RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480404.1

CPE-203, Transcript of carboxypeptidase E, humanhuman

TSL 2

Gene CPE, Length 437 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPE-203ENST00000480404 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.74■■■■■ 5.39
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CPE-203ENST00000480404 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.21■■■■■ 4.51
CPE-203ENST00000480404 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.52■■■■■ 4.4
CPE-203ENST00000480404 NACADO15069 1562 aa41.99■■■■■ 4.31
CPE-203ENST00000480404 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.84■■■■■ 4.29
CPE-203ENST00000480404 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.73■■■■■ 4.27
CPE-203ENST00000480404 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.46■■■■■ 4.23
CPE-203ENST00000480404 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.26■■■■■ 4.2
CPE-203ENST00000480404 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.1■■■■■ 4.17
CPE-203ENST00000480404 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.78■■■■■ 4.12
CPE-203ENST00000480404 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.71■■■■■ 4.11
CPE-203ENST00000480404 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.66■■■■■ 4.1
CPE-203ENST00000480404 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.44■■■■■ 4.06
CPE-203ENST00000480404 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.31■■■■■ 4.04
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CPE-203ENST00000480404 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.22■■■■■ 4.03
CPE-203ENST00000480404 SCRIBQ14160 1630 aa40.22■■■■■ 4.03
CPE-203ENST00000480404 CUX2O14529 1486 aa39.28■■■■□ 3.88
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CPE-203ENST00000480404 NCAPD3P42695 1498 aa38.75■■■■□ 3.79
CPE-203ENST00000480404 NESP48681 1621 aa38.52■■■■□ 3.76
CPE-203ENST00000480404 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.5■■■■□ 3.75
CPE-203ENST00000480404 HMGXB3Q12766 1538 aa38.43■■■■□ 3.74
CPE-203ENST00000480404 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.43■■■■□ 3.74
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CPE-203ENST00000480404 SMARCA4P51532 1647 aa38.3■■■■□ 3.72
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CPE-203ENST00000480404 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.07■■■■□ 3.69
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CPE-203ENST00000480404 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.95■■■■□ 3.67
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CPE-203ENST00000480404 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.58■■■■□ 3.61
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CPE-203ENST00000480404 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.46■■■■□ 3.59
CPE-203ENST00000480404 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.2■■■■□ 3.55
CPE-203ENST00000480404 OSCARQ8IYS5 282 aa37.15■■■■□ 3.54
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CPE-203ENST00000480404 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.08■■■■□ 3.53
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CPE-203ENST00000480404 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.05■■■■□ 3.52
CPE-203ENST00000480404 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.05■■■■□ 3.52
CPE-203ENST00000480404 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.92■■■■□ 3.5
CPE-203ENST00000480404 CFTRP13569 1480 aa36.9■■■■□ 3.5
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CPE-203ENST00000480404 PRDM2Q13029 1718 aa36.68■■■■□ 3.46
CPE-203ENST00000480404 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.61■■■■□ 3.45
CPE-203ENST00000480404 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.53■■■■□ 3.44
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CPE-203ENST00000480404 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.42■■■■□ 3.42
CPE-203ENST00000480404 CHD1O14646 1710 aa36.41■■■■□ 3.42
CPE-203ENST00000480404 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.37■■■■□ 3.41
CPE-203ENST00000480404 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.36■■■■□ 3.41
CPE-203ENST00000480404 ARAP1Q96P48 1450 aa36.35■■■■□ 3.41
CPE-203ENST00000480404 TOPBP1Q92547 1522 aa36.32■■■■□ 3.4
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CPE-203ENST00000480404 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.08■■■■□ 3.37
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CPE-203ENST00000480404 ABCC8Q09428 1581 aa36.07■■■■□ 3.37
CPE-203ENST00000480404 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.9■■■■□ 3.34
CPE-203ENST00000480404 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.88■■■■□ 3.33
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CPE-203ENST00000480404 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP35.84■■■■□ 3.33
CPE-203ENST00000480404 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.75■■■■□ 3.31
CPE-203ENST00000480404 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.72■■■■□ 3.31
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CPE-203ENST00000480404 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.57■■■■□ 3.28
CPE-203ENST00000480404 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.5■■■■□ 3.27
CPE-203ENST00000480404 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.47■■■■□ 3.27
CPE-203ENST00000480404 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.46■■■■□ 3.27
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CPE-203ENST00000480404 GRIN2BQ13224 1484 aa35.43■■■■□ 3.26
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CPE-203ENST00000480404 CUX1P39880 1505 aa35.37■■■■□ 3.25
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CPE-203ENST00000480404 SHROOM2Q13796 1616 aa35.04■■■■□ 3.2
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CPE-203ENST00000480404 ADAMTS12P58397 1594 aa34.97■■■■□ 3.19
CPE-203ENST00000480404 NUP160Q12769 1436 aa34.97■■■■□ 3.19
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CPE-203ENST00000480404 DIP2BQ9P265 1576 aa34.66■■■■□ 3.14
CPE-203ENST00000480404 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP34.63■■■■□ 3.13
CPE-203ENST00000480404 MAPKBP1O60336 1514 aa34.61■■■■□ 3.13
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CPE-203ENST00000480404 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.6■■■■□ 3.13
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