM200B-211ENST00000507305 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa29.33■■■□□ 2.29
FAM200B-211ENST00000507305 ABCA9Q8IUA7 1624 aa29.33■■■□□ 2.29
FAM200B-211ENST00000507305 CFAP43Q8NDM7 1665 aa29.33■■■□□ 2.29
FAM200B-211ENST00000507305 MAP3K1Q13233 1512 aa29.3■■■□□ 2.28
FAM200B-211ENST00000507305 FBXO41Q8TF61 875 aa29.3■■■□□ 2.28
FAM200B-211ENST00000507305 TIAM1Q13009 1591 aa29.3■■■□□ 2.28
FAM200B-211ENST00000507305 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP29.3■■■□□ 2.28
FAM200B-211ENST00000507305 KIF14Q15058 1648 aa29.28■■■□□ 2.28
FAM200B-211ENST00000507305 TEX14Q8IWB6 1497 aa29.26■■■□□ 2.27
FAM200B-211ENST00000507305 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa29.23■■■□□ 2.27
FAM200B-211ENST00000507305 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
FAM200B-211ENST00000507305 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa29.22■■■□□ 2.27
FAM200B-211ENST00000507305 TTC37Q6PGP7 1564 aa29.21■■■□□ 2.27
FAM200B-211ENST00000507305 PLCH2O75038 1416 aa29.19■■■□□ 2.26
FAM200B-211ENST00000507305 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa29.14■■■□□ 2.26
FAM200B-211ENST00000507305 PHLDB1Q86UU1 1377 aa29.13■■■□□ 2.25
FAM200B-211ENST00000507305 CCNB3Q8WWL7 1395 aa29.12■■■□□ 2.25
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