RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449666.3

SLC47A1P1-202, Transcript of SLC47A1 pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene SLC47A1P1, Length 945 nt, Biotype transcribed unprocessed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC47A1P1-202ENST00000449666 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP37.47■■■■□ 3.59
SLC47A1P1-202ENST00000449666 JPH4Q96JJ6 628 aa37.44■■■■□ 3.58
SLC47A1P1-202ENST00000449666 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.29■■■■□ 3.56
SLC47A1P1-202ENST00000449666 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.26■■■■□ 3.56
SLC47A1P1-202ENST00000449666 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa37.22■■■■□ 3.55
SLC47A1P1-202ENST00000449666 KIF13AQ9H1H9 1805 aa37.18■■■■□ 3.54
SLC47A1P1-202ENST00000449666 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa37.12■■■■□ 3.53
SLC47A1P1-202ENST00000449666 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP37.11■■■■□ 3.53
SLC47A1P1-202ENST00000449666 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP37.11■■■■□ 3.53
SLC47A1P1-202ENST00000449666 MAPKBP1O60336 1514 aa37.08■■■■□ 3.53
SLC47A1P1-202ENST00000449666 ADCY10Q96PN6 1610 aa37.06■■■■□ 3.52
SLC47A1P1-202ENST00000449666 ABCC10Q5T3U5 1492 aa37.04■■■■□ 3.52
SLC47A1P1-202ENST00000449666 PRXQ9BXM0 1461 aa37.01■■■■□ 3.52
SLC47A1P1-202ENST00000449666 EEA1Q15075 1411 aa37.01■■■■□ 3.51
SLC47A1P1-202ENST00000449666 FAM69CQ0P6D2 419 aa36.97■■■■□ 3.51
SLC47A1P1-202ENST00000449666 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa36.96■■■■□ 3.51
SLC47A1P1-202ENST00000449666 IQGAP2Q13576 1575 aa36.94■■■■□ 3.5
SLC47A1P1-202ENST00000449666 DIP2BQ9P265 1576 aa36.94■■■■□ 3.5
SLC47A1P1-202ENST00000449666 CSRNP3Q8WYN3 585 aa36.93■■■■□ 3.5
SLC47A1P1-202ENST00000449666 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP36.91■■■■□ 3.5
SLC47A1P1-202ENST00000449666 PTPRGP23470 1445 aa36.88■■■■□ 3.49
SLC47A1P1-202ENST00000449666 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa36.87■■■■□ 3.49
SLC47A1P1-202ENST00000449666 TNIKQ9UKE5 1360 aa36.82■■■■□ 3.49
SLC47A1P1-202ENST00000449666 KIF21BO75037 1637 aa36.76■■■■□ 3.48
SLC47A1P1-202ENST00000449666 ABCC2Q92887 1545 aa36.72■■■■□ 3.47
SLC47A1P1-202ENST00000449666 UGGT2Q9NYU1 1516 aa36.7■■■■□ 3.47
SLC47A1P1-202ENST00000449666 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP36.7■■■■□ 3.47
SLC47A1P1-202ENST00000449666 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa36.66■■■■□ 3.46
SLC47A1P1-202ENST00000449666 DISP1Q96F81 1524 aa36.65■■■■□ 3.46
SLC47A1P1-202ENST00000449666 KDM6BO15054 1643 aa36.65■■■■□ 3.46
SLC47A1P1-202ENST00000449666 TSPOAP1O95153 1857 aa36.63■■■■□ 3.45
SLC47A1P1-202ENST00000449666 KIAA0556O60303 1618 aa36.61■■■■□ 3.45
SLC47A1P1-202ENST00000449666 UACAQ9BZF9 1416 aa36.6■■■■□ 3.45
SLC47A1P1-202ENST00000449666 PLB1Q6P1J6 1458 aa36.6■■■■□ 3.45
SLC47A1P1-202ENST00000449666 ASXL2Q76L83 1435 aa36.58■■■■□ 3.45
SLC47A1P1-202ENST00000449666 GLI2P10070 1586 aa36.53■■■■□ 3.44
SLC47A1P1-202ENST00000449666 KDM5BQ9UGL1 1544 aa36.48■■■■□ 3.43
SLC47A1P1-202ENST00000449666 EHMT2Q96KQ7 1210 aa36.47■■■■□ 3.43
SLC47A1P1-202ENST00000449666 GOLGA3Q08378 1498 aa36.47■■■■□ 3.43
SLC47A1P1-202ENST00000449666 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP36.4■■■■□ 3.42
SLC47A1P1-202ENST00000449666 SAMD9Q5K651 1589 aa36.4■■■■□ 3.42
SLC47A1P1-202ENST00000449666 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP36.38■■■■□ 3.41
SLC47A1P1-202ENST00000449666 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP36.37■■■■□ 3.41
SLC47A1P1-202ENST00000449666 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa36.31■■■■□ 3.4
SLC47A1P1-202ENST00000449666 UBTFP17480 764 aaKnown RBP36.3■■■■□ 3.4
SLC47A1P1-202ENST00000449666 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP36.28■■■■□ 3.4
SLC47A1P1-202ENST00000449666 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa36.27■■■■□ 3.4
SLC47A1P1-202ENST00000449666 TEX14Q8IWB6 1497 aa36.25■■■■□ 3.39
SLC47A1P1-202ENST00000449666 P3H3Q8IVL6 736 aa36.24■■■■□ 3.39
SLC47A1P1-202ENST00000449666 WDR7Q9Y4E6 1490 aa36.23■■■■□ 3.39
SLC47A1P1-202ENST00000449666 EFCAB5A4FU69 1503 aa36.2■■■■□ 3.39
SLC47A1P1-202ENST00000449666 ABCA8O94911 1581 aa36.18■■■■□ 3.38
SLC47A1P1-202ENST00000449666 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP36.13■■■■□ 3.37
SLC47A1P1-202ENST00000449666 FHOD3Q2V2M9 1422 aa36.13■■■■□ 3.37
SLC47A1P1-202ENST00000449666 CFAP43Q8NDM7 1665 aa36.04■■■■□ 3.36
SLC47A1P1-202ENST00000449666 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa36.04■■■■□ 3.36
SLC47A1P1-202ENST00000449666 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa36.03■■■■□ 3.36
SLC47A1P1-202ENST00000449666 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa36.02■■■■□ 3.36
SLC47A1P1-202ENST00000449666 CD109Q6YHK3 1445 aa36■■■■□ 3.35
SLC47A1P1-202ENST00000449666 ADGRL1O94910 1474 aa36■■■■□ 3.35
SLC47A1P1-202ENST00000449666 KCNH8Q96L42 1107 aa35.97■■■■□ 3.35
SLC47A1P1-202ENST00000449666 ATP10BO94823 1461 aa35.86■■■■□ 3.33
SLC47A1P1-202ENST00000449666 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP35.85■■■■□ 3.33
SLC47A1P1-202ENST00000449666 ARID3CA6NKF2 412 aa35.84■■■■□ 3.33
SLC47A1P1-202ENST00000449666 CLIP1P30622 1438 aa35.81■■■■□ 3.32
SLC47A1P1-202ENST00000449666 FMN1Q68DA7 1419 aa35.79■■■■□ 3.32
SLC47A1P1-202ENST00000449666 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa35.76■■■■□ 3.32
SLC47A1P1-202ENST00000449666 ARAP3Q8WWN8 1544 aa35.73■■■■□ 3.31
SLC47A1P1-202ENST00000449666 ABCA9Q8IUA7 1624 aa35.73■■■■□ 3.31
SLC47A1P1-202ENST00000449666 HECW1Q76N89 1606 aa35.72■■■■□ 3.31
SLC47A1P1-202ENST00000449666 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa35.69■■■■□ 3.3
SLC47A1P1-202ENST00000449666 CEP162Q5TB80 1403 aa35.69■■■■□ 3.3
SLC47A1P1-202ENST00000449666 PHLDB1Q86UU1 1377 aa35.69■■■■□ 3.3
SLC47A1P1-202ENST00000449666 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP35.68■■■■□ 3.3
SLC47A1P1-202ENST00000449666 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP35.66■■■■□ 3.3
SLC47A1P1-202ENST00000449666 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP35.62■■■■□ 3.29
SLC47A1P1-202ENST00000449666 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP35.62■■■■□ 3.29
SLC47A1P1-202ENST00000449666 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP35.58■■■■□ 3.29
SLC47A1P1-202ENST00000449666 NEO1Q92859 1461 aa35.58■■■■□ 3.29
SLC47A1P1-202ENST00000449666 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa35.55■■■■□ 3.28
SLC47A1P1-202ENST00000449666 HECW2Q9P2P5 1572 aa35.54■■■■□ 3.28
SLC47A1P1-202ENST00000449666 FYCO1Q9BQS8 1478 aa35.5■■■■□ 3.27
SLC47A1P1-202ENST00000449666 PLEKHD1A6NEE1 506 aa35.46■■■■□ 3.27
SLC47A1P1-202ENST00000449666 RAPGEF3O95398 923 aa35.44■■■■□ 3.26
SLC47A1P1-202ENST00000449666 CCDC18Q5T9S5 1454 aa35.41■■■■□ 3.26
SLC47A1P1-202ENST00000449666 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa35.39■■■■□ 3.26
SLC47A1P1-202ENST00000449666 TTC37Q6PGP7 1564 aa35.35■■■■□ 3.25
SLC47A1P1-202ENST00000449666 CFAP74Q9C0B2 1584 aa35.34■■■■□ 3.25
SLC47A1P1-202ENST00000449666 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP35.34■■■■□ 3.25
SLC47A1P1-202ENST00000449666 ADAMTSL3P82987 1691 aa35.33■■■■□ 3.25
SLC47A1P1-202ENST00000449666 KIF14Q15058 1648 aa35.33■■■■□ 3.25
SLC47A1P1-202ENST00000449666 FANCAO15360 1455 aa35.3■■■■□ 3.24
SLC47A1P1-202ENST00000449666 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP35.3■■■■□ 3.24
SLC47A1P1-202ENST00000449666 AKNAQ7Z591 1439 aa35.29■■■■□ 3.24
SLC47A1P1-202ENST00000449666 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP35.28■■■■□ 3.24
SLC47A1P1-202ENST00000449666 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP35.28■■■■□ 3.24
SLC47A1P1-202ENST00000449666 RICTORQ6R327 1708 aa35.27■■■■□ 3.24
SLC47A1P1-202ENST00000449666 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP35.27■■■■□ 3.24
SLC47A1P1-202ENST00000449666 PTPRMP28827 1452 aa35.26■■■■□ 3.23
SLC47A1P1-202ENST00000449666 BCORL1Q5H9F3 1711 aa35.25■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.4 ms