RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469400.1

TRAPPC12-216, Transcript of trafficking protein particle complex 12, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC12, Length 720 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC12-216ENST00000469400 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC12-216ENST00000469400 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC12-216ENST00000469400 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC12-216ENST00000469400 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC12-216ENST00000469400 MAPKBP1O60336 1514 aa22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC12-216ENST00000469400 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.83■■□□□ 1.25
TRAPPC12-216ENST00000469400 DIP2BQ9P265 1576 aa22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC12-216ENST00000469400 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC12-216ENST00000469400 IGF1RP08069 1367 aa22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC12-216ENST00000469400 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC12-216ENST00000469400 KIF27Q86VH2 1401 aa22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC12-216ENST00000469400 KDM6BO15054 1643 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC12-216ENST00000469400 PTPRGP23470 1445 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC12-216ENST00000469400 CUL7Q14999 1698 aa22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC12-216ENST00000469400 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC12-216ENST00000469400 TSPOAP1O95153 1857 aa22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC12-216ENST00000469400 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC12-216ENST00000469400 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC12-216ENST00000469400 ABCC2Q92887 1545 aa22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC12-216ENST00000469400 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC12-216ENST00000469400 ASXL2Q76L83 1435 aa22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC12-216ENST00000469400 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC12-216ENST00000469400 GLI2P10070 1586 aa22.5■■□□□ 1.19
TRAPPC12-216ENST00000469400 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.5■■□□□ 1.19
TRAPPC12-216ENST00000469400 UACAQ9BZF9 1416 aa22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC12-216ENST00000469400 IQGAP2Q13576 1575 aa22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC12-216ENST00000469400 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC12-216ENST00000469400 DISP1Q96F81 1524 aa22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC12-216ENST00000469400 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC12-216ENST00000469400 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC12-216ENST00000469400 ADGRL1O94910 1474 aa22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC12-216ENST00000469400 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
TRAPPC12-216ENST00000469400 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.41■■□□□ 1.18
TRAPPC12-216ENST00000469400 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC12-216ENST00000469400 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC12-216ENST00000469400 TEX14Q8IWB6 1497 aa22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC12-216ENST00000469400 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC12-216ENST00000469400 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC12-216ENST00000469400 KIAA0556O60303 1618 aa22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC12-216ENST00000469400 WDR7Q9Y4E6 1490 aa22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC12-216ENST00000469400 HECW2Q9P2P5 1572 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC12-216ENST00000469400 KCNH8Q96L42 1107 aa22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC12-216ENST00000469400 CD109Q6YHK3 1445 aa22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC12-216ENST00000469400 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC12-216ENST00000469400 GOLGA3Q08378 1498 aa22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC12-216ENST00000469400 ABCA8O94911 1581 aa22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC12-216ENST00000469400 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC12-216ENST00000469400 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC12-216ENST00000469400 ARID3CA6NKF2 412 aa22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC12-216ENST00000469400 PRXQ9BXM0 1461 aa22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC12-216ENST00000469400 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC12-216ENST00000469400 KIF21BO75037 1637 aa21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC12-216ENST00000469400 ATP10BO94823 1461 aa21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC12-216ENST00000469400 P3H3Q8IVL6 736 aa21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC12-216ENST00000469400 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC12-216ENST00000469400 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC12-216ENST00000469400 RAPGEF3O95398 923 aa21.92■■□□□ 1.1
TRAPPC12-216ENST00000469400 PTPRMP28827 1452 aa21.9■■□□□ 1.1
TRAPPC12-216ENST00000469400 ABCA9Q8IUA7 1624 aa21.89■■□□□ 1.09
TRAPPC12-216ENST00000469400 FBXO41Q8TF61 875 aa21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC12-216ENST00000469400 ADAMTSL3P82987 1691 aa21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC12-216ENST00000469400 NEO1Q92859 1461 aa21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC12-216ENST00000469400 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC12-216ENST00000469400 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC12-216ENST00000469400 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC12-216ENST00000469400 SAMD9Q5K651 1589 aa21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC12-216ENST00000469400 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC12-216ENST00000469400 CSRNP3Q8WYN3 585 aa21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC12-216ENST00000469400 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC12-216ENST00000469400 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.07
TRAPPC12-216ENST00000469400 BCORL1Q5H9F3 1711 aa21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC12-216ENST00000469400 MADDQ8WXG6 1647 aa21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC12-216ENST00000469400 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC12-216ENST00000469400 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC12-216ENST00000469400 LMTK3Q96Q04 1460 aa21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC12-216ENST00000469400 PLEKHD1A6NEE1 506 aa21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC12-216ENST00000469400 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC12-216ENST00000469400 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC12-216ENST00000469400 AKNAQ7Z591 1439 aa21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC12-216ENST00000469400 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC12-216ENST00000469400 FANCAO15360 1455 aa21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC12-216ENST00000469400 HSPA2P54652 639 aa21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC12-216ENST00000469400 RICTORQ6R327 1708 aa21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC12-216ENST00000469400 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC12-216ENST00000469400 PLPPR3Q6T4P5 718 aa21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC12-216ENST00000469400 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC12-216ENST00000469400 POGZQ7Z3K3 1410 aa21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC12-216ENST00000469400 YEATS2Q9ULM3 1422 aa21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC12-216ENST00000469400 CFAP74Q9C0B2 1584 aa21.58■■□□□ 1.05
TRAPPC12-216ENST00000469400 EEA1Q15075 1411 aa21.58■■□□□ 1.05
TRAPPC12-216ENST00000469400 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa21.58■■□□□ 1.04
TRAPPC12-216ENST00000469400 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC12-216ENST00000469400 TTC37Q6PGP7 1564 aa21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC12-216ENST00000469400 MLECQ14165 292 aa21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC12-216ENST00000469400 MAGI2Q86UL8 1455 aa21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC12-216ENST00000469400 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC12-216ENST00000469400 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC12-216ENST00000469400 SCAPERQ9BY12 1400 aa21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC12-216ENST00000469400 PLCH2O75038 1416 aa21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC12-216ENST00000469400 HECW1Q76N89 1606 aa21.51■■□□□ 1.03
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