RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495423.1

SIMC1-208, Transcript of SUMO interacting motifs containing 1, human

TSL 2

Gene SIMC1, Length 913 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SIMC1-208	ENST00000495423	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		58.68	■■■■■ 6.98
SIMC1-208	ENST00000495423	ABCC9	O60706	1549 aa		53.13	■■■■■ 6.1
SIMC1-208	ENST00000495423	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		52.97	■■■■■ 6.07
SIMC1-208	ENST00000495423	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		50.51	■■■■■ 5.68
SIMC1-208	ENST00000495423	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		50.16	■■■■■ 5.62
SIMC1-208	ENST00000495423	NACAD	O15069	1562 aa		50.09	■■■■■ 5.61
SIMC1-208	ENST00000495423	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		49.52	■■■■■ 5.52
SIMC1-208	ENST00000495423	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		49.45	■■■■■ 5.51
SIMC1-208	ENST00000495423	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		49.31	■■■■■ 5.48
SIMC1-208	ENST00000495423	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	49.31	■■■■■ 5.48
SIMC1-208	ENST00000495423	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		49.08	■■■■■ 5.45
SIMC1-208	ENST00000495423	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	48.56	■■■■■ 5.36
SIMC1-208	ENST00000495423	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		48.52	■■■■■ 5.36
SIMC1-208	ENST00000495423	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		48.42	■■■■■ 5.34
SIMC1-208	ENST00000495423	SCRIB	Q14160	1630 aa		48.09	■■■■■ 5.29
SIMC1-208	ENST00000495423	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		48.07	■■■■■ 5.29
SIMC1-208	ENST00000495423	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		47.93	■■■■■ 5.26
SIMC1-208	ENST00000495423	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	47.88	■■■■■ 5.25
SIMC1-208	ENST00000495423	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		46.38	■■■■■ 5.02
SIMC1-208	ENST00000495423	NCAPD3	P42695	1498 aa		46.2	■■■■■ 4.99
SIMC1-208	ENST00000495423	CUX2	O14529	1486 aa		46.04	■■■■■ 4.96
SIMC1-208	ENST00000495423	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		45.98	■■■■■ 4.95
SIMC1-208	ENST00000495423	SMARCA4	P51532	1647 aa		45.9	■■■■■ 4.94
SIMC1-208	ENST00000495423	ERCC6	Q03468	1493 aa		45.9	■■■■■ 4.94
SIMC1-208	ENST00000495423	SMARCA2	P51531	1590 aa		45.88	■■■■■ 4.94
SIMC1-208	ENST00000495423	HMGXB3	Q12766	1538 aa		45.87	■■■■■ 4.93
SIMC1-208	ENST00000495423	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	45.59	■■■■■ 4.89
SIMC1-208	ENST00000495423	NES	P48681	1621 aa		45.55	■■■■■ 4.88
SIMC1-208	ENST00000495423	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		45.51	■■■■■ 4.88
SIMC1-208	ENST00000495423	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	45.5	■■■■■ 4.87
SIMC1-208	ENST00000495423	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	45.28	■■■■■ 4.84
SIMC1-208	ENST00000495423	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		45.28	■■■■■ 4.84
SIMC1-208	ENST00000495423	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		45.18	■■■■■ 4.82
SIMC1-208	ENST00000495423	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		45.09	■■■■■ 4.81
SIMC1-208	ENST00000495423	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		44.93	■■■■■ 4.78
SIMC1-208	ENST00000495423	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		44.72	■■■■■ 4.75
SIMC1-208	ENST00000495423	WIZ	O95785	1651 aa		44.67	■■■■■ 4.74
SIMC1-208	ENST00000495423	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		44.59	■■■■■ 4.73
SIMC1-208	ENST00000495423	WDR62	O43379	1518 aa		44.55	■■■■■ 4.72
SIMC1-208	ENST00000495423	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		44.34	■■■■■ 4.69
SIMC1-208	ENST00000495423	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		44.23	■■■■■ 4.67
SIMC1-208	ENST00000495423	CFTR	P13569	1480 aa		44.18	■■■■■ 4.66
SIMC1-208	ENST00000495423	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	44.08	■■■■■ 4.65
SIMC1-208	ENST00000495423	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	44.07	■■■■■ 4.65
SIMC1-208	ENST00000495423	TRIM41	Q8WV44	630 aa		44.07	■■■■■ 4.65
SIMC1-208	ENST00000495423	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	43.92	■■■■■ 4.62
SIMC1-208	ENST00000495423	PRDM2	Q13029	1718 aa		43.91	■■■■■ 4.62
SIMC1-208	ENST00000495423	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		43.76	■■■■■ 4.6
SIMC1-208	ENST00000495423	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		43.52	■■■■■ 4.56
SIMC1-208	ENST00000495423	IFT140	Q96RY7	1462 aa		43.46	■■■■■ 4.55
SIMC1-208	ENST00000495423	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	43.41	■■■■■ 4.54
SIMC1-208	ENST00000495423	TOPBP1	Q92547	1522 aa		43.38	■■■■■ 4.53
SIMC1-208	ENST00000495423	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		43.37	■■■■■ 4.53
SIMC1-208	ENST00000495423	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		43.37	■■■■■ 4.53
SIMC1-208	ENST00000495423	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		43.37	■■■■■ 4.53
SIMC1-208	ENST00000495423	ABCC8	Q09428	1581 aa		43.29	■■■■■ 4.52
SIMC1-208	ENST00000495423	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	43.24	■■■■■ 4.51
SIMC1-208	ENST00000495423	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		43.22	■■■■■ 4.51
SIMC1-208	ENST00000495423	ARHGEF11	O15085	1522 aa		43.15	■■■■■ 4.5
SIMC1-208	ENST00000495423	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	43.09	■■■■■ 4.49
SIMC1-208	ENST00000495423	CHD1	O14646	1710 aa		43.04	■■■■■ 4.48
SIMC1-208	ENST00000495423	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	42.94	■■■■■ 4.46
SIMC1-208	ENST00000495423	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	42.9	■■■■■ 4.46
SIMC1-208	ENST00000495423	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		42.72	■■■■■ 4.43
SIMC1-208	ENST00000495423	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		42.7	■■■■■ 4.43
SIMC1-208	ENST00000495423	ARAP1	Q96P48	1450 aa		42.68	■■■■■ 4.42
SIMC1-208	ENST00000495423	WDR97	A6NE52	1622 aa		42.68	■■■■■ 4.42
SIMC1-208	ENST00000495423	SOGA1	O94964	1423 aa		42.64	■■■■■ 4.42
SIMC1-208	ENST00000495423	FBLN2	P98095	1184 aa		42.63	■■■■■ 4.41
SIMC1-208	ENST00000495423	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	42.58	■■■■■ 4.41
SIMC1-208	ENST00000495423	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		42.57	■■■■■ 4.41
SIMC1-208	ENST00000495423	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		42.52	■■■■■ 4.4
SIMC1-208	ENST00000495423	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		42.49	■■■■■ 4.39
SIMC1-208	ENST00000495423	CUX1	P39880	1505 aa		42.48	■■■■■ 4.39
SIMC1-208	ENST00000495423	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	42.44	■■■■■ 4.38
SIMC1-208	ENST00000495423	SYNJ1	O43426	1573 aa		42.41	■■■■■ 4.38
SIMC1-208	ENST00000495423	GRIN2B	Q13224	1484 aa		42.36	■■■■■ 4.37
SIMC1-208	ENST00000495423	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	42.34	■■■■■ 4.37
SIMC1-208	ENST00000495423	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	42.3	■■■■■ 4.36
SIMC1-208	ENST00000495423	PBRM1	Q86U86	1689 aa		42.3	■■■■■ 4.36
SIMC1-208	ENST00000495423	SYNJ2	O15056	1496 aa		42.29	■■■■■ 4.36
SIMC1-208	ENST00000495423	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		42.16	■■■■■ 4.34
SIMC1-208	ENST00000495423	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		42.13	■■■■■ 4.33
SIMC1-208	ENST00000495423	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		42.1	■■■■■ 4.33
SIMC1-208	ENST00000495423	GRIN2A	Q12879	1464 aa		41.84	■■■■■ 4.29
SIMC1-208	ENST00000495423	ADAMTS12	P58397	1594 aa		41.81	■■■■■ 4.28
SIMC1-208	ENST00000495423	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		41.8	■■■■■ 4.28
SIMC1-208	ENST00000495423	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	41.78	■■■■■ 4.28
SIMC1-208	ENST00000495423	TOP2B	Q02880	1626 aa		41.75	■■■■■ 4.27
SIMC1-208	ENST00000495423	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		41.75	■■■■■ 4.27
SIMC1-208	ENST00000495423	CEP170	Q5SW79	1584 aa		41.73	■■■■■ 4.27
SIMC1-208	ENST00000495423	NUP160	Q12769	1436 aa		41.72	■■■■■ 4.27
SIMC1-208	ENST00000495423	SHROOM2	Q13796	1616 aa		41.67	■■■■■ 4.26
SIMC1-208	ENST00000495423	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	41.67	■■■■■ 4.26
SIMC1-208	ENST00000495423	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		41.61	■■■■■ 4.25
SIMC1-208	ENST00000495423	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		41.58	■■■■■ 4.25
SIMC1-208	ENST00000495423	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	41.4	■■■■■ 4.22
SIMC1-208	ENST00000495423	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		41.37	■■■■■ 4.21
SIMC1-208	ENST00000495423	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	41.28	■■■■■ 4.2
SIMC1-208	ENST00000495423	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		41.24	■■■■■ 4.19

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