RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465199.5

C1orf35-202, Transcript of chromosome 1 open reading frame 35, humanhuman

TSL 5

Gene C1orf35, Length 588 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf35-202ENST00000465199 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.69■■■■■ 6.03
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C1orf35-202ENST00000465199 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.31■■■■■ 4.68
C1orf35-202ENST00000465199 NACADO15069 1562 aa44.09■■■■■ 4.65
C1orf35-202ENST00000465199 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.03■■■■■ 4.64
C1orf35-202ENST00000465199 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.02■■■■■ 4.64
C1orf35-202ENST00000465199 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.58■■■■■ 4.57
C1orf35-202ENST00000465199 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.57■■■■■ 4.56
C1orf35-202ENST00000465199 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.47■■■■■ 4.55
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C1orf35-202ENST00000465199 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.87■■■■■ 4.45
C1orf35-202ENST00000465199 SCRIBQ14160 1630 aa42.75■■■■■ 4.43
C1orf35-202ENST00000465199 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.36■■■■■ 4.37
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C1orf35-202ENST00000465199 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.87■■■■■ 4.29
C1orf35-202ENST00000465199 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.62■■■■■ 4.25
C1orf35-202ENST00000465199 SMARCA4P51532 1647 aa40.79■■■■■ 4.12
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C1orf35-202ENST00000465199 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.67■■■■■ 4.1
C1orf35-202ENST00000465199 NCAPD3P42695 1498 aa40.62■■■■■ 4.09
C1orf35-202ENST00000465199 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.61■■■■■ 4.09
C1orf35-202ENST00000465199 SMARCA2P51531 1590 aa40.57■■■■■ 4.08
C1orf35-202ENST00000465199 HMGXB3Q12766 1538 aa40.44■■■■■ 4.06
C1orf35-202ENST00000465199 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.39■■■■■ 4.06
C1orf35-202ENST00000465199 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.35■■■■■ 4.05
C1orf35-202ENST00000465199 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.3■■■■■ 4.04
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C1orf35-202ENST00000465199 ERCC6Q03468 1493 aa39.95■■■■□ 3.99
C1orf35-202ENST00000465199 NESP48681 1621 aa39.91■■■■□ 3.98
C1orf35-202ENST00000465199 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.79■■■■□ 3.96
C1orf35-202ENST00000465199 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.73■■■■□ 3.95
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C1orf35-202ENST00000465199 CUX2O14529 1486 aa39.64■■■■□ 3.94
C1orf35-202ENST00000465199 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.55■■■■□ 3.92
C1orf35-202ENST00000465199 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.44■■■■□ 3.9
C1orf35-202ENST00000465199 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.43■■■■□ 3.9
C1orf35-202ENST00000465199 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.42■■■■□ 3.9
C1orf35-202ENST00000465199 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.37■■■■□ 3.89
C1orf35-202ENST00000465199 CFTRP13569 1480 aa39.09■■■■□ 3.85
C1orf35-202ENST00000465199 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.08■■■■□ 3.85
C1orf35-202ENST00000465199 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.05■■■■□ 3.84
C1orf35-202ENST00000465199 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.04■■■■□ 3.84
C1orf35-202ENST00000465199 PRDM2Q13029 1718 aa39■■■■□ 3.83
C1orf35-202ENST00000465199 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.98■■■■□ 3.83
C1orf35-202ENST00000465199 WDR62O43379 1518 aa38.97■■■■□ 3.83
C1orf35-202ENST00000465199 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.68■■■■□ 3.78
C1orf35-202ENST00000465199 TOPBP1Q92547 1522 aa38.36■■■■□ 3.73
C1orf35-202ENST00000465199 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.3■■■■□ 3.72
C1orf35-202ENST00000465199 ABCC8Q09428 1581 aa38.29■■■■□ 3.72
C1orf35-202ENST00000465199 IFT140Q96RY7 1462 aa38.22■■■■□ 3.71
C1orf35-202ENST00000465199 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.12■■■■□ 3.69
C1orf35-202ENST00000465199 CUX1P39880 1505 aa38.11■■■■□ 3.69
C1orf35-202ENST00000465199 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.02■■■■□ 3.68
C1orf35-202ENST00000465199 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.01■■■■□ 3.67
C1orf35-202ENST00000465199 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38■■■■□ 3.67
C1orf35-202ENST00000465199 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.99■■■■□ 3.67
C1orf35-202ENST00000465199 SYNJ1O43426 1573 aa37.93■■■■□ 3.66
C1orf35-202ENST00000465199 OSCARQ8IYS5 282 aa37.9■■■■□ 3.66
C1orf35-202ENST00000465199 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.87■■■■□ 3.65
C1orf35-202ENST00000465199 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.86■■■■□ 3.65
C1orf35-202ENST00000465199 TOP2BQ02880 1626 aa37.85■■■■□ 3.65
C1orf35-202ENST00000465199 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.84■■■■□ 3.654e-7■■■■■ 44.2
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C1orf35-202ENST00000465199 SOGA1O94964 1423 aa37.82■■■■□ 3.64
C1orf35-202ENST00000465199 CHD1O14646 1710 aa37.73■■■■□ 3.63
C1orf35-202ENST00000465199 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.68■■■■□ 3.62
C1orf35-202ENST00000465199 WDR97A6NE52 1622 aa37.65■■■■□ 3.62
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C1orf35-202ENST00000465199 FBLN2P98095 1184 aa37.53■■■■□ 3.6
C1orf35-202ENST00000465199 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.51■■■■□ 3.59
C1orf35-202ENST00000465199 PBRM1Q86U86 1689 aa37.5■■■■□ 3.59
C1orf35-202ENST00000465199 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.49■■■■□ 3.59
C1orf35-202ENST00000465199 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.47■■■■□ 3.59
C1orf35-202ENST00000465199 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.47■■■■□ 3.59
C1orf35-202ENST00000465199 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.47■■■■□ 3.59
C1orf35-202ENST00000465199 GRIN2BQ13224 1484 aa37.43■■■■□ 3.58
C1orf35-202ENST00000465199 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.4■■■■□ 3.58
C1orf35-202ENST00000465199 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.39■■■■□ 3.58
C1orf35-202ENST00000465199 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.39■■■■□ 3.58
C1orf35-202ENST00000465199 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.37■■■■□ 3.57
C1orf35-202ENST00000465199 ARHGEF11O15085 1522 aa37.34■■■■□ 3.57
C1orf35-202ENST00000465199 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.3■■■■□ 3.56
C1orf35-202ENST00000465199 SYNJ2O15056 1496 aa37.26■■■■□ 3.55
C1orf35-202ENST00000465199 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.15■■■■□ 3.54
C1orf35-202ENST00000465199 KIF27Q86VH2 1401 aa37.13■■■■□ 3.53
C1orf35-202ENST00000465199 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.1■■■■□ 3.53
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C1orf35-202ENST00000465199 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.03■■■■□ 3.52
C1orf35-202ENST00000465199 IGF1RP08069 1367 aa37.02■■■■□ 3.52
C1orf35-202ENST00000465199 CYB5RLQ6IPT4 315 aa37.01■■■■□ 3.52
C1orf35-202ENST00000465199 ARAP1Q96P48 1450 aa37■■■■□ 3.51
C1orf35-202ENST00000465199 GRIN2AQ12879 1464 aa36.96■■■■□ 3.51
C1orf35-202ENST00000465199 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.91■■■■□ 3.5
C1orf35-202ENST00000465199 CEP170Q5SW79 1584 aa36.86■■■■□ 3.49
C1orf35-202ENST00000465199 NUP160Q12769 1436 aa36.77■■■■□ 3.48
C1orf35-202ENST00000465199 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.76■■■■□ 3.47
C1orf35-202ENST00000465199 CUL7Q14999 1698 aa36.74■■■■□ 3.47
C1orf35-202ENST00000465199 EEA1Q15075 1411 aa36.72■■■■□ 3.47
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