RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495191.5

PRRT1-210, Transcript of proline rich transmembrane protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene PRRT1, Length 2,782 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1-210ENST00000495191 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.69■■□□□ 1.06
PRRT1-210ENST00000495191 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
PRRT1-210ENST00000495191 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.61■■□□□ 1.05
PRRT1-210ENST00000495191 ERCC6Q03468 1493 aa21.59■■□□□ 1.05
PRRT1-210ENST00000495191 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.53■■□□□ 1.04
PRRT1-210ENST00000495191 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
PRRT1-210ENST00000495191 WDR97A6NE52 1622 aa21.52■■□□□ 1.04
PRRT1-210ENST00000495191 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
PRRT1-210ENST00000495191 ARAP1Q96P48 1450 aa21.5■■□□□ 1.03
PRRT1-210ENST00000495191 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
PRRT1-210ENST00000495191 P3H3Q8IVL6 736 aa21.49■■□□□ 1.03
PRRT1-210ENST00000495191 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.48■■□□□ 1.03
PRRT1-210ENST00000495191 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.46■■□□□ 1.03
PRRT1-210ENST00000495191 WDR62O43379 1518 aa21.43■■□□□ 1.02
PRRT1-210ENST00000495191 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.43■■□□□ 1.02
PRRT1-210ENST00000495191 KCNH8Q96L42 1107 aa21.42■■□□□ 1.02
PRRT1-210ENST00000495191 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
PRRT1-210ENST00000495191 CUL7Q14999 1698 aa21.4■■□□□ 1.02
PRRT1-210ENST00000495191 IFT140Q96RY7 1462 aa21.35■■□□□ 1.01
PRRT1-210ENST00000495191 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
PRRT1-210ENST00000495191 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
PRRT1-210ENST00000495191 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
PRRT1-210ENST00000495191 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.32■■□□□ 1
PRRT1-210ENST00000495191 SIN3AQ96ST3 1273 aa21.31■■□□□ 1
PRRT1-210ENST00000495191 PBRM1Q86U86 1689 aa21.29■■□□□ 1
PRRT1-210ENST00000495191 GRIN2BQ13224 1484 aa21.28■■□□□ 1
PRRT1-210ENST00000495191 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.25■□□□□ 0.99
PRRT1-210ENST00000495191 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.24■□□□□ 0.99
PRRT1-210ENST00000495191 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.24■□□□□ 0.99
PRRT1-210ENST00000495191 CLSPNQ9HAW4 1339 aa21.23■□□□□ 0.99
PRRT1-210ENST00000495191 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.22■□□□□ 0.99
PRRT1-210ENST00000495191 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
PRRT1-210ENST00000495191 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
PRRT1-210ENST00000495191 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
PRRT1-210ENST00000495191 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
PRRT1-210ENST00000495191 ADAMTS12P58397 1594 aa21.19■□□□□ 0.98
PRRT1-210ENST00000495191 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.18■□□□□ 0.98
PRRT1-210ENST00000495191 BCANQ96GW7 911 aa21.18■□□□□ 0.98
PRRT1-210ENST00000495191 FBLN2P98095 1184 aa21.18■□□□□ 0.98
PRRT1-210ENST00000495191 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.14■□□□□ 0.97
PRRT1-210ENST00000495191 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
PRRT1-210ENST00000495191 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.11■□□□□ 0.97
PRRT1-210ENST00000495191 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.96
PRRT1-210ENST00000495191 GRIN2AQ12879 1464 aa21.05■□□□□ 0.96
PRRT1-210ENST00000495191 IQGAP2Q13576 1575 aa21.03■□□□□ 0.96
PRRT1-210ENST00000495191 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.03■□□□□ 0.96
PRRT1-210ENST00000495191 MAPKBP1O60336 1514 aa21.02■□□□□ 0.96
PRRT1-210ENST00000495191 SAMD9Q5K651 1589 aa21.02■□□□□ 0.96
PRRT1-210ENST00000495191 TIAM1Q13009 1591 aa21.02■□□□□ 0.96
PRRT1-210ENST00000495191 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
PRRT1-210ENST00000495191 FMN1Q68DA7 1419 aa21.02■□□□□ 0.95
PRRT1-210ENST00000495191 TRIM52Q96A61 297 aa21.01■□□□□ 0.95
PRRT1-210ENST00000495191 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa20.99■□□□□ 0.95
PRRT1-210ENST00000495191 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa20.99■□□□□ 0.95
PRRT1-210ENST00000495191 SYNJ2O15056 1496 aa20.99■□□□□ 0.95
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PRRT1-210ENST00000495191 BCL11AQ9H165 835 aa20.97■□□□□ 0.95
PRRT1-210ENST00000495191 ARID3CA6NKF2 412 aa20.96■□□□□ 0.95
PRRT1-210ENST00000495191 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa20.96■□□□□ 0.95
PRRT1-210ENST00000495191 FKBP8Q14318 412 aa20.94■□□□□ 0.94
PRRT1-210ENST00000495191 MAP3K1Q13233 1512 aa20.92■□□□□ 0.94
PRRT1-210ENST00000495191 CEP170Q5SW79 1584 aa20.91■□□□□ 0.94
PRRT1-210ENST00000495191 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa20.91■□□□□ 0.94
PRRT1-210ENST00000495191 ANP32EQ9BTT0 268 aa20.89■□□□□ 0.93
PRRT1-210ENST00000495191 UGGT2Q9NYU1 1516 aa20.89■□□□□ 0.93
PRRT1-210ENST00000495191 CFAP43Q8NDM7 1665 aa20.88■□□□□ 0.93
PRRT1-210ENST00000495191 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
PRRT1-210ENST00000495191 CHIC2Q9UKJ5 165 aa20.86■□□□□ 0.93
PRRT1-210ENST00000495191 DISP1Q96F81 1524 aa20.86■□□□□ 0.93
PRRT1-210ENST00000495191 JPH4Q96JJ6 628 aa20.85■□□□□ 0.93
PRRT1-210ENST00000495191 MTUS2Q5JR59 1369 aa20.85■□□□□ 0.93
PRRT1-210ENST00000495191 NUP160Q12769 1436 aa20.83■□□□□ 0.93
PRRT1-210ENST00000495191 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa20.82■□□□□ 0.92
PRRT1-210ENST00000495191 KIAA0556O60303 1618 aa20.81■□□□□ 0.92
PRRT1-210ENST00000495191 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa20.8■□□□□ 0.92
PRRT1-210ENST00000495191 ANP32CO43423 234 aa20.8■□□□□ 0.92
PRRT1-210ENST00000495191 TONSLQ96HA7 1378 aa20.77■□□□□ 0.91
PRRT1-210ENST00000495191 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
PRRT1-210ENST00000495191 PTPRKQ15262 1439 aa20.75■□□□□ 0.91
PRRT1-210ENST00000495191 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
PRRT1-210ENST00000495191 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
PRRT1-210ENST00000495191 HECW1Q76N89 1606 aa20.73■□□□□ 0.91
PRRT1-210ENST00000495191 FOXD1Q16676 465 aa20.72■□□□□ 0.91
PRRT1-210ENST00000495191 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa20.72■□□□□ 0.91
PRRT1-210ENST00000495191 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa20.71■□□□□ 0.91
PRRT1-210ENST00000495191 CHD1O14646 1710 aa20.71■□□□□ 0.91
PRRT1-210ENST00000495191 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
PRRT1-210ENST00000495191 CCDC18Q5T9S5 1454 aa20.7■□□□□ 0.9
PRRT1-210ENST00000495191 PLB1Q6P1J6 1458 aa20.69■□□□□ 0.9
PRRT1-210ENST00000495191 NCOA2Q15596 1464 aa20.68■□□□□ 0.9
PRRT1-210ENST00000495191 FGD6Q6ZV73 1430 aa20.67■□□□□ 0.9
PRRT1-210ENST00000495191 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
PRRT1-210ENST00000495191 NEFLP07196 543 aa20.66■□□□□ 0.9
PRRT1-210ENST00000495191 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
PRRT1-210ENST00000495191 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa20.64■□□□□ 0.9
PRRT1-210ENST00000495191 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa20.64■□□□□ 0.89
PRRT1-210ENST00000495191 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP20.63■□□□□ 0.89
PRRT1-210ENST00000495191 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa20.62■□□□□ 0.89
PRRT1-210ENST00000495191 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
PRRT1-210ENST00000495191 MYOM3Q5VTT5 1437 aa20.59■□□□□ 0.89
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