RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465199.5

C1orf35-202, Transcript of chromosome 1 open reading frame 35, humanhuman

TSL 5

Gene C1orf35, Length 588 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf35-202ENST00000465199 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP36.71■■■■□ 3.47
C1orf35-202ENST00000465199 CSRNP3Q8WYN3 585 aa36.68■■■■□ 3.46
C1orf35-202ENST00000465199 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.65■■■■□ 3.46
C1orf35-202ENST00000465199 SHROOM2Q13796 1616 aa36.63■■■■□ 3.45
C1orf35-202ENST00000465199 PRXQ9BXM0 1461 aa36.62■■■■□ 3.45
C1orf35-202ENST00000465199 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa36.57■■■■□ 3.45
C1orf35-202ENST00000465199 TRHP20396 242 aaPredicted RBP36.49■■■■□ 3.43
C1orf35-202ENST00000465199 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP36.42■■■■□ 3.42
C1orf35-202ENST00000465199 JPH4Q96JJ6 628 aa36.41■■■■□ 3.42
C1orf35-202ENST00000465199 KIF21BO75037 1637 aa36.34■■■■□ 3.41
C1orf35-202ENST00000465199 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa36.33■■■■□ 3.41
C1orf35-202ENST00000465199 EHMT2Q96KQ7 1210 aa36.22■■■■□ 3.39
C1orf35-202ENST00000465199 GOLGA3Q08378 1498 aa36.17■■■■□ 3.38
C1orf35-202ENST00000465199 IQGAP2Q13576 1575 aa36.16■■■■□ 3.38
C1orf35-202ENST00000465199 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa36.11■■■■□ 3.37
C1orf35-202ENST00000465199 UGGT2Q9NYU1 1516 aa36.03■■■■□ 3.36
C1orf35-202ENST00000465199 UBTFP17480 764 aaKnown RBP36.02■■■■□ 3.36
C1orf35-202ENST00000465199 ADCY10Q96PN6 1610 aa36■■■■□ 3.35
C1orf35-202ENST00000465199 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa35.97■■■■□ 3.35
C1orf35-202ENST00000465199 DISP1Q96F81 1524 aa35.97■■■■□ 3.35
C1orf35-202ENST00000465199 KIF13AQ9H1H9 1805 aa35.95■■■■□ 3.35
C1orf35-202ENST00000465199 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP35.95■■■■□ 3.35
C1orf35-202ENST00000465199 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP35.92■■■■□ 3.34
C1orf35-202ENST00000465199 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa35.91■■■■□ 3.34
C1orf35-202ENST00000465199 PTPRGP23470 1445 aa35.9■■■■□ 3.34
C1orf35-202ENST00000465199 TNIKQ9UKE5 1360 aa35.88■■■■□ 3.33
C1orf35-202ENST00000465199 KIAA0556O60303 1618 aa35.84■■■■□ 3.33
C1orf35-202ENST00000465199 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP35.84■■■■□ 3.33
C1orf35-202ENST00000465199 MAPKBP1O60336 1514 aa35.81■■■■□ 3.32
C1orf35-202ENST00000465199 SAMD9Q5K651 1589 aa35.78■■■■□ 3.32
C1orf35-202ENST00000465199 P3H3Q8IVL6 736 aa35.74■■■■□ 3.31
C1orf35-202ENST00000465199 ABCC10Q5T3U5 1492 aa35.7■■■■□ 3.31
C1orf35-202ENST00000465199 DIP2BQ9P265 1576 aa35.7■■■■□ 3.31
C1orf35-202ENST00000465199 FAM69CQ0P6D2 419 aa35.67■■■■□ 3.3
C1orf35-202ENST00000465199 ABCC2Q92887 1545 aa35.66■■■■□ 3.3
C1orf35-202ENST00000465199 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa35.66■■■■□ 3.3
C1orf35-202ENST00000465199 EFCAB5A4FU69 1503 aa35.65■■■■□ 3.3
C1orf35-202ENST00000465199 UACAQ9BZF9 1416 aa35.65■■■■□ 3.3
C1orf35-202ENST00000465199 FHOD3Q2V2M9 1422 aa35.63■■■■□ 3.29
C1orf35-202ENST00000465199 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa35.62■■■■□ 3.29
C1orf35-202ENST00000465199 TSPOAP1O95153 1857 aa35.6■■■■□ 3.29
C1orf35-202ENST00000465199 CLIP1P30622 1438 aa35.55■■■■□ 3.28
C1orf35-202ENST00000465199 CEP162Q5TB80 1403 aa35.53■■■■□ 3.28
C1orf35-202ENST00000465199 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP35.52■■■■□ 3.28
C1orf35-202ENST00000465199 ASXL2Q76L83 1435 aa35.49■■■■□ 3.27
C1orf35-202ENST00000465199 PLB1Q6P1J6 1458 aa35.49■■■■□ 3.27
C1orf35-202ENST00000465199 KDM5BQ9UGL1 1544 aa35.47■■■■□ 3.27
C1orf35-202ENST00000465199 ABCA8O94911 1581 aa35.44■■■■□ 3.26
C1orf35-202ENST00000465199 GLI2P10070 1586 aa35.35■■■■□ 3.25
C1orf35-202ENST00000465199 FMN1Q68DA7 1419 aa35.32■■■■□ 3.24
C1orf35-202ENST00000465199 KDM6BO15054 1643 aa35.31■■■■□ 3.24
C1orf35-202ENST00000465199 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa35.29■■■■□ 3.24
C1orf35-202ENST00000465199 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP35.28■■■■□ 3.24
C1orf35-202ENST00000465199 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP35.28■■■■□ 3.24
C1orf35-202ENST00000465199 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP35.25■■■■□ 3.23
C1orf35-202ENST00000465199 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa35.23■■■■□ 3.23
C1orf35-202ENST00000465199 WDR7Q9Y4E6 1490 aa35.22■■■■□ 3.23
C1orf35-202ENST00000465199 ARID3CA6NKF2 412 aa35.2■■■■□ 3.23
C1orf35-202ENST00000465199 ATP10BO94823 1461 aa35.18■■■■□ 3.22
C1orf35-202ENST00000465199 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP35.16■■■■□ 3.22
C1orf35-202ENST00000465199 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa35.15■■■■□ 3.22
C1orf35-202ENST00000465199 KCNH8Q96L42 1107 aa35.09■■■■□ 3.21
C1orf35-202ENST00000465199 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP35.09■■■■□ 3.21
C1orf35-202ENST00000465199 HECW1Q76N89 1606 aa35.09■■■■□ 3.21
C1orf35-202ENST00000465199 CFAP43Q8NDM7 1665 aa35.08■■■■□ 3.21
C1orf35-202ENST00000465199 FYCO1Q9BQS8 1478 aa35.06■■■■□ 3.2
C1orf35-202ENST00000465199 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP35.06■■■■□ 3.2
C1orf35-202ENST00000465199 VPS8Q8N3P4 1428 aa35.06■■■■□ 3.2
C1orf35-202ENST00000465199 TEX14Q8IWB6 1497 aa35.04■■■■□ 3.2
C1orf35-202ENST00000465199 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP35.04■■■■□ 3.2
C1orf35-202ENST00000465199 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa35.01■■■■□ 3.2
C1orf35-202ENST00000465199 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP34.97■■■■□ 3.19
C1orf35-202ENST00000465199 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP34.97■■■■□ 3.19
C1orf35-202ENST00000465199 CD109Q6YHK3 1445 aa34.96■■■■□ 3.19
C1orf35-202ENST00000465199 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa34.89■■■■□ 3.18
C1orf35-202ENST00000465199 CCDC18Q5T9S5 1454 aa34.89■■■■□ 3.18
C1orf35-202ENST00000465199 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP34.89■■■■□ 3.18
C1orf35-202ENST00000465199 ABCA9Q8IUA7 1624 aa34.85■■■■□ 3.17
C1orf35-202ENST00000465199 PLEKHD1A6NEE1 506 aa34.83■■■■□ 3.17
C1orf35-202ENST00000465199 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP34.75■■■■□ 3.15
C1orf35-202ENST00000465199 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP34.73■■■■□ 3.15
C1orf35-202ENST00000465199 TIAM1Q13009 1591 aa34.7■■■■□ 3.15
C1orf35-202ENST00000465199 MAP3K1Q13233 1512 aa34.65■■■■□ 3.14
C1orf35-202ENST00000465199 KIF14Q15058 1648 aa34.64■■■■□ 3.14
C1orf35-202ENST00000465199 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP34.63■■■■□ 3.13
C1orf35-202ENST00000465199 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa34.62■■■■□ 3.13
C1orf35-202ENST00000465199 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP34.62■■■■□ 3.13
C1orf35-202ENST00000465199 ARAP3Q8WWN8 1544 aa34.6■■■■□ 3.13
C1orf35-202ENST00000465199 MTUS2Q5JR59 1369 aa34.6■■■■□ 3.13
C1orf35-202ENST00000465199 TTC37Q6PGP7 1564 aa34.58■■■■□ 3.13
C1orf35-202ENST00000465199 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa34.58■■■■□ 3.13
C1orf35-202ENST00000465199 NEO1Q92859 1461 aa34.56■■■■□ 3.12
C1orf35-202ENST00000465199 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa34.55■■■■□ 3.12
C1orf35-202ENST00000465199 PHLDB1Q86UU1 1377 aa34.55■■■■□ 3.12
C1orf35-202ENST00000465199 ADGRL1O94910 1474 aa34.53■■■■□ 3.12
C1orf35-202ENST00000465199 CFAP74Q9C0B2 1584 aa34.5■■■■□ 3.11
C1orf35-202ENST00000465199 APLP2Q06481 763 aa34.5■■■■□ 3.11
C1orf35-202ENST00000465199 MYO5CQ9NQX4 1742 aa34.44■■■■□ 3.1
C1orf35-202ENST00000465199 FANCAO15360 1455 aa34.44■■■■□ 3.1
C1orf35-202ENST00000465199 RAPGEF3O95398 923 aa34.43■■■■□ 3.1
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