RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469400.1

TRAPPC12-216, Transcript of trafficking protein particle complex 12, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC12, Length 720 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC12-216ENST00000469400 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.62■■■□□ 2.81
TRAPPC12-216ENST00000469400 ABCC9O60706 1549 aa29.78■■■□□ 2.36
TRAPPC12-216ENST00000469400 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.34■■■□□ 2.29
TRAPPC12-216ENST00000469400 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.31■■■□□ 2.12
TRAPPC12-216ENST00000469400 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.15■■■□□ 2.1
TRAPPC12-216ENST00000469400 NACADO15069 1562 aa27.88■■■□□ 2.05
TRAPPC12-216ENST00000469400 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.76■■■□□ 2.03
TRAPPC12-216ENST00000469400 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.73■■■□□ 2.03
TRAPPC12-216ENST00000469400 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.44■■□□□ 1.98
TRAPPC12-216ENST00000469400 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.38■■□□□ 1.97
TRAPPC12-216ENST00000469400 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.35■■□□□ 1.97
TRAPPC12-216ENST00000469400 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.91
TRAPPC12-216ENST00000469400 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.93■■□□□ 1.9
TRAPPC12-216ENST00000469400 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.9■■□□□ 1.9
TRAPPC12-216ENST00000469400 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.87■■□□□ 1.89
TRAPPC12-216ENST00000469400 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.85■■□□□ 1.89
TRAPPC12-216ENST00000469400 SCRIBQ14160 1630 aa26.76■■□□□ 1.87
TRAPPC12-216ENST00000469400 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
TRAPPC12-216ENST00000469400 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.24■■□□□ 1.79
TRAPPC12-216ENST00000469400 CUX2O14529 1486 aa25.79■■□□□ 1.72
TRAPPC12-216ENST00000469400 NCAPD3P42695 1498 aa25.79■■□□□ 1.72
TRAPPC12-216ENST00000469400 ERCC6Q03468 1493 aa25.73■■□□□ 1.71
TRAPPC12-216ENST00000469400 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.66■■□□□ 1.7
TRAPPC12-216ENST00000469400 SMARCA2P51531 1590 aa25.52■■□□□ 1.68
TRAPPC12-216ENST00000469400 HMGXB3Q12766 1538 aa25.51■■□□□ 1.67
TRAPPC12-216ENST00000469400 SMARCA4P51532 1647 aa25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC12-216ENST00000469400 NESP48681 1621 aa25.48■■□□□ 1.67
TRAPPC12-216ENST00000469400 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC12-216ENST00000469400 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
TRAPPC12-216ENST00000469400 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC12-216ENST00000469400 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC12-216ENST00000469400 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC12-216ENST00000469400 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.14■■□□□ 1.61
TRAPPC12-216ENST00000469400 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC12-216ENST00000469400 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.07■■□□□ 1.6
TRAPPC12-216ENST00000469400 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.99■■□□□ 1.59
TRAPPC12-216ENST00000469400 TRIM41Q8WV44 630 aa24.94■■□□□ 1.58
TRAPPC12-216ENST00000469400 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.91■■□□□ 1.58
TRAPPC12-216ENST00000469400 WDR62O43379 1518 aa24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC12-216ENST00000469400 WIZO95785 1651 aa24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC12-216ENST00000469400 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC12-216ENST00000469400 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC12-216ENST00000469400 CFTRP13569 1480 aa24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC12-216ENST00000469400 OSCARQ8IYS5 282 aa24.62■■□□□ 1.53
TRAPPC12-216ENST00000469400 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC12-216ENST00000469400 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC12-216ENST00000469400 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.51
TRAPPC12-216ENST00000469400 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC12-216ENST00000469400 IFT140Q96RY7 1462 aa24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC12-216ENST00000469400 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC12-216ENST00000469400 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC12-216ENST00000469400 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC12-216ENST00000469400 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC12-216ENST00000469400 PRDM2Q13029 1718 aa24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC12-216ENST00000469400 TOPBP1Q92547 1522 aa24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC12-216ENST00000469400 ARHGEF11O15085 1522 aa24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC12-216ENST00000469400 ABCC8Q09428 1581 aa24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC12-216ENST00000469400 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC12-216ENST00000469400 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC12-216ENST00000469400 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC12-216ENST00000469400 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC12-216ENST00000469400 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC12-216ENST00000469400 FBLN2P98095 1184 aa23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC12-216ENST00000469400 CHD1O14646 1710 aa23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC12-216ENST00000469400 ARAP1Q96P48 1450 aa23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC12-216ENST00000469400 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC12-216ENST00000469400 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC12-216ENST00000469400 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC12-216ENST00000469400 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
TRAPPC12-216ENST00000469400 SOGA1O94964 1423 aa23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC12-216ENST00000469400 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC12-216ENST00000469400 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC12-216ENST00000469400 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC12-216ENST00000469400 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC12-216ENST00000469400 WDR97A6NE52 1622 aa23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC12-216ENST00000469400 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC12-216ENST00000469400 SYNJ1O43426 1573 aa23.64■■□□□ 1.37
TRAPPC12-216ENST00000469400 CUX1P39880 1505 aa23.64■■□□□ 1.37
TRAPPC12-216ENST00000469400 GRIN2BQ13224 1484 aa23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC12-216ENST00000469400 SYNJ2O15056 1496 aa23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC12-216ENST00000469400 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC12-216ENST00000469400 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC12-216ENST00000469400 PBRM1Q86U86 1689 aa23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC12-216ENST00000469400 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC12-216ENST00000469400 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC12-216ENST00000469400 GRIN2AQ12879 1464 aa23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC12-216ENST00000469400 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC12-216ENST00000469400 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC12-216ENST00000469400 NUP160Q12769 1436 aa23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC12-216ENST00000469400 CEP170Q5SW79 1584 aa23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC12-216ENST00000469400 ADAMTS12P58397 1594 aa23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC12-216ENST00000469400 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC12-216ENST00000469400 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC12-216ENST00000469400 SHROOM2Q13796 1616 aa23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC12-216ENST00000469400 TOP2BQ02880 1626 aa23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC12-216ENST00000469400 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC12-216ENST00000469400 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC12-216ENST00000469400 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC12-216ENST00000469400 JPH4Q96JJ6 628 aa23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC12-216ENST00000469400 KIF13AQ9H1H9 1805 aa23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.9 ms