RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470965.1

HDAC10-208, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 810 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-208	ENST00000470965	SHROOM2	Q13796	1616 aa		33.32	■■■□□ 2.92
HDAC10-208	ENST00000470965	PRX	Q9BXM0	1461 aa		33.31	■■■□□ 2.92
HDAC10-208	ENST00000470965	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		33.31	■■■□□ 2.92
HDAC10-208	ENST00000470965	JPH4	Q96JJ6	628 aa		33.28	■■■□□ 2.92
HDAC10-208	ENST00000470965	ARAP1	Q96P48	1450 aa		33.26	■■■□□ 2.92
HDAC10-208	ENST00000470965	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		33.2	■■■□□ 2.91
HDAC10-208	ENST00000470965	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	33.19	■■■□□ 2.9
HDAC10-208	ENST00000470965	IQGAP2	Q13576	1575 aa		33.13	■■■□□ 2.89
HDAC10-208	ENST00000470965	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		33.13	■■■□□ 2.89
HDAC10-208	ENST00000470965	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	33.1	■■■□□ 2.89
HDAC10-208	ENST00000470965	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		33.02	■■■□□ 2.88
HDAC10-208	ENST00000470965	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		32.99	■■■□□ 2.87
HDAC10-208	ENST00000470965	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		32.99	■■■□□ 2.87
HDAC10-208	ENST00000470965	KIF21B	O75037	1637 aa		32.99	■■■□□ 2.87
HDAC10-208	ENST00000470965	DISP1	Q96F81	1524 aa		32.88	■■■□□ 2.85
HDAC10-208	ENST00000470965	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		32.88	■■■□□ 2.85
HDAC10-208	ENST00000470965	GOLGA3	Q08378	1498 aa		32.85	■■■□□ 2.85
HDAC10-208	ENST00000470965	PTPRG	P23470	1445 aa		32.84	■■■□□ 2.85
HDAC10-208	ENST00000470965	KIAA0556	O60303	1618 aa		32.8	■■■□□ 2.84
HDAC10-208	ENST00000470965	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	32.7	■■■□□ 2.83
HDAC10-208	ENST00000470965	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	32.64	■■■□□ 2.82
HDAC10-208	ENST00000470965	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		32.62	■■■□□ 2.81
HDAC10-208	ENST00000470965	SAMD9	Q5K651	1589 aa		32.62	■■■□□ 2.81
HDAC10-208	ENST00000470965	UACA	Q9BZF9	1416 aa		32.62	■■■□□ 2.81
HDAC10-208	ENST00000470965	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	32.62	■■■□□ 2.81
HDAC10-208	ENST00000470965	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		32.61	■■■□□ 2.81
HDAC10-208	ENST00000470965	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		32.59	■■■□□ 2.81
HDAC10-208	ENST00000470965	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		32.56	■■■□□ 2.8
HDAC10-208	ENST00000470965	ABCC2	Q92887	1545 aa		32.55	■■■□□ 2.8
HDAC10-208	ENST00000470965	P3H3	Q8IVL6	736 aa		32.51	■■■□□ 2.79
HDAC10-208	ENST00000470965	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	32.49	■■■□□ 2.79
HDAC10-208	ENST00000470965	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	32.49	■■■□□ 2.79
HDAC10-208	ENST00000470965	MAPKBP1	O60336	1514 aa		32.48	■■■□□ 2.79
HDAC10-208	ENST00000470965	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		32.46	■■■□□ 2.79
HDAC10-208	ENST00000470965	ABCA8	O94911	1581 aa		32.45	■■■□□ 2.79
HDAC10-208	ENST00000470965	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		32.43	■■■□□ 2.78
HDAC10-208	ENST00000470965	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		32.42	■■■□□ 2.78
HDAC10-208	ENST00000470965	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		32.35	■■■□□ 2.77
HDAC10-208	ENST00000470965	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		32.31	■■■□□ 2.76
HDAC10-208	ENST00000470965	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		32.29	■■■□□ 2.76
HDAC10-208	ENST00000470965	ASXL2	Q76L83	1435 aa		32.28	■■■□□ 2.76
HDAC10-208	ENST00000470965	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	32.28	■■■□□ 2.76
HDAC10-208	ENST00000470965	FMN1	Q68DA7	1419 aa		32.27	■■■□□ 2.76
HDAC10-208	ENST00000470965	CLIP1	P30622	1438 aa		32.22	■■■□□ 2.75
HDAC10-208	ENST00000470965	DIP2B	Q9P265	1576 aa		32.21	■■■□□ 2.75
HDAC10-208	ENST00000470965	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		32.2	■■■□□ 2.75
HDAC10-208	ENST00000470965	ATP10B	O94823	1461 aa		32.19	■■■□□ 2.74
HDAC10-208	ENST00000470965	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	32.18	■■■□□ 2.74
HDAC10-208	ENST00000470965	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		32.16	■■■□□ 2.74
HDAC10-208	ENST00000470965	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		32.16	■■■□□ 2.74
HDAC10-208	ENST00000470965	GLI2	P10070	1586 aa		32.11	■■■□□ 2.73
HDAC10-208	ENST00000470965	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	32.1	■■■□□ 2.73
HDAC10-208	ENST00000470965	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		32.1	■■■□□ 2.73
HDAC10-208	ENST00000470965	CEP162	Q5TB80	1403 aa		32.09	■■■□□ 2.73
HDAC10-208	ENST00000470965	ARID3C	A6NKF2	412 aa		32.08	■■■□□ 2.73
HDAC10-208	ENST00000470965	HECW1	Q76N89	1606 aa		32.06	■■■□□ 2.72
HDAC10-208	ENST00000470965	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	32.05	■■■□□ 2.72
HDAC10-208	ENST00000470965	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	32.05	■■■□□ 2.72
HDAC10-208	ENST00000470965	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		32	■■■□□ 2.71
HDAC10-208	ENST00000470965	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		31.97	■■■□□ 2.71
HDAC10-208	ENST00000470965	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	31.97	■■■□□ 2.71
HDAC10-208	ENST00000470965	KCNH8	Q96L42	1107 aa		31.95	■■■□□ 2.71
HDAC10-208	ENST00000470965	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		31.93	■■■□□ 2.7
HDAC10-208	ENST00000470965	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	31.92	■■■□□ 2.7
HDAC10-208	ENST00000470965	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	31.92	■■■□□ 2.7
HDAC10-208	ENST00000470965	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		31.91	■■■□□ 2.7
HDAC10-208	ENST00000470965	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	31.91	■■■□□ 2.7
HDAC10-208	ENST00000470965	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		31.89	■■■□□ 2.7
HDAC10-208	ENST00000470965	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		31.86	■■■□□ 2.69
HDAC10-208	ENST00000470965	CD109	Q6YHK3	1445 aa		31.85	■■■□□ 2.69
HDAC10-208	ENST00000470965	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		31.84	■■■□□ 2.69
HDAC10-208	ENST00000470965	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		31.82	■■■□□ 2.68
HDAC10-208	ENST00000470965	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		31.81	■■■□□ 2.68
HDAC10-208	ENST00000470965	TSPOAP1	O95153	1857 aa		31.81	■■■□□ 2.68
HDAC10-208	ENST00000470965	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	31.79	■■■□□ 2.68
HDAC10-208	ENST00000470965	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	31.75	■■■□□ 2.67
HDAC10-208	ENST00000470965	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		31.75	■■■□□ 2.67
HDAC10-208	ENST00000470965	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		31.73	■■■□□ 2.67
HDAC10-208	ENST00000470965	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	31.69	■■■□□ 2.66	1e-6	■□□□□ 10.3
HDAC10-208	ENST00000470965	KDM6B	O15054	1643 aa		31.67	■■■□□ 2.66
HDAC10-208	ENST00000470965	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		31.66	■■■□□ 2.66
HDAC10-208	ENST00000470965	KIF14	Q15058	1648 aa		31.64	■■■□□ 2.66
HDAC10-208	ENST00000470965	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		31.6	■■■□□ 2.65
HDAC10-208	ENST00000470965	NEO1	Q92859	1461 aa		31.6	■■■□□ 2.65
HDAC10-208	ENST00000470965	PLCH2	O75038	1416 aa		31.56	■■■□□ 2.64
HDAC10-208	ENST00000470965	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		31.55	■■■□□ 2.64
HDAC10-208	ENST00000470965	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		31.54	■■■□□ 2.64
HDAC10-208	ENST00000470965	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	31.52	■■■□□ 2.64
HDAC10-208	ENST00000470965	FANCA	O15360	1455 aa		31.51	■■■□□ 2.63
HDAC10-208	ENST00000470965	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		31.51	■■■□□ 2.63
HDAC10-208	ENST00000470965	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		31.49	■■■□□ 2.63
HDAC10-208	ENST00000470965	MAP3K1	Q13233	1512 aa		31.48	■■■□□ 2.63
HDAC10-208	ENST00000470965	TIAM1	Q13009	1591 aa		31.47	■■■□□ 2.63
HDAC10-208	ENST00000470965	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		31.46	■■■□□ 2.63
HDAC10-208	ENST00000470965	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		31.45	■■■□□ 2.63
HDAC10-208	ENST00000470965	AKNA	Q7Z591	1439 aa		31.45	■■■□□ 2.63
HDAC10-208	ENST00000470965	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		31.39	■■■□□ 2.61
HDAC10-208	ENST00000470965	APLP2	Q06481	763 aa		31.38	■■■□□ 2.61
HDAC10-208	ENST00000470965	PREX2	Q70Z35	1606 aa		31.36	■■■□□ 2.61
HDAC10-208	ENST00000470965	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		31.36	■■■□□ 2.61

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