RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489835.6

PRRT4-205, Transcript of proline rich transmembrane protein 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRT4, Length 2,313 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4-205ENST00000489835 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.9■■□□□ 1.9
PRRT4-205ENST00000489835 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.87■■□□□ 1.89
PRRT4-205ENST00000489835 P3H3Q8IVL6 736 aa26.86■■□□□ 1.89
PRRT4-205ENST00000489835 ADAMTS12P58397 1594 aa26.83■■□□□ 1.89
PRRT4-205ENST00000489835 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.83■■□□□ 1.88
PRRT4-205ENST00000489835 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.81■■□□□ 1.88
PRRT4-205ENST00000489835 APLP2Q06481 763 aa26.74■■□□□ 1.87
PRRT4-205ENST00000489835 FBLN2P98095 1184 aa26.73■■□□□ 1.87
PRRT4-205ENST00000489835 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
PRRT4-205ENST00000489835 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.68■■□□□ 1.86
PRRT4-205ENST00000489835 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
PRRT4-205ENST00000489835 GRIN2AQ12879 1464 aa26.64■■□□□ 1.85
PRRT4-205ENST00000489835 SYNJ2O15056 1496 aa26.6■■□□□ 1.85
PRRT4-205ENST00000489835 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.59■■□□□ 1.85
PRRT4-205ENST00000489835 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
PRRT4-205ENST00000489835 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
PRRT4-205ENST00000489835 IQGAP2Q13576 1575 aa26.57■■□□□ 1.84
PRRT4-205ENST00000489835 SAMD9Q5K651 1589 aa26.53■■□□□ 1.84
PRRT4-205ENST00000489835 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.51■■□□□ 1.83
PRRT4-205ENST00000489835 CEP170Q5SW79 1584 aa26.49■■□□□ 1.83
PRRT4-205ENST00000489835 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
PRRT4-205ENST00000489835 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
PRRT4-205ENST00000489835 FMN1Q68DA7 1419 aa26.43■■□□□ 1.82
PRRT4-205ENST00000489835 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.4■■□□□ 1.82
PRRT4-205ENST00000489835 NUP160Q12769 1436 aa26.4■■□□□ 1.82
PRRT4-205ENST00000489835 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.39■■□□□ 1.82
PRRT4-205ENST00000489835 TIAM1Q13009 1591 aa26.37■■□□□ 1.81
PRRT4-205ENST00000489835 JPH4Q96JJ6 628 aa26.36■■□□□ 1.81
PRRT4-205ENST00000489835 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.36■■□□□ 1.81
PRRT4-205ENST00000489835 DISP1Q96F81 1524 aa26.34■■□□□ 1.81
PRRT4-205ENST00000489835 CHD1O14646 1710 aa26.34■■□□□ 1.81
PRRT4-205ENST00000489835 MAP3K1Q13233 1512 aa26.3■■□□□ 1.8
PRRT4-205ENST00000489835 KIAA0556O60303 1618 aa26.3■■□□□ 1.8
PRRT4-205ENST00000489835 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.28■■□□□ 1.8
PRRT4-205ENST00000489835 ARID3CA6NKF2 412 aa26.26■■□□□ 1.79
PRRT4-205ENST00000489835 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.25■■□□□ 1.79
PRRT4-205ENST00000489835 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.24■■□□□ 1.79
PRRT4-205ENST00000489835 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
PRRT4-205ENST00000489835 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.18■■□□□ 1.78
PRRT4-205ENST00000489835 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.77
PRRT4-205ENST00000489835 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.14■■□□□ 1.77
PRRT4-205ENST00000489835 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.13■■□□□ 1.77
PRRT4-205ENST00000489835 HECW1Q76N89 1606 aa26.12■■□□□ 1.77
PRRT4-205ENST00000489835 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
PRRT4-205ENST00000489835 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
PRRT4-205ENST00000489835 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
PRRT4-205ENST00000489835 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
PRRT4-205ENST00000489835 PLB1Q6P1J6 1458 aa26.09■■□□□ 1.77
PRRT4-205ENST00000489835 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26.07■■□□□ 1.76
PRRT4-205ENST00000489835 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.06■■□□□ 1.76
PRRT4-205ENST00000489835 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa26.06■■□□□ 1.76
PRRT4-205ENST00000489835 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.05■■□□□ 1.76
PRRT4-205ENST00000489835 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
PRRT4-205ENST00000489835 ITGAEP38570 1179 aa26.04■■□□□ 1.76
PRRT4-205ENST00000489835 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
PRRT4-205ENST00000489835 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.99■■□□□ 1.75
PRRT4-205ENST00000489835 SHROOM2Q13796 1616 aa25.98■■□□□ 1.75
PRRT4-205ENST00000489835 PTPRGP23470 1445 aa25.98■■□□□ 1.75
PRRT4-205ENST00000489835 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
PRRT4-205ENST00000489835 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.96■■□□□ 1.75
PRRT4-205ENST00000489835 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.96■■□□□ 1.75
PRRT4-205ENST00000489835 NCOA2Q15596 1464 aa25.96■■□□□ 1.75
PRRT4-205ENST00000489835 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
PRRT4-205ENST00000489835 ABCA8O94911 1581 aa25.9■■□□□ 1.74
PRRT4-205ENST00000489835 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
PRRT4-205ENST00000489835 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.86■■□□□ 1.73
PRRT4-205ENST00000489835 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.84■■□□□ 1.73
PRRT4-205ENST00000489835 OSCARQ8IYS5 282 aa25.83■■□□□ 1.73
PRRT4-205ENST00000489835 ATP10BO94823 1461 aa25.83■■□□□ 1.72
PRRT4-205ENST00000489835 ARHGEF11O15085 1522 aa25.82■■□□□ 1.72
PRRT4-205ENST00000489835 UACAQ9BZF9 1416 aa25.79■■□□□ 1.72
PRRT4-205ENST00000489835 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
PRRT4-205ENST00000489835 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.72
PRRT4-205ENST00000489835 PLEKHD1A6NEE1 506 aa25.76■■□□□ 1.71
PRRT4-205ENST00000489835 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.72■■□□□ 1.71
PRRT4-205ENST00000489835 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
PRRT4-205ENST00000489835 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.71■■□□□ 1.71
PRRT4-205ENST00000489835 KIF14Q15058 1648 aa25.69■■□□□ 1.7
PRRT4-205ENST00000489835 ABCC2Q92887 1545 aa25.66■■□□□ 1.7
PRRT4-205ENST00000489835 PTPRKQ15262 1439 aa25.66■■□□□ 1.7
PRRT4-205ENST00000489835 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
PRRT4-205ENST00000489835 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.63■■□□□ 1.69
PRRT4-205ENST00000489835 MIA2Q96PC5 1412 aa25.63■■□□□ 1.69
PRRT4-205ENST00000489835 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.61■■□□□ 1.69
PRRT4-205ENST00000489835 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
PRRT4-205ENST00000489835 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.6■■□□□ 1.69
PRRT4-205ENST00000489835 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
PRRT4-205ENST00000489835 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.6■■□□□ 1.69
PRRT4-205ENST00000489835 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
PRRT4-205ENST00000489835 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
PRRT4-205ENST00000489835 KCNH8Q96L42 1107 aa25.56■■□□□ 1.68
PRRT4-205ENST00000489835 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
PRRT4-205ENST00000489835 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa25.54■■□□□ 1.68
PRRT4-205ENST00000489835 ABCC10Q5T3U5 1492 aa25.54■■□□□ 1.68
PRRT4-205ENST00000489835 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
PRRT4-205ENST00000489835 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.52■■□□□ 1.68
PRRT4-205ENST00000489835 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.5■■□□□ 1.67
PRRT4-205ENST00000489835 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.49■■□□□ 1.67
PRRT4-205ENST00000489835 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.48■■□□□ 1.67
PRRT4-205ENST00000489835 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.46■■□□□ 1.67
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