RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486064.5

CCDC24-208, Transcript of coiled-coil domain containing 24, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC24, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC24-208ENST00000486064 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
CCDC24-208ENST00000486064 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
CCDC24-208ENST00000486064 CUL7Q14999 1698 aa25.52■■□□□ 1.68
CCDC24-208ENST00000486064 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.48■■□□□ 1.67
CCDC24-208ENST00000486064 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
CCDC24-208ENST00000486064 WDR62O43379 1518 aa25.45■■□□□ 1.66
CCDC24-208ENST00000486064 PBRM1Q86U86 1689 aa25.38■■□□□ 1.65
CCDC24-208ENST00000486064 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.37■■□□□ 1.65
CCDC24-208ENST00000486064 IFT140Q96RY7 1462 aa25.37■■□□□ 1.65
CCDC24-208ENST00000486064 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
CCDC24-208ENST00000486064 GRIN2BQ13224 1484 aa25.32■■□□□ 1.64
CCDC24-208ENST00000486064 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
CCDC24-208ENST00000486064 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.31■■□□□ 1.64
CCDC24-208ENST00000486064 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
CCDC24-208ENST00000486064 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
CCDC24-208ENST00000486064 FBLN2P98095 1184 aa25.27■■□□□ 1.64
CCDC24-208ENST00000486064 ADAMTS12P58397 1594 aa25.27■■□□□ 1.64
CCDC24-208ENST00000486064 ITGAEP38570 1179 aa25.25■■□□□ 1.63
CCDC24-208ENST00000486064 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.25■■□□□ 1.63
CCDC24-208ENST00000486064 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
CCDC24-208ENST00000486064 TIAM1Q13009 1591 aa25.22■■□□□ 1.63
CCDC24-208ENST00000486064 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.21■■□□□ 1.63
CCDC24-208ENST00000486064 ARID3CA6NKF2 412 aa25.19■■□□□ 1.62
CCDC24-208ENST00000486064 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
CCDC24-208ENST00000486064 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.15■■□□□ 1.62
CCDC24-208ENST00000486064 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
CCDC24-208ENST00000486064 SAMD9Q5K651 1589 aa25.13■■□□□ 1.61
CCDC24-208ENST00000486064 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.13■■□□□ 1.61
CCDC24-208ENST00000486064 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.11■■□□□ 1.61
CCDC24-208ENST00000486064 FMN1Q68DA7 1419 aa25.11■■□□□ 1.61
CCDC24-208ENST00000486064 IQGAP2Q13576 1575 aa25.11■■□□□ 1.61
CCDC24-208ENST00000486064 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.1■■□□□ 1.61
CCDC24-208ENST00000486064 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.09■■□□□ 1.61
CCDC24-208ENST00000486064 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.6
CCDC24-208ENST00000486064 GRIN2AQ12879 1464 aa25.07■■□□□ 1.6
CCDC24-208ENST00000486064 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
CCDC24-208ENST00000486064 MAP3K1Q13233 1512 aa25.04■■□□□ 1.6
CCDC24-208ENST00000486064 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.03■■□□□ 1.6
CCDC24-208ENST00000486064 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25■■□□□ 1.59
CCDC24-208ENST00000486064 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
CCDC24-208ENST00000486064 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.98■■□□□ 1.59
CCDC24-208ENST00000486064 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.97■■□□□ 1.59
CCDC24-208ENST00000486064 SYNJ2O15056 1496 aa24.97■■□□□ 1.59
CCDC24-208ENST00000486064 CEP170Q5SW79 1584 aa24.95■■□□□ 1.58
CCDC24-208ENST00000486064 DISP1Q96F81 1524 aa24.92■■□□□ 1.58
CCDC24-208ENST00000486064 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.91■■□□□ 1.58
CCDC24-208ENST00000486064 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
CCDC24-208ENST00000486064 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.86■■□□□ 1.57
CCDC24-208ENST00000486064 JPH4Q96JJ6 628 aa24.86■■□□□ 1.57
CCDC24-208ENST00000486064 KIAA0556O60303 1618 aa24.84■■□□□ 1.57
CCDC24-208ENST00000486064 BCL11AQ9H165 835 aa24.81■■□□□ 1.56
CCDC24-208ENST00000486064 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
CCDC24-208ENST00000486064 NCOA2Q15596 1464 aa24.8■■□□□ 1.56
CCDC24-208ENST00000486064 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
CCDC24-208ENST00000486064 NUP160Q12769 1436 aa24.79■■□□□ 1.56
CCDC24-208ENST00000486064 HECW1Q76N89 1606 aa24.77■■□□□ 1.56
CCDC24-208ENST00000486064 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa24.77■■□□□ 1.56
CCDC24-208ENST00000486064 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.76■■□□□ 1.55
CCDC24-208ENST00000486064 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.75■■□□□ 1.55
CCDC24-208ENST00000486064 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.72■■□□□ 1.55
CCDC24-208ENST00000486064 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
CCDC24-208ENST00000486064 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.7■■□□□ 1.54
CCDC24-208ENST00000486064 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.68■■□□□ 1.54
CCDC24-208ENST00000486064 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
CCDC24-208ENST00000486064 PTPRKQ15262 1439 aa24.67■■□□□ 1.54
CCDC24-208ENST00000486064 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.66■■□□□ 1.54
CCDC24-208ENST00000486064 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.65■■□□□ 1.54
CCDC24-208ENST00000486064 CHD1O14646 1710 aa24.65■■□□□ 1.54
CCDC24-208ENST00000486064 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.65■■□□□ 1.54
CCDC24-208ENST00000486064 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.65■■□□□ 1.54
CCDC24-208ENST00000486064 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
CCDC24-208ENST00000486064 ARHGEF11O15085 1522 aa24.58■■□□□ 1.53
CCDC24-208ENST00000486064 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
CCDC24-208ENST00000486064 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
CCDC24-208ENST00000486064 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.56■■□□□ 1.52
CCDC24-208ENST00000486064 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.56■■□□□ 1.52
CCDC24-208ENST00000486064 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.54■■□□□ 1.52
CCDC24-208ENST00000486064 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
CCDC24-208ENST00000486064 SIN3AQ96ST3 1273 aa24.51■■□□□ 1.51
CCDC24-208ENST00000486064 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.49■■□□□ 1.51
CCDC24-208ENST00000486064 PTPRGP23470 1445 aa24.49■■□□□ 1.51
CCDC24-208ENST00000486064 NEUROD1Q13562 356 aa24.49■■□□□ 1.51
CCDC24-208ENST00000486064 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
CCDC24-208ENST00000486064 MAPKBP1O60336 1514 aa24.48■■□□□ 1.51
CCDC24-208ENST00000486064 CLSPNQ9HAW4 1339 aa24.46■■□□□ 1.51
CCDC24-208ENST00000486064 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
CCDC24-208ENST00000486064 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
CCDC24-208ENST00000486064 KIF14Q15058 1648 aa24.43■■□□□ 1.5
CCDC24-208ENST00000486064 ATP10BO94823 1461 aa24.43■■□□□ 1.5
CCDC24-208ENST00000486064 ABCA8O94911 1581 aa24.42■■□□□ 1.5
CCDC24-208ENST00000486064 NAIPQ13075 1403 aa24.42■■□□□ 1.5
CCDC24-208ENST00000486064 PLEKHD1A6NEE1 506 aa24.41■■□□□ 1.5
CCDC24-208ENST00000486064 HFM1A2PYH4 1435 aa24.4■■□□□ 1.5
CCDC24-208ENST00000486064 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
CCDC24-208ENST00000486064 ERICH6Q7L0X2 663 aa24.4■■□□□ 1.5
CCDC24-208ENST00000486064 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.5
CCDC24-208ENST00000486064 MIA2Q96PC5 1412 aa24.37■■□□□ 1.49
CCDC24-208ENST00000486064 TRIM52Q96A61 297 aa24.32■■□□□ 1.48
CCDC24-208ENST00000486064 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
CCDC24-208ENST00000486064 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.9 ms