RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480404.1

CPE-203, Transcript of carboxypeptidase E, humanhuman

TSL 2

Gene CPE, Length 437 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPE-203ENST00000480404 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.58■■■■□ 3.13
CPE-203ENST00000480404 KDM6BO15054 1643 aa34.56■■■■□ 3.12
CPE-203ENST00000480404 FAM69CQ0P6D2 419 aa34.55■■■■□ 3.12
CPE-203ENST00000480404 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP34.54■■■■□ 3.12
CPE-203ENST00000480404 TOP2BQ02880 1626 aa34.53■■■■□ 3.12
CPE-203ENST00000480404 ADCY10Q96PN6 1610 aa34.53■■■■□ 3.12
CPE-203ENST00000480404 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.52■■■■□ 3.12
CPE-203ENST00000480404 TSPOAP1O95153 1857 aa34.52■■■■□ 3.12
CPE-203ENST00000480404 JPH4Q96JJ6 628 aa34.44■■■■□ 3.1
CPE-203ENST00000480404 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP34.29■■■■□ 3.08
CPE-203ENST00000480404 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP34.22■■■■□ 3.07
CPE-203ENST00000480404 ADGRL1O94910 1474 aa34.13■■■■□ 3.05
CPE-203ENST00000480404 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa34.09■■■■□ 3.05
CPE-203ENST00000480404 HECW2Q9P2P5 1572 aa34.04■■■■□ 3.04
CPE-203ENST00000480404 GLI2P10070 1586 aa34.02■■■■□ 3.04
CPE-203ENST00000480404 CUL7Q14999 1698 aa33.96■■■■□ 3.03
CPE-203ENST00000480404 ABCC2Q92887 1545 aa33.95■■■■□ 3.03
CPE-203ENST00000480404 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP33.94■■■■□ 3.02
CPE-203ENST00000480404 ASXL2Q76L83 1435 aa33.91■■■■□ 3.02
CPE-203ENST00000480404 PTPRGP23470 1445 aa33.89■■■■□ 3.02
CPE-203ENST00000480404 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa33.87■■■■□ 3.01
CPE-203ENST00000480404 PLB1Q6P1J6 1458 aa33.87■■■■□ 3.01
CPE-203ENST00000480404 IGF1RP08069 1367 aa33.83■■■■□ 3.01
CPE-203ENST00000480404 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP33.81■■■■□ 3
CPE-203ENST00000480404 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa33.78■■■■□ 3
CPE-203ENST00000480404 TNIKQ9UKE5 1360 aa33.77■■■■□ 3
CPE-203ENST00000480404 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP33.74■■■□□ 2.99
CPE-203ENST00000480404 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP33.71■■■□□ 2.99
CPE-203ENST00000480404 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa33.68■■■□□ 2.98
CPE-203ENST00000480404 IQGAP2Q13576 1575 aa33.68■■■□□ 2.98
CPE-203ENST00000480404 KIF27Q86VH2 1401 aa33.67■■■□□ 2.98
CPE-203ENST00000480404 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP33.66■■■□□ 2.98
CPE-203ENST00000480404 KDM5BQ9UGL1 1544 aa33.66■■■□□ 2.98
CPE-203ENST00000480404 TEX14Q8IWB6 1497 aa33.65■■■□□ 2.98
CPE-203ENST00000480404 UACAQ9BZF9 1416 aa33.65■■■□□ 2.98
CPE-203ENST00000480404 DISP1Q96F81 1524 aa33.62■■■□□ 2.97
CPE-203ENST00000480404 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa33.54■■■□□ 2.96
CPE-203ENST00000480404 KIF21BO75037 1637 aa33.46■■■□□ 2.95
CPE-203ENST00000480404 FBXO41Q8TF61 875 aa33.45■■■□□ 2.95
CPE-203ENST00000480404 CFAP43Q8NDM7 1665 aa33.43■■■□□ 2.94
CPE-203ENST00000480404 WDR7Q9Y4E6 1490 aa33.43■■■□□ 2.94
CPE-203ENST00000480404 UGGT2Q9NYU1 1516 aa33.43■■■□□ 2.94
CPE-203ENST00000480404 KIAA0556O60303 1618 aa33.42■■■□□ 2.94
CPE-203ENST00000480404 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa33.38■■■□□ 2.93
CPE-203ENST00000480404 CD109Q6YHK3 1445 aa33.27■■■□□ 2.92
CPE-203ENST00000480404 ADAMTSL3P82987 1691 aa33.26■■■□□ 2.91
CPE-203ENST00000480404 ABCA8O94911 1581 aa33.19■■■□□ 2.9
CPE-203ENST00000480404 PTPRMP28827 1452 aa33.17■■■□□ 2.9
CPE-203ENST00000480404 ARAP3Q8WWN8 1544 aa33.15■■■□□ 2.9
CPE-203ENST00000480404 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa33.15■■■□□ 2.9
CPE-203ENST00000480404 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa33.15■■■□□ 2.9
CPE-203ENST00000480404 KCNH8Q96L42 1107 aa33.07■■■□□ 2.88
CPE-203ENST00000480404 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP33.07■■■□□ 2.88
CPE-203ENST00000480404 BCORL1Q5H9F3 1711 aa33.06■■■□□ 2.88
CPE-203ENST00000480404 MADDQ8WXG6 1647 aa33.03■■■□□ 2.88
CPE-203ENST00000480404 LMTK3Q96Q04 1460 aa33.03■■■□□ 2.88
CPE-203ENST00000480404 ABCA9Q8IUA7 1624 aa32.97■■■□□ 2.87
CPE-203ENST00000480404 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa32.96■■■□□ 2.87
CPE-203ENST00000480404 GOLGA3Q08378 1498 aa32.94■■■□□ 2.86
CPE-203ENST00000480404 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP32.88■■■□□ 2.85
CPE-203ENST00000480404 PHLDB1Q86UU1 1377 aa32.83■■■□□ 2.85
CPE-203ENST00000480404 ATP10BO94823 1461 aa32.82■■■□□ 2.84
CPE-203ENST00000480404 RAPGEF3O95398 923 aa32.82■■■□□ 2.84
CPE-203ENST00000480404 NEO1Q92859 1461 aa32.8■■■□□ 2.84
CPE-203ENST00000480404 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa32.77■■■□□ 2.84
CPE-203ENST00000480404 RICTORQ6R327 1708 aa32.74■■■□□ 2.83
CPE-203ENST00000480404 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa32.73■■■□□ 2.83
CPE-203ENST00000480404 ARID3CA6NKF2 412 aa32.71■■■□□ 2.83
CPE-203ENST00000480404 HSPA2P54652 639 aa32.68■■■□□ 2.82
CPE-203ENST00000480404 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP32.66■■■□□ 2.82
CPE-203ENST00000480404 PRXQ9BXM0 1461 aa32.62■■■□□ 2.81
CPE-203ENST00000480404 CERKQ8TCT0 537 aa32.62■■■□□ 2.81
CPE-203ENST00000480404 ILDR2Q71H61 639 aa32.61■■■□□ 2.81
CPE-203ENST00000480404 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa32.61■■■□□ 2.81
CPE-203ENST00000480404 SAMD9Q5K651 1589 aa32.58■■■□□ 2.81
CPE-203ENST00000480404 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa32.57■■■□□ 2.8
CPE-203ENST00000480404 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa32.54■■■□□ 2.8
CPE-203ENST00000480404 TTC37Q6PGP7 1564 aa32.53■■■□□ 2.8
CPE-203ENST00000480404 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP32.52■■■□□ 2.8
CPE-203ENST00000480404 FHOD3Q2V2M9 1422 aa32.51■■■□□ 2.8
CPE-203ENST00000480404 FANCAO15360 1455 aa32.5■■■□□ 2.79
CPE-203ENST00000480404 SOCS7O14512 581 aa32.5■■■□□ 2.79
CPE-203ENST00000480404 P3H3Q8IVL6 736 aa32.5■■■□□ 2.79
CPE-203ENST00000480404 DISP3Q9P2K9 1392 aa32.48■■■□□ 2.79
CPE-203ENST00000480404 CFAP74Q9C0B2 1584 aa32.48■■■□□ 2.79
CPE-203ENST00000480404 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP32.47■■■□□ 2.79
CPE-203ENST00000480404 PREX1Q8TCU6 1659 aa32.46■■■□□ 2.79
CPE-203ENST00000480404 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa32.45■■■□□ 2.78
CPE-203ENST00000480404 STRCQ7RTU9 1775 aa32.45■■■□□ 2.78
CPE-203ENST00000480404 AKNAQ7Z591 1439 aa32.44■■■□□ 2.78
CPE-203ENST00000480404 YEATS2Q9ULM3 1422 aa32.44■■■□□ 2.78
CPE-203ENST00000480404 POGZQ7Z3K3 1410 aa32.43■■■□□ 2.78
CPE-203ENST00000480404 PLPPR3Q6T4P5 718 aa32.43■■■□□ 2.78
CPE-203ENST00000480404 EFCAB5A4FU69 1503 aa32.42■■■□□ 2.78
CPE-203ENST00000480404 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP32.38■■■□□ 2.77
CPE-203ENST00000480404 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa32.37■■■□□ 2.77
CPE-203ENST00000480404 HECW1Q76N89 1606 aa32.37■■■□□ 2.77
CPE-203ENST00000480404 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa32.35■■■□□ 2.77
CPE-203ENST00000480404 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP32.34■■■□□ 2.77
CPE-203ENST00000480404 MAGI2Q86UL8 1455 aa32.33■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.9 ms