RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452765.6

SH3BP2-204, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-204ENST00000452765 SYNJ2O15056 1496 aa33.13■■■□□ 2.89
SH3BP2-204ENST00000452765 GRIN2AQ12879 1464 aa33.13■■■□□ 2.89
SH3BP2-204ENST00000452765 P3H3Q8IVL6 736 aa33.11■■■□□ 2.89
SH3BP2-204ENST00000452765 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa33.08■■■□□ 2.89
SH3BP2-204ENST00000452765 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP33.07■■■□□ 2.88
SH3BP2-204ENST00000452765 ARAP1Q96P48 1450 aa33.04■■■□□ 2.88
SH3BP2-204ENST00000452765 CEP170Q5SW79 1584 aa32.98■■■□□ 2.87
SH3BP2-204ENST00000452765 CHD1O14646 1710 aa32.95■■■□□ 2.87
SH3BP2-204ENST00000452765 IQGAP2Q13576 1575 aa32.92■■■□□ 2.86
SH3BP2-204ENST00000452765 VPS8Q8N3P4 1428 aa32.9■■■□□ 2.86
SH3BP2-204ENST00000452765 FHOD3Q2V2M9 1422 aa32.89■■■□□ 2.86
SH3BP2-204ENST00000452765 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa32.87■■■□□ 2.85
SH3BP2-204ENST00000452765 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP32.87■■■□□ 2.85
SH3BP2-204ENST00000452765 NUP160Q12769 1436 aa32.86■■■□□ 2.85
SH3BP2-204ENST00000452765 SAMD9Q5K651 1589 aa32.78■■■□□ 2.84
SH3BP2-204ENST00000452765 EFCAB5A4FU69 1503 aa32.77■■■□□ 2.84
SH3BP2-204ENST00000452765 JPH4Q96JJ6 628 aa32.74■■■□□ 2.83
SH3BP2-204ENST00000452765 UGGT2Q9NYU1 1516 aa32.71■■■□□ 2.83
SH3BP2-204ENST00000452765 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP32.69■■■□□ 2.82
SH3BP2-204ENST00000452765 DISP1Q96F81 1524 aa32.68■■■□□ 2.82
SH3BP2-204ENST00000452765 APLP2Q06481 763 aa32.61■■■□□ 2.81
SH3BP2-204ENST00000452765 KIAA0556O60303 1618 aa32.6■■■□□ 2.81
SH3BP2-204ENST00000452765 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP32.6■■■□□ 2.81
SH3BP2-204ENST00000452765 PCGF6Q9BYE7 350 aa32.56■■■□□ 2.8
SH3BP2-204ENST00000452765 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP32.55■■■□□ 2.8
SH3BP2-204ENST00000452765 FMN1Q68DA7 1419 aa32.54■■■□□ 2.8
SH3BP2-204ENST00000452765 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP32.52■■■□□ 2.8
SH3BP2-204ENST00000452765 ARID3CA6NKF2 412 aa32.48■■■□□ 2.79
SH3BP2-204ENST00000452765 CLASP1Q7Z460 1538 aa32.48■■■□□ 2.79
SH3BP2-204ENST00000452765 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa32.47■■■□□ 2.79
SH3BP2-204ENST00000452765 ERCC6L2Q5T890 1561 aa32.46■■■□□ 2.79
SH3BP2-204ENST00000452765 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa32.45■■■□□ 2.79
SH3BP2-204ENST00000452765 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP32.43■■■□□ 2.78
SH3BP2-204ENST00000452765 FYCO1Q9BQS8 1478 aa32.42■■■□□ 2.78
SH3BP2-204ENST00000452765 SHROOM2Q13796 1616 aa32.42■■■□□ 2.78
SH3BP2-204ENST00000452765 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa32.41■■■□□ 2.78
SH3BP2-204ENST00000452765 OSCARQ8IYS5 282 aa32.4■■■□□ 2.78
SH3BP2-204ENST00000452765 TIAM1Q13009 1591 aa32.36■■■□□ 2.77
SH3BP2-204ENST00000452765 PLB1Q6P1J6 1458 aa32.34■■■□□ 2.77
SH3BP2-204ENST00000452765 PTPRGP23470 1445 aa32.26■■■□□ 2.76
SH3BP2-204ENST00000452765 CFAP43Q8NDM7 1665 aa32.26■■■□□ 2.75
SH3BP2-204ENST00000452765 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP32.25■■■□□ 2.75
SH3BP2-204ENST00000452765 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa32.25■■■□□ 2.75
SH3BP2-204ENST00000452765 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa32.24■■■□□ 2.75
SH3BP2-204ENST00000452765 MAP3K1Q13233 1512 aa32.23■■■□□ 2.75
SH3BP2-204ENST00000452765 HECW1Q76N89 1606 aa32.23■■■□□ 2.75
SH3BP2-204ENST00000452765 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP32.22■■■□□ 2.75
SH3BP2-204ENST00000452765 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP32.21■■■□□ 2.75
SH3BP2-204ENST00000452765 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP32.18■■■□□ 2.74
SH3BP2-204ENST00000452765 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP32.18■■■□□ 2.74
SH3BP2-204ENST00000452765 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa32.14■■■□□ 2.74
SH3BP2-204ENST00000452765 ABCA8O94911 1581 aa32.13■■■□□ 2.73
SH3BP2-204ENST00000452765 MTUS2Q5JR59 1369 aa32.11■■■□□ 2.73
SH3BP2-204ENST00000452765 CCDC18Q5T9S5 1454 aa32.09■■■□□ 2.73
SH3BP2-204ENST00000452765 PHLDB1Q86UU1 1377 aa32.04■■■□□ 2.72
SH3BP2-204ENST00000452765 UACAQ9BZF9 1416 aa32.04■■■□□ 2.72
SH3BP2-204ENST00000452765 ATP10BO94823 1461 aa32■■■□□ 2.71
SH3BP2-204ENST00000452765 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa31.94■■■□□ 2.7
SH3BP2-204ENST00000452765 NCOA2Q15596 1464 aa31.92■■■□□ 2.7
SH3BP2-204ENST00000452765 ABCC2Q92887 1545 aa31.91■■■□□ 2.7
SH3BP2-204ENST00000452765 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP31.88■■■□□ 2.69
SH3BP2-204ENST00000452765 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP31.88■■■□□ 2.69
SH3BP2-204ENST00000452765 ARHGEF11O15085 1522 aa31.85■■■□□ 2.69
SH3BP2-204ENST00000452765 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP31.85■■■□□ 2.69
SH3BP2-204ENST00000452765 PLEKHD1A6NEE1 506 aa31.84■■■□□ 2.69
SH3BP2-204ENST00000452765 CCNB3Q8WWL7 1395 aa31.83■■■□□ 2.69
SH3BP2-204ENST00000452765 ITGAEP38570 1179 aa31.82■■■□□ 2.68
SH3BP2-204ENST00000452765 ADCY10Q96PN6 1610 aa31.82■■■□□ 2.68
SH3BP2-204ENST00000452765 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP31.81■■■□□ 2.68
SH3BP2-204ENST00000452765 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP31.8■■■□□ 2.68
SH3BP2-204ENST00000452765 KIF14Q15058 1648 aa31.79■■■□□ 2.68
SH3BP2-204ENST00000452765 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa31.77■■■□□ 2.68
SH3BP2-204ENST00000452765 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP31.76■■■□□ 2.67
SH3BP2-204ENST00000452765 CYB5RLQ6IPT4 315 aa31.73■■■□□ 2.67
SH3BP2-204ENST00000452765 MYOM3Q5VTT5 1437 aa31.73■■■□□ 2.67
SH3BP2-204ENST00000452765 FGD6Q6ZV73 1430 aa31.73■■■□□ 2.67
SH3BP2-204ENST00000452765 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa31.72■■■□□ 2.67
SH3BP2-204ENST00000452765 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa31.72■■■□□ 2.67
SH3BP2-204ENST00000452765 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa31.72■■■□□ 2.67
SH3BP2-204ENST00000452765 KDM5BQ9UGL1 1544 aa31.72■■■□□ 2.67
SH3BP2-204ENST00000452765 KCNH8Q96L42 1107 aa31.71■■■□□ 2.67
SH3BP2-204ENST00000452765 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP31.62■■■□□ 2.65
SH3BP2-204ENST00000452765 PTPN23Q9H3S7 1636 aa31.59■■■□□ 2.65
SH3BP2-204ENST00000452765 ABCC10Q5T3U5 1492 aa31.58■■■□□ 2.65
SH3BP2-204ENST00000452765 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP31.57■■■□□ 2.64
SH3BP2-204ENST00000452765 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP31.56■■■□□ 2.64
SH3BP2-204ENST00000452765 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP31.54■■■□□ 2.64
SH3BP2-204ENST00000452765 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP31.52■■■□□ 2.64
SH3BP2-204ENST00000452765 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa31.52■■■□□ 2.64
SH3BP2-204ENST00000452765 TTC37Q6PGP7 1564 aa31.5■■■□□ 2.63
SH3BP2-204ENST00000452765 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP31.5■■■□□ 2.63
SH3BP2-204ENST00000452765 ASXL2Q76L83 1435 aa31.49■■■□□ 2.63
SH3BP2-204ENST00000452765 PTPRKQ15262 1439 aa31.49■■■□□ 2.63
SH3BP2-204ENST00000452765 MIA2Q96PC5 1412 aa31.49■■■□□ 2.63
SH3BP2-204ENST00000452765 WDR7Q9Y4E6 1490 aa31.46■■■□□ 2.63
SH3BP2-204ENST00000452765 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP31.45■■■□□ 2.632e-6■□□□□ 10.9
SH3BP2-204ENST00000452765 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP31.45■■■□□ 2.63
SH3BP2-204ENST00000452765 ITSN2Q9NZM3 1697 aa31.43■■■□□ 2.62
SH3BP2-204ENST00000452765 CHIC2Q9UKJ5 165 aa31.43■■■□□ 2.62
SH3BP2-204ENST00000452765 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa31.41■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 902 ms