RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460236.5

PHF20L1-211, Transcript of PHD finger protein 20 like 1, humanhuman

TSL 5

Gene PHF20L1, Length 3,393 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF20L1-211ENST00000460236 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa8.69□□□□□ -1.02
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PHF20L1-211ENST00000460236 EEA1Q15075 1411 aa8.68□□□□□ -1.02
PHF20L1-211ENST00000460236 CLIP1P30622 1438 aa8.67□□□□□ -1.02
PHF20L1-211ENST00000460236 TNIKQ9UKE5 1360 aa8.65□□□□□ -1.02
PHF20L1-211ENST00000460236 DNMBPQ6XZF7 1577 aa8.64□□□□□ -1.03
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PHF20L1-211ENST00000460236 MRC2Q9UBG0 1479 aa8.64□□□□□ -1.03
PHF20L1-211ENST00000460236 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
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PHF20L1-211ENST00000460236 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa8.62□□□□□ -1.03
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PHF20L1-211ENST00000460236 FHOD3Q2V2M9 1422 aa8.56□□□□□ -1.04
PHF20L1-211ENST00000460236 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
PHF20L1-211ENST00000460236 PRDM2Q13029 1718 aa8.56□□□□□ -1.04
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PHF20L1-211ENST00000460236 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PHF20L1-211ENST00000460236 GRIN2BQ13224 1484 aa8.5□□□□□ -1.05
PHF20L1-211ENST00000460236 ARAP1Q96P48 1450 aa8.5□□□□□ -1.05
PHF20L1-211ENST00000460236 C14orf37Q86TY3 774 aa8.5□□□□□ -1.05
PHF20L1-211ENST00000460236 VPS8Q8N3P4 1428 aa8.49□□□□□ -1.05
PHF20L1-211ENST00000460236 JPH4Q96JJ6 628 aa8.49□□□□□ -1.05
PHF20L1-211ENST00000460236 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa8.48□□□□□ -1.05
PHF20L1-211ENST00000460236 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
PHF20L1-211ENST00000460236 WDR62O43379 1518 aa8.47□□□□□ -1.05
PHF20L1-211ENST00000460236 FHAD1B1AJZ9 1412 aa8.47□□□□□ -1.05
PHF20L1-211ENST00000460236 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa8.47□□□□□ -1.05
PHF20L1-211ENST00000460236 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
PHF20L1-211ENST00000460236 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
PHF20L1-211ENST00000460236 ERICH3Q5RHP9 1530 aa8.45□□□□□ -1.06
PHF20L1-211ENST00000460236 KCNH8Q96L42 1107 aa8.45□□□□□ -1.06
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PHF20L1-211ENST00000460236 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
PHF20L1-211ENST00000460236 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
PHF20L1-211ENST00000460236 MTUS2Q5JR59 1369 aa8.44□□□□□ -1.06
PHF20L1-211ENST00000460236 CHIC2Q9UKJ5 165 aa8.43□□□□□ -1.06
PHF20L1-211ENST00000460236 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
PHF20L1-211ENST00000460236 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa8.42□□□□□ -1.06
PHF20L1-211ENST00000460236 GRIN2AQ12879 1464 aa8.4□□□□□ -1.06
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PHF20L1-211ENST00000460236 BCANQ96GW7 911 aa8.39□□□□□ -1.07
PHF20L1-211ENST00000460236 MYT1LQ9UL68 1186 aa8.39□□□□□ -1.07
PHF20L1-211ENST00000460236 PBRM1Q86U86 1689 aa8.39□□□□□ -1.07
PHF20L1-211ENST00000460236 CUL7Q14999 1698 aa8.38□□□□□ -1.07
PHF20L1-211ENST00000460236 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
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PHF20L1-211ENST00000460236 SYNJ2O15056 1496 aa8.38□□□□□ -1.07
PHF20L1-211ENST00000460236 ADAMTS12P58397 1594 aa8.36□□□□□ -1.07
PHF20L1-211ENST00000460236 PPP6R1Q9UPN7 881 aa8.36□□□□□ -1.07
PHF20L1-211ENST00000460236 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
PHF20L1-211ENST00000460236 WDR97A6NE52 1622 aa8.36□□□□□ -1.07
PHF20L1-211ENST00000460236 OSCARQ8IYS5 282 aa8.36□□□□□ -1.07
PHF20L1-211ENST00000460236 FMN1Q68DA7 1419 aa8.35□□□□□ -1.07
PHF20L1-211ENST00000460236 IQGAP2Q13576 1575 aa8.35□□□□□ -1.07
PHF20L1-211ENST00000460236 CYB5RLQ6IPT4 315 aa8.35□□□□□ -1.07
PHF20L1-211ENST00000460236 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa8.35□□□□□ -1.07
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PHF20L1-211ENST00000460236 PLEKHD1A6NEE1 506 aa8.34□□□□□ -1.07
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PHF20L1-211ENST00000460236 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa8.33□□□□□ -1.08
PHF20L1-211ENST00000460236 PTPRGP23470 1445 aa8.33□□□□□ -1.08
PHF20L1-211ENST00000460236 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
PHF20L1-211ENST00000460236 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
PHF20L1-211ENST00000460236 PHLDB1Q86UU1 1377 aa8.32□□□□□ -1.08
PHF20L1-211ENST00000460236 NEUROD1Q13562 356 aa8.32□□□□□ -1.08
PHF20L1-211ENST00000460236 TRIM52Q96A61 297 aa8.32□□□□□ -1.08
PHF20L1-211ENST00000460236 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PHF20L1-211ENST00000460236 PLCB2Q00722 1185 aa8.31□□□□□ -1.08
PHF20L1-211ENST00000460236 CEP170Q5SW79 1584 aa8.31□□□□□ -1.08
PHF20L1-211ENST00000460236 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa8.31□□□□□ -1.08
PHF20L1-211ENST00000460236 CCNB3Q8WWL7 1395 aa8.31□□□□□ -1.08
PHF20L1-211ENST00000460236 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa8.3□□□□□ -1.08
PHF20L1-211ENST00000460236 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP8.3□□□□□ -1.08
PHF20L1-211ENST00000460236 PDE4CQ08493 712 aa8.3□□□□□ -1.08
PHF20L1-211ENST00000460236 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PHF20L1-211ENST00000460236 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PHF20L1-211ENST00000460236 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa8.28□□□□□ -1.08
PHF20L1-211ENST00000460236 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa8.28□□□□□ -1.08
PHF20L1-211ENST00000460236 TMEM132AQ24JP5 1023 aa8.28□□□□□ -1.08
PHF20L1-211ENST00000460236 DISP1Q96F81 1524 aa8.27□□□□□ -1.09
PHF20L1-211ENST00000460236 EFCAB5A4FU69 1503 aa8.26□□□□□ -1.09
PHF20L1-211ENST00000460236 CHD1O14646 1710 aa8.26□□□□□ -1.09
PHF20L1-211ENST00000460236 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
PHF20L1-211ENST00000460236 TIAM1Q13009 1591 aa8.25□□□□□ -1.09
PHF20L1-211ENST00000460236 ERCC6L2Q5T890 1561 aa8.25□□□□□ -1.09
PHF20L1-211ENST00000460236 NUP160Q12769 1436 aa8.25□□□□□ -1.09
PHF20L1-211ENST00000460236 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP8.25□□□□□ -1.09
PHF20L1-211ENST00000460236 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
PHF20L1-211ENST00000460236 FYCO1Q9BQS8 1478 aa8.25□□□□□ -1.09
PHF20L1-211ENST00000460236 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP8.24□□□□□ -1.09
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