RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504911.1

AP002748.1-201, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene AP002748.1, Length 580 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP002748.1-201ENST00000504911 JPH4Q96JJ6 628 aa36■■■■□ 3.35
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AP002748.1-201ENST00000504911 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.98■■■■□ 3.35
AP002748.1-201ENST00000504911 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP35.95■■■■□ 3.35
AP002748.1-201ENST00000504911 EEA1Q15075 1411 aa35.85■■■■□ 3.33
AP002748.1-201ENST00000504911 PRXQ9BXM0 1461 aa35.85■■■■□ 3.33
AP002748.1-201ENST00000504911 CHIC1Q5VXU3 224 aa35.83■■■■□ 3.33
AP002748.1-201ENST00000504911 IQGAP2Q13576 1575 aa35.81■■■■□ 3.32
AP002748.1-201ENST00000504911 CSRNP3Q8WYN3 585 aa35.75■■■■□ 3.31
AP002748.1-201ENST00000504911 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa35.66■■■■□ 3.3
AP002748.1-201ENST00000504911 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa35.66■■■■□ 3.3
AP002748.1-201ENST00000504911 UGGT2Q9NYU1 1516 aa35.63■■■■□ 3.29
AP002748.1-201ENST00000504911 DISP1Q96F81 1524 aa35.56■■■■□ 3.28
AP002748.1-201ENST00000504911 TNIKQ9UKE5 1360 aa35.54■■■■□ 3.28
AP002748.1-201ENST00000504911 PTPRGP23470 1445 aa35.5■■■■□ 3.27
AP002748.1-201ENST00000504911 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP35.49■■■■□ 3.27
AP002748.1-201ENST00000504911 KIAA0556O60303 1618 aa35.47■■■■□ 3.27
AP002748.1-201ENST00000504911 KIF21BO75037 1637 aa35.46■■■■□ 3.27
AP002748.1-201ENST00000504911 GOLGA3Q08378 1498 aa35.44■■■■□ 3.26
AP002748.1-201ENST00000504911 TRHP20396 242 aaPredicted RBP35.43■■■■□ 3.26
AP002748.1-201ENST00000504911 ADCY10Q96PN6 1610 aa35.42■■■■□ 3.26
AP002748.1-201ENST00000504911 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP35.33■■■■□ 3.25
AP002748.1-201ENST00000504911 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP35.31■■■■□ 3.24
AP002748.1-201ENST00000504911 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa35.29■■■■□ 3.24
AP002748.1-201ENST00000504911 UACAQ9BZF9 1416 aa35.29■■■■□ 3.24
AP002748.1-201ENST00000504911 MAPKBP1O60336 1514 aa35.27■■■■□ 3.24
AP002748.1-201ENST00000504911 ABCC2Q92887 1545 aa35.24■■■■□ 3.23
AP002748.1-201ENST00000504911 SAMD9Q5K651 1589 aa35.21■■■■□ 3.23
AP002748.1-201ENST00000504911 KDM5BQ9UGL1 1544 aa35.11■■■■□ 3.21
AP002748.1-201ENST00000504911 ABCC10Q5T3U5 1492 aa35.1■■■■□ 3.21
AP002748.1-201ENST00000504911 ABCA8O94911 1581 aa35.1■■■■□ 3.21
AP002748.1-201ENST00000504911 PLB1Q6P1J6 1458 aa35.09■■■■□ 3.21
AP002748.1-201ENST00000504911 KIF13AQ9H1H9 1805 aa35.08■■■■□ 3.21
AP002748.1-201ENST00000504911 UBTFP17480 764 aaKnown RBP35.07■■■■□ 3.2
AP002748.1-201ENST00000504911 EFCAB5A4FU69 1503 aa35.06■■■■□ 3.2
AP002748.1-201ENST00000504911 P3H3Q8IVL6 736 aa35.04■■■■□ 3.2
AP002748.1-201ENST00000504911 DIP2BQ9P265 1576 aa35.04■■■■□ 3.2
AP002748.1-201ENST00000504911 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP35.01■■■■□ 3.19
AP002748.1-201ENST00000504911 ASXL2Q76L83 1435 aa34.99■■■■□ 3.19
AP002748.1-201ENST00000504911 EHMT2Q96KQ7 1210 aa34.98■■■■□ 3.19
AP002748.1-201ENST00000504911 FAM69CQ0P6D2 419 aa34.97■■■■□ 3.19
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AP002748.1-201ENST00000504911 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa34.88■■■■□ 3.17
AP002748.1-201ENST00000504911 GLI2P10070 1586 aa34.86■■■■□ 3.17
AP002748.1-201ENST00000504911 WDR7Q9Y4E6 1490 aa34.83■■■■□ 3.17
AP002748.1-201ENST00000504911 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa34.81■■■■□ 3.16
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AP002748.1-201ENST00000504911 ATP10BO94823 1461 aa34.78■■■■□ 3.16
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AP002748.1-201ENST00000504911 TSPOAP1O95153 1857 aa34.67■■■■□ 3.14
AP002748.1-201ENST00000504911 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa34.66■■■■□ 3.14
AP002748.1-201ENST00000504911 ARID3CA6NKF2 412 aa34.65■■■■□ 3.14
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AP002748.1-201ENST00000504911 CLIP1P30622 1438 aa34.55■■■■□ 3.12
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AP002748.1-201ENST00000504911 CD109Q6YHK3 1445 aa34.5■■■■□ 3.11
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AP002748.1-201ENST00000504911 MTUS2Q5JR59 1369 aa33.91■■■■□ 3.02
AP002748.1-201ENST00000504911 RAPGEF3O95398 923 aa33.9■■■■□ 3.02
AP002748.1-201ENST00000504911 PREX2Q70Z35 1606 aa33.9■■■■□ 3.02
AP002748.1-201ENST00000504911 ARHGAP5Q13017 1502 aa33.89■■■■□ 3.02
AP002748.1-201ENST00000504911 ADGRL1O94910 1474 aa33.89■■■■□ 3.02
AP002748.1-201ENST00000504911 RICTORQ6R327 1708 aa33.88■■■■□ 3.01
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