RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000500148.6

CKMT2-AS1-201, CKMT2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CKMT2-AS1, Length 2,224 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKMT2-AS1-201ENST00000500148 ARAP1Q96P48 1450 aa16.45■□□□□ 0.22
CKMT2-AS1-201ENST00000500148 VPS8Q8N3P4 1428 aa16.45■□□□□ 0.22
CKMT2-AS1-201ENST00000500148 ARXQ96QS3 562 aa16.41■□□□□ 0.22
CKMT2-AS1-201ENST00000500148 ERCC6Q03468 1493 aa16.41■□□□□ 0.22
CKMT2-AS1-201ENST00000500148 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa16.41■□□□□ 0.22
CKMT2-AS1-201ENST00000500148 CUL7Q14999 1698 aa16.41■□□□□ 0.22
CKMT2-AS1-201ENST00000500148 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
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CKMT2-AS1-201ENST00000500148 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
CKMT2-AS1-201ENST00000500148 IFT140Q96RY7 1462 aa16.36■□□□□ 0.21
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CKMT2-AS1-201ENST00000500148 ARHGEF11O15085 1522 aa15.8■□□□□ 0.12
CKMT2-AS1-201ENST00000500148 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa15.8■□□□□ 0.12
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CKMT2-AS1-201ENST00000500148 ITGAEP38570 1179 aa15.79■□□□□ 0.12
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CKMT2-AS1-201ENST00000500148 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.11
CKMT2-AS1-201ENST00000500148 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
CKMT2-AS1-201ENST00000500148 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
CKMT2-AS1-201ENST00000500148 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP15.74■□□□□ 0.11
CKMT2-AS1-201ENST00000500148 MYOM3Q5VTT5 1437 aa15.74■□□□□ 0.11
CKMT2-AS1-201ENST00000500148 SHROOM2Q13796 1616 aa15.73■□□□□ 0.11
CKMT2-AS1-201ENST00000500148 ABCA8O94911 1581 aa15.73■□□□□ 0.11
CKMT2-AS1-201ENST00000500148 ERCC6L2Q5T890 1561 aa15.71■□□□□ 0.11
CKMT2-AS1-201ENST00000500148 PTPRKQ15262 1439 aa15.7■□□□□ 0.1
CKMT2-AS1-201ENST00000500148 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
CKMT2-AS1-201ENST00000500148 CLASP1Q7Z460 1538 aa15.69■□□□□ 0.1
CKMT2-AS1-201ENST00000500148 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa15.68■□□□□ 0.1
CKMT2-AS1-201ENST00000500148 PTPRGP23470 1445 aa15.67■□□□□ 0.1
CKMT2-AS1-201ENST00000500148 ATP10BO94823 1461 aa15.66■□□□□ 0.1
CKMT2-AS1-201ENST00000500148 PTPN23Q9H3S7 1636 aa15.66■□□□□ 0.1
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