RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463043.1

KLHL21-203, Transcript of kelch like family member 21, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene KLHL21, Length 667 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL21-203ENST00000463043 ERCC6L2Q5T890 1561 aa42.43■■■■■ 4.38
KLHL21-203ENST00000463043 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa42.35■■■■■ 4.37
KLHL21-203ENST00000463043 JPH4Q96JJ6 628 aa42.32■■■■■ 4.37
KLHL21-203ENST00000463043 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP42.29■■■■■ 4.36
KLHL21-203ENST00000463043 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.26■■■■■ 4.36
KLHL21-203ENST00000463043 PRXQ9BXM0 1461 aa42.11■■■■■ 4.33
KLHL21-203ENST00000463043 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.08■■■■■ 4.33
KLHL21-203ENST00000463043 IQGAP2Q13576 1575 aa42.07■■■■■ 4.33
KLHL21-203ENST00000463043 EEA1Q15075 1411 aa42■■■■■ 4.31
KLHL21-203ENST00000463043 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.96■■■■■ 4.31
KLHL21-203ENST00000463043 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.87■■■■■ 4.29
KLHL21-203ENST00000463043 UGGT2Q9NYU1 1516 aa41.86■■■■■ 4.29
KLHL21-203ENST00000463043 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa41.86■■■■■ 4.29
KLHL21-203ENST00000463043 DISP1Q96F81 1524 aa41.82■■■■■ 4.29
KLHL21-203ENST00000463043 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.76■■■■■ 4.28
KLHL21-203ENST00000463043 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.76■■■■■ 4.27
KLHL21-203ENST00000463043 PTPRGP23470 1445 aa41.74■■■■■ 4.27
KLHL21-203ENST00000463043 ADCY10Q96PN6 1610 aa41.69■■■■■ 4.27
KLHL21-203ENST00000463043 KIAA0556O60303 1618 aa41.69■■■■■ 4.26
KLHL21-203ENST00000463043 KIF21BO75037 1637 aa41.6■■■■■ 4.25
KLHL21-203ENST00000463043 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP41.6■■■■■ 4.25
KLHL21-203ENST00000463043 GOLGA3Q08378 1498 aa41.57■■■■■ 4.25
KLHL21-203ENST00000463043 KIF13AQ9H1H9 1805 aa41.51■■■■■ 4.24
KLHL21-203ENST00000463043 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP41.49■■■■■ 4.23
KLHL21-203ENST00000463043 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa41.47■■■■■ 4.23
KLHL21-203ENST00000463043 UACAQ9BZF9 1416 aa41.47■■■■■ 4.23
KLHL21-203ENST00000463043 MAPKBP1O60336 1514 aa41.46■■■■■ 4.23
KLHL21-203ENST00000463043 ABCC2Q92887 1545 aa41.43■■■■■ 4.22
KLHL21-203ENST00000463043 SAMD9Q5K651 1589 aa41.37■■■■■ 4.21
KLHL21-203ENST00000463043 ABCC10Q5T3U5 1492 aa41.34■■■■■ 4.21
KLHL21-203ENST00000463043 FAM69CQ0P6D2 419 aa41.34■■■■■ 4.21
KLHL21-203ENST00000463043 PLB1Q6P1J6 1458 aa41.3■■■■■ 4.2
KLHL21-203ENST00000463043 KDM5BQ9UGL1 1544 aa41.28■■■■■ 4.2
KLHL21-203ENST00000463043 ABCA8O94911 1581 aa41.26■■■■■ 4.2
KLHL21-203ENST00000463043 DIP2BQ9P265 1576 aa41.25■■■■■ 4.19
KLHL21-203ENST00000463043 P3H3Q8IVL6 736 aa41.25■■■■■ 4.19
KLHL21-203ENST00000463043 EHMT2Q96KQ7 1210 aa41.22■■■■■ 4.19
KLHL21-203ENST00000463043 ASXL2Q76L83 1435 aa41.18■■■■■ 4.18
KLHL21-203ENST00000463043 UBTFP17480 764 aaKnown RBP41.17■■■■■ 4.18
KLHL21-203ENST00000463043 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP41.17■■■■■ 4.18
KLHL21-203ENST00000463043 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP41.16■■■■■ 4.18
KLHL21-203ENST00000463043 EFCAB5A4FU69 1503 aa41.12■■■■■ 4.17
KLHL21-203ENST00000463043 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP41.11■■■■■ 4.17
KLHL21-203ENST00000463043 FHOD3Q2V2M9 1422 aa41.1■■■■■ 4.17
KLHL21-203ENST00000463043 TSPOAP1O95153 1857 aa40.99■■■■■ 4.15
KLHL21-203ENST00000463043 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa40.97■■■■■ 4.15
KLHL21-203ENST00000463043 GLI2P10070 1586 aa40.96■■■■■ 4.15
KLHL21-203ENST00000463043 WDR7Q9Y4E6 1490 aa40.94■■■■■ 4.14
KLHL21-203ENST00000463043 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP40.93■■■■■ 4.14
KLHL21-203ENST00000463043 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.91■■■■■ 4.14
KLHL21-203ENST00000463043 ATP10BO94823 1461 aa40.9■■■■■ 4.14
KLHL21-203ENST00000463043 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP40.86■■■■■ 4.13
KLHL21-203ENST00000463043 KDM6BO15054 1643 aa40.85■■■■■ 4.13
KLHL21-203ENST00000463043 ARID3CA6NKF2 412 aa40.84■■■■■ 4.13
KLHL21-203ENST00000463043 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa40.76■■■■■ 4.12
KLHL21-203ENST00000463043 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP40.74■■■■■ 4.11
KLHL21-203ENST00000463043 FMN1Q68DA7 1419 aa40.73■■■■■ 4.11
KLHL21-203ENST00000463043 KCNH8Q96L42 1107 aa40.67■■■■■ 4.1
KLHL21-203ENST00000463043 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP40.62■■■■■ 4.09
KLHL21-203ENST00000463043 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP40.62■■■■■ 4.09
KLHL21-203ENST00000463043 CFAP43Q8NDM7 1665 aa40.59■■■■■ 4.09
KLHL21-203ENST00000463043 CLIP1P30622 1438 aa40.58■■■■■ 4.09
KLHL21-203ENST00000463043 HECW1Q76N89 1606 aa40.56■■■■■ 4.08
KLHL21-203ENST00000463043 CD109Q6YHK3 1445 aa40.56■■■■■ 4.08
KLHL21-203ENST00000463043 TEX14Q8IWB6 1497 aa40.55■■■■■ 4.08
KLHL21-203ENST00000463043 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP40.54■■■■■ 4.08
KLHL21-203ENST00000463043 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa40.52■■■■■ 4.08
KLHL21-203ENST00000463043 ABCA9Q8IUA7 1624 aa40.49■■■■■ 4.07
KLHL21-203ENST00000463043 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP40.46■■■■■ 4.07
KLHL21-203ENST00000463043 PLEKHD1A6NEE1 506 aa40.46■■■■■ 4.07
KLHL21-203ENST00000463043 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa40.45■■■■■ 4.07
KLHL21-203ENST00000463043 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP40.44■■■■■ 4.06
KLHL21-203ENST00000463043 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP40.42■■■■■ 4.06
KLHL21-203ENST00000463043 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa40.42■■■■■ 4.06
KLHL21-203ENST00000463043 CEP162Q5TB80 1403 aa40.36■■■■■ 4.05
KLHL21-203ENST00000463043 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa40.36■■■■■ 4.05
KLHL21-203ENST00000463043 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa40.33■■■■■ 4.05
KLHL21-203ENST00000463043 FYCO1Q9BQS8 1478 aa40.31■■■■■ 4.04
KLHL21-203ENST00000463043 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP40.29■■■■■ 4.045e-7■■■■□ 20.6
KLHL21-203ENST00000463043 CCDC18Q5T9S5 1454 aa40.26■■■■■ 4.03
KLHL21-203ENST00000463043 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP40.25■■■■■ 4.03
KLHL21-203ENST00000463043 TTC37Q6PGP7 1564 aa40.24■■■■■ 4.03
KLHL21-203ENST00000463043 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP40.2■■■■■ 4.03
KLHL21-203ENST00000463043 NEO1Q92859 1461 aa40.18■■■■■ 4.02
KLHL21-203ENST00000463043 ARAP3Q8WWN8 1544 aa40.17■■■■■ 4.02
KLHL21-203ENST00000463043 PHLDB1Q86UU1 1377 aa40.17■■■■■ 4.02
KLHL21-203ENST00000463043 KIF14Q15058 1648 aa40.13■■■■■ 4.01
KLHL21-203ENST00000463043 ADGRL1O94910 1474 aa40.12■■■■■ 4.01
KLHL21-203ENST00000463043 FANCAO15360 1455 aa40.05■■■■■ 4
KLHL21-203ENST00000463043 PLCH2O75038 1416 aa40.04■■■■■ 4
KLHL21-203ENST00000463043 CFAP74Q9C0B2 1584 aa40.02■■■■■ 4
KLHL21-203ENST00000463043 AKNAQ7Z591 1439 aa39.99■■■■□ 3.99
KLHL21-203ENST00000463043 MYO5CQ9NQX4 1742 aa39.97■■■■□ 3.99
KLHL21-203ENST00000463043 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa39.93■■■■□ 3.98
KLHL21-203ENST00000463043 RAPGEF3O95398 923 aa39.92■■■■□ 3.98
KLHL21-203ENST00000463043 VPS8Q8N3P4 1428 aa39.89■■■■□ 3.98
KLHL21-203ENST00000463043 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP39.88■■■■□ 3.98
KLHL21-203ENST00000463043 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa39.84■■■■□ 3.97
KLHL21-203ENST00000463043 RICTORQ6R327 1708 aa39.83■■■■□ 3.97
KLHL21-203ENST00000463043 ARHGAP5Q13017 1502 aa39.82■■■■□ 3.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87.6 ms