RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444916.5

SH3BP4-205, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP4, Length 570 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-205ENST00000444916 KIF13AQ9H1H9 1805 aa24.21■■□□□ 1.47
SH3BP4-205ENST00000444916 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
SH3BP4-205ENST00000444916 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.15■■□□□ 1.46
SH3BP4-205ENST00000444916 JPH4Q96JJ6 628 aa24.11■■□□□ 1.45
SH3BP4-205ENST00000444916 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.11■■□□□ 1.45
SH3BP4-205ENST00000444916 FAM69CQ0P6D2 419 aa24.04■■□□□ 1.44
SH3BP4-205ENST00000444916 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.04■■□□□ 1.44
SH3BP4-205ENST00000444916 ABCC10Q5T3U5 1492 aa24.01■■□□□ 1.43
SH3BP4-205ENST00000444916 ADCY10Q96PN6 1610 aa23.97■■□□□ 1.43
SH3BP4-205ENST00000444916 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.97■■□□□ 1.43
SH3BP4-205ENST00000444916 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP23.96■■□□□ 1.43
SH3BP4-205ENST00000444916 DIP2BQ9P265 1576 aa23.95■■□□□ 1.43
SH3BP4-205ENST00000444916 MAPKBP1O60336 1514 aa23.95■■□□□ 1.43
SH3BP4-205ENST00000444916 IQGAP2Q13576 1575 aa23.9■■□□□ 1.42
SH3BP4-205ENST00000444916 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa23.86■■□□□ 1.41
SH3BP4-205ENST00000444916 PRXQ9BXM0 1461 aa23.85■■□□□ 1.41
SH3BP4-205ENST00000444916 TSPOAP1O95153 1857 aa23.85■■□□□ 1.41
SH3BP4-205ENST00000444916 KDM6BO15054 1643 aa23.84■■□□□ 1.41
SH3BP4-205ENST00000444916 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.79■■□□□ 1.4
SH3BP4-205ENST00000444916 EEA1Q15075 1411 aa23.79■■□□□ 1.4
SH3BP4-205ENST00000444916 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.78■■□□□ 1.4
SH3BP4-205ENST00000444916 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
SH3BP4-205ENST00000444916 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.76■■□□□ 1.39
SH3BP4-205ENST00000444916 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.75■■□□□ 1.39
SH3BP4-205ENST00000444916 PTPRGP23470 1445 aa23.73■■□□□ 1.39
SH3BP4-205ENST00000444916 DISP1Q96F81 1524 aa23.73■■□□□ 1.39
SH3BP4-205ENST00000444916 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.72■■□□□ 1.39
SH3BP4-205ENST00000444916 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.72■■□□□ 1.39
SH3BP4-205ENST00000444916 KIAA0556O60303 1618 aa23.68■■□□□ 1.38
SH3BP4-205ENST00000444916 ABCC2Q92887 1545 aa23.64■■□□□ 1.38
SH3BP4-205ENST00000444916 ASXL2Q76L83 1435 aa23.63■■□□□ 1.37
SH3BP4-205ENST00000444916 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
SH3BP4-205ENST00000444916 GOLGA3Q08378 1498 aa23.61■■□□□ 1.37
SH3BP4-205ENST00000444916 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
SH3BP4-205ENST00000444916 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
SH3BP4-205ENST00000444916 KIF21BO75037 1637 aa23.57■■□□□ 1.36
SH3BP4-205ENST00000444916 GLI2P10070 1586 aa23.57■■□□□ 1.36
SH3BP4-205ENST00000444916 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa23.56■■□□□ 1.36
SH3BP4-205ENST00000444916 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.56■■□□□ 1.36
SH3BP4-205ENST00000444916 UACAQ9BZF9 1416 aa23.56■■□□□ 1.36
SH3BP4-205ENST00000444916 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
SH3BP4-205ENST00000444916 ADGRL1O94910 1474 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BP4-205ENST00000444916 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
SH3BP4-205ENST00000444916 SAMD9Q5K651 1589 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3BP4-205ENST00000444916 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3BP4-205ENST00000444916 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3BP4-205ENST00000444916 ABCA8O94911 1581 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP4-205ENST00000444916 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
SH3BP4-205ENST00000444916 P3H3Q8IVL6 736 aa23.37■■□□□ 1.33
SH3BP4-205ENST00000444916 TEX14Q8IWB6 1497 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP4-205ENST00000444916 HECW2Q9P2P5 1572 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP4-205ENST00000444916 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.33■■□□□ 1.33
SH3BP4-205ENST00000444916 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
SH3BP4-205ENST00000444916 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
SH3BP4-205ENST00000444916 WDR7Q9Y4E6 1490 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP4-205ENST00000444916 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP4-205ENST00000444916 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP4-205ENST00000444916 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa23.27■■□□□ 1.32
SH3BP4-205ENST00000444916 KCNH8Q96L42 1107 aa23.24■■□□□ 1.31
SH3BP4-205ENST00000444916 CD109Q6YHK3 1445 aa23.22■■□□□ 1.31
SH3BP4-205ENST00000444916 ATP10BO94823 1461 aa23.2■■□□□ 1.3
SH3BP4-205ENST00000444916 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BP4-205ENST00000444916 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.17■■□□□ 1.3
SH3BP4-205ENST00000444916 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
SH3BP4-205ENST00000444916 ARID3CA6NKF2 412 aa23.16■■□□□ 1.3
SH3BP4-205ENST00000444916 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.16■■□□□ 1.3
SH3BP4-205ENST00000444916 FMN1Q68DA7 1419 aa23.09■■□□□ 1.29
SH3BP4-205ENST00000444916 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
SH3BP4-205ENST00000444916 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
SH3BP4-205ENST00000444916 ARAP3Q8WWN8 1544 aa23.03■■□□□ 1.28
SH3BP4-205ENST00000444916 HECW1Q76N89 1606 aa23.03■■□□□ 1.28
SH3BP4-205ENST00000444916 ABCA9Q8IUA7 1624 aa23.02■■□□□ 1.28
SH3BP4-205ENST00000444916 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
SH3BP4-205ENST00000444916 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3BP4-205ENST00000444916 RAPGEF3O95398 923 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3BP4-205ENST00000444916 CLIP1P30622 1438 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3BP4-205ENST00000444916 PTPRMP28827 1452 aa22.95■■□□□ 1.26
SH3BP4-205ENST00000444916 ADAMTSL3P82987 1691 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3BP4-205ENST00000444916 FBXO41Q8TF61 875 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3BP4-205ENST00000444916 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
SH3BP4-205ENST00000444916 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
SH3BP4-205ENST00000444916 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.91■■□□□ 1.26
SH3BP4-205ENST00000444916 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.89■■□□□ 1.25
SH3BP4-205ENST00000444916 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa22.88■■□□□ 1.25
SH3BP4-205ENST00000444916 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.87■■□□□ 1.25
SH3BP4-205ENST00000444916 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.87■■□□□ 1.25
SH3BP4-205ENST00000444916 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.85■■□□□ 1.25
SH3BP4-205ENST00000444916 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.85■■□□□ 1.25
SH3BP4-205ENST00000444916 MADDQ8WXG6 1647 aa22.84■■□□□ 1.25
SH3BP4-205ENST00000444916 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
SH3BP4-205ENST00000444916 BCORL1Q5H9F3 1711 aa22.84■■□□□ 1.25
SH3BP4-205ENST00000444916 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.84■■□□□ 1.25
SH3BP4-205ENST00000444916 NEO1Q92859 1461 aa22.84■■□□□ 1.25
SH3BP4-205ENST00000444916 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
SH3BP4-205ENST00000444916 CEP162Q5TB80 1403 aa22.82■■□□□ 1.24
SH3BP4-205ENST00000444916 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
SH3BP4-205ENST00000444916 LMTK3Q96Q04 1460 aa22.79■■□□□ 1.24
SH3BP4-205ENST00000444916 KIF14Q15058 1648 aa22.79■■□□□ 1.24
SH3BP4-205ENST00000444916 CFAP74Q9C0B2 1584 aa22.78■■□□□ 1.24
SH3BP4-205ENST00000444916 FANCAO15360 1455 aa22.76■■□□□ 1.23
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