RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507305.5

FAM200B-211, Transcript of family with sequence similarity 200 member B, humanhuman

TSL 2

Gene FAM200B, Length 800 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200B-211ENST00000507305 NISCHQ9Y2I1 1504 aa44.57■■■■■ 4.73
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FAM200B-211ENST00000507305 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP37.17■■■■□ 3.54
FAM200B-211ENST00000507305 NACADO15069 1562 aa37.04■■■■□ 3.52
FAM200B-211ENST00000507305 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa36.98■■■■□ 3.51
FAM200B-211ENST00000507305 MYO15BQ96JP2 1530 aa36.91■■■■□ 3.5
FAM200B-211ENST00000507305 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa36.88■■■■□ 3.49
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FAM200B-211ENST00000507305 SCRIBQ14160 1630 aa36.01■■■■□ 3.35
FAM200B-211ENST00000507305 BICRAQ9NZM4 1560 aa35.81■■■■□ 3.32
FAM200B-211ENST00000507305 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa35.48■■■■□ 3.27
FAM200B-211ENST00000507305 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa35.38■■■■□ 3.25
FAM200B-211ENST00000507305 CECR2Q9BXF3 1484 aa35.23■■■■□ 3.23
FAM200B-211ENST00000507305 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.14■■■■□ 3.22
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FAM200B-211ENST00000507305 SMARCA4P51532 1647 aa34.48■■■■□ 3.11
FAM200B-211ENST00000507305 MROH2BQ7Z745 1585 aa34.34■■■■□ 3.09
FAM200B-211ENST00000507305 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa34.26■■■■□ 3.07
FAM200B-211ENST00000507305 SMARCA2P51531 1590 aa34.21■■■■□ 3.07
FAM200B-211ENST00000507305 NCAPD3P42695 1498 aa34.2■■■■□ 3.06
FAM200B-211ENST00000507305 PEG3Q9GZU2 1588 aa34.13■■■■□ 3.05
FAM200B-211ENST00000507305 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP34.11■■■■□ 3.05
FAM200B-211ENST00000507305 CUX2O14529 1486 aa34.03■■■■□ 3.04
FAM200B-211ENST00000507305 HMGXB3Q12766 1538 aa33.99■■■■□ 3.03
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FAM200B-211ENST00000507305 WIZO95785 1651 aa33.97■■■■□ 3.03
FAM200B-211ENST00000507305 ERCC6Q03468 1493 aa33.68■■■□□ 2.98
FAM200B-211ENST00000507305 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP33.64■■■□□ 2.98
FAM200B-211ENST00000507305 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP33.6■■■□□ 2.97
FAM200B-211ENST00000507305 TRIM41Q8WV44 630 aa33.31■■■□□ 2.92
FAM200B-211ENST00000507305 CCDC88BA6NC98 1476 aa33.3■■■□□ 2.92
FAM200B-211ENST00000507305 CADPSQ9ULU8 1353 aa33.24■■■□□ 2.91
FAM200B-211ENST00000507305 NESP48681 1621 aa33.23■■■□□ 2.91
FAM200B-211ENST00000507305 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.2■■■□□ 2.91
FAM200B-211ENST00000507305 CFTRP13569 1480 aa33.08■■■□□ 2.89
FAM200B-211ENST00000507305 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33.04■■■□□ 2.88
FAM200B-211ENST00000507305 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.03■■■□□ 2.88
FAM200B-211ENST00000507305 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP32.84■■■□□ 2.85
FAM200B-211ENST00000507305 FANCD2Q9BXW9 1451 aa32.82■■■□□ 2.84
FAM200B-211ENST00000507305 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.78■■■□□ 2.84
FAM200B-211ENST00000507305 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.74■■■□□ 2.83
FAM200B-211ENST00000507305 PRDM2Q13029 1718 aa32.74■■■□□ 2.83
FAM200B-211ENST00000507305 MRC2Q9UBG0 1479 aa32.62■■■□□ 2.81
FAM200B-211ENST00000507305 WDR62O43379 1518 aa32.47■■■□□ 2.79
FAM200B-211ENST00000507305 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP32.45■■■□□ 2.78
FAM200B-211ENST00000507305 ABCC8Q09428 1581 aa32.39■■■□□ 2.78
FAM200B-211ENST00000507305 TOPBP1Q92547 1522 aa32.32■■■□□ 2.76
FAM200B-211ENST00000507305 OSCARQ8IYS5 282 aa32.32■■■□□ 2.76
FAM200B-211ENST00000507305 DNMBPQ6XZF7 1577 aa32.3■■■□□ 2.76
FAM200B-211ENST00000507305 CUX1P39880 1505 aa32.19■■■□□ 2.74
FAM200B-211ENST00000507305 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP32.16■■■□□ 2.74
FAM200B-211ENST00000507305 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP32.07■■■□□ 2.72
FAM200B-211ENST00000507305 IFT140Q96RY7 1462 aa32.06■■■□□ 2.72
FAM200B-211ENST00000507305 FGD5Q6ZNL6 1462 aa32.05■■■□□ 2.72
FAM200B-211ENST00000507305 SOGA1O94964 1423 aa32.01■■■□□ 2.72
FAM200B-211ENST00000507305 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa32■■■□□ 2.71
FAM200B-211ENST00000507305 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa32■■■□□ 2.71
FAM200B-211ENST00000507305 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa32■■■□□ 2.71
FAM200B-211ENST00000507305 TOP2BQ02880 1626 aa32■■■□□ 2.71
FAM200B-211ENST00000507305 SYNJ1O43426 1573 aa31.99■■■□□ 2.71
FAM200B-211ENST00000507305 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa31.97■■■□□ 2.71
FAM200B-211ENST00000507305 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.95■■■□□ 2.7
FAM200B-211ENST00000507305 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP31.9■■■□□ 2.7
FAM200B-211ENST00000507305 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP31.85■■■□□ 2.69
FAM200B-211ENST00000507305 ARHGEF11O15085 1522 aa31.8■■■□□ 2.68
FAM200B-211ENST00000507305 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP31.78■■■□□ 2.68
FAM200B-211ENST00000507305 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP31.77■■■□□ 2.68
FAM200B-211ENST00000507305 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa31.76■■■□□ 2.68
FAM200B-211ENST00000507305 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31.69■■■□□ 2.66
FAM200B-211ENST00000507305 WDR97A6NE52 1622 aa31.68■■■□□ 2.66
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FAM200B-211ENST00000507305 TRHP20396 242 aaPredicted RBP31.63■■■□□ 2.65
FAM200B-211ENST00000507305 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.61■■■□□ 2.65
FAM200B-211ENST00000507305 GRIN2BQ13224 1484 aa31.56■■■□□ 2.64
FAM200B-211ENST00000507305 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa31.54■■■□□ 2.64
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FAM200B-211ENST00000507305 KIF27Q86VH2 1401 aa31.49■■■□□ 2.63
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FAM200B-211ENST00000507305 ARAP1Q96P48 1450 aa31.44■■■□□ 2.62
FAM200B-211ENST00000507305 PBRM1Q86U86 1689 aa31.43■■■□□ 2.62
FAM200B-211ENST00000507305 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP31.42■■■□□ 2.62
FAM200B-211ENST00000507305 FBLN2P98095 1184 aa31.4■■■□□ 2.62
FAM200B-211ENST00000507305 ERICH3Q5RHP9 1530 aa31.38■■■□□ 2.61
FAM200B-211ENST00000507305 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP31.36■■■□□ 2.61
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FAM200B-211ENST00000507305 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa31.28■■■□□ 2.6
FAM200B-211ENST00000507305 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.27■■■□□ 2.6
FAM200B-211ENST00000507305 ADAMTS12P58397 1594 aa31.22■■■□□ 2.59
FAM200B-211ENST00000507305 CHD1O14646 1710 aa31.21■■■□□ 2.59
FAM200B-211ENST00000507305 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa31.16■■■□□ 2.58
FAM200B-211ENST00000507305 GRIN2AQ12879 1464 aa31.14■■■□□ 2.57
FAM200B-211ENST00000507305 CUL7Q14999 1698 aa31.13■■■□□ 2.57
FAM200B-211ENST00000507305 EEA1Q15075 1411 aa31.11■■■□□ 2.57
FAM200B-211ENST00000507305 CSRNP3Q8WYN3 585 aa31.09■■■□□ 2.57
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