RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495423.1

SIMC1-208, Transcript of SUMO interacting motifs containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene SIMC1, Length 913 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIMC1-208ENST00000495423 JPH4Q96JJ6 628 aa41.19■■■■■ 4.18
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SIMC1-208ENST00000495423 ADCY10Q96PN6 1610 aa40.98■■■■■ 4.15
SIMC1-208ENST00000495423 CUL7Q14999 1698 aa40.94■■■■■ 4.15
SIMC1-208ENST00000495423 DIP2BQ9P265 1576 aa40.92■■■■■ 4.14
SIMC1-208ENST00000495423 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa40.92■■■■■ 4.14
SIMC1-208ENST00000495423 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP40.87■■■■■ 4.13
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SIMC1-208ENST00000495423 IGF1RP08069 1367 aa40.86■■■■■ 4.13
SIMC1-208ENST00000495423 KIF27Q86VH2 1401 aa40.84■■■■■ 4.13
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SIMC1-208ENST00000495423 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa40.5■■■■■ 4.07
SIMC1-208ENST00000495423 TNIKQ9UKE5 1360 aa40.48■■■■■ 4.07
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SIMC1-208ENST00000495423 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa40.34■■■■■ 4.05
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SIMC1-208ENST00000495423 UACAQ9BZF9 1416 aa40.27■■■■■ 4.04
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SIMC1-208ENST00000495423 KDM5BQ9UGL1 1544 aa40.2■■■■■ 4.03
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SIMC1-208ENST00000495423 FHOD3Q2V2M9 1422 aa38.97■■■■□ 3.83
SIMC1-208ENST00000495423 MADDQ8WXG6 1647 aa38.96■■■■□ 3.83
SIMC1-208ENST00000495423 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa38.94■■■■□ 3.82
SIMC1-208ENST00000495423 CFAP74Q9C0B2 1584 aa38.93■■■■□ 3.82
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SIMC1-208ENST00000495423 TTC37Q6PGP7 1564 aa38.82■■■■□ 3.8
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SIMC1-208ENST00000495423 SCAPERQ9BY12 1400 aa38.51■■■■□ 3.76
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