RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440727.1

DCTN1-212, Transcript of dynactin subunit 1, humanhuman

TSL 4

Gene DCTN1, Length 521 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN1-212ENST00000440727 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa42.02■■■■■ 4.32
DCTN1-212ENST00000440727 PRXQ9BXM0 1461 aa42.01■■■■■ 4.32
DCTN1-212ENST00000440727 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.99■■■■■ 4.31
DCTN1-212ENST00000440727 JPH4Q96JJ6 628 aa41.92■■■■■ 4.3
DCTN1-212ENST00000440727 ARAP1Q96P48 1450 aa41.91■■■■■ 4.3
DCTN1-212ENST00000440727 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.81■■■■■ 4.28
DCTN1-212ENST00000440727 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.81■■■■■ 4.28
DCTN1-212ENST00000440727 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.8■■■■■ 4.28
DCTN1-212ENST00000440727 IQGAP2Q13576 1575 aa41.79■■■■■ 4.28
DCTN1-212ENST00000440727 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.76■■■■■ 4.28
DCTN1-212ENST00000440727 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.69■■■■■ 4.26
DCTN1-212ENST00000440727 KIF21BO75037 1637 aa41.65■■■■■ 4.26
DCTN1-212ENST00000440727 UGGT2Q9NYU1 1516 aa41.59■■■■■ 4.25
DCTN1-212ENST00000440727 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa41.56■■■■■ 4.24
DCTN1-212ENST00000440727 DISP1Q96F81 1524 aa41.48■■■■■ 4.23
DCTN1-212ENST00000440727 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.4■■■■■ 4.22
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DCTN1-212ENST00000440727 GOLGA3Q08378 1498 aa41.38■■■■■ 4.21
DCTN1-212ENST00000440727 PTPRGP23470 1445 aa41.35■■■■■ 4.21
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DCTN1-212ENST00000440727 ADCY10Q96PN6 1610 aa41.16■■■■■ 4.18
DCTN1-212ENST00000440727 EHMT2Q96KQ7 1210 aa41.13■■■■■ 4.17
DCTN1-212ENST00000440727 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP41.13■■■■■ 4.17
DCTN1-212ENST00000440727 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa41.09■■■■■ 4.17
DCTN1-212ENST00000440727 UACAQ9BZF9 1416 aa41.09■■■■■ 4.17
DCTN1-212ENST00000440727 EFCAB5A4FU69 1503 aa41.05■■■■■ 4.16
DCTN1-212ENST00000440727 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP41.03■■■■■ 4.16
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DCTN1-212ENST00000440727 P3H3Q8IVL6 736 aa40.99■■■■■ 4.15
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DCTN1-212ENST00000440727 PLB1Q6P1J6 1458 aa40.92■■■■■ 4.14
DCTN1-212ENST00000440727 FHOD3Q2V2M9 1422 aa40.88■■■■■ 4.13
DCTN1-212ENST00000440727 KDM5BQ9UGL1 1544 aa40.88■■■■■ 4.13
DCTN1-212ENST00000440727 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.86■■■■■ 4.13
DCTN1-212ENST00000440727 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.83■■■■■ 4.13
DCTN1-212ENST00000440727 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP40.75■■■■■ 4.11
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DCTN1-212ENST00000440727 ABCC10Q5T3U5 1492 aa40.7■■■■■ 4.11
DCTN1-212ENST00000440727 ASXL2Q76L83 1435 aa40.67■■■■■ 4.1
DCTN1-212ENST00000440727 FMN1Q68DA7 1419 aa40.67■■■■■ 4.1
DCTN1-212ENST00000440727 KIF13AQ9H1H9 1805 aa40.63■■■■■ 4.09
DCTN1-212ENST00000440727 CLIP1P30622 1438 aa40.62■■■■■ 4.09
DCTN1-212ENST00000440727 DIP2BQ9P265 1576 aa40.61■■■■■ 4.09
DCTN1-212ENST00000440727 ATP10BO94823 1461 aa40.58■■■■■ 4.09
DCTN1-212ENST00000440727 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP40.58■■■■■ 4.09
DCTN1-212ENST00000440727 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa40.55■■■■■ 4.08
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DCTN1-212ENST00000440727 WDR7Q9Y4E6 1490 aa40.51■■■■■ 4.08
DCTN1-212ENST00000440727 GLI2P10070 1586 aa40.48■■■■■ 4.07
DCTN1-212ENST00000440727 CEP162Q5TB80 1403 aa40.47■■■■■ 4.07
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DCTN1-212ENST00000440727 HECW1Q76N89 1606 aa40.44■■■■■ 4.06
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DCTN1-212ENST00000440727 FYCO1Q9BQS8 1478 aa40.26■■■■■ 4.04
DCTN1-212ENST00000440727 PLEKHD1A6NEE1 506 aa40.25■■■■■ 4.03
DCTN1-212ENST00000440727 KCNH8Q96L42 1107 aa40.25■■■■■ 4.03
DCTN1-212ENST00000440727 CFAP43Q8NDM7 1665 aa40.2■■■■■ 4.03
DCTN1-212ENST00000440727 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa40.19■■■■■ 4.02
DCTN1-212ENST00000440727 CCDC18Q5T9S5 1454 aa40.19■■■■■ 4.02
DCTN1-212ENST00000440727 TSPOAP1O95153 1857 aa40.17■■■■■ 4.02
DCTN1-212ENST00000440727 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP40.15■■■■■ 4.02
DCTN1-212ENST00000440727 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP40.15■■■■■ 4.02
DCTN1-212ENST00000440727 ABCA9Q8IUA7 1624 aa40.13■■■■■ 4.02
DCTN1-212ENST00000440727 CD109Q6YHK3 1445 aa40.11■■■■■ 4.01
DCTN1-212ENST00000440727 TEX14Q8IWB6 1497 aa40.08■■■■■ 4.01
DCTN1-212ENST00000440727 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa40.07■■■■■ 4.01
DCTN1-212ENST00000440727 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP40.01■■■■■ 4
DCTN1-212ENST00000440727 VPS8Q8N3P4 1428 aa40■■■■□ 3.99
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DCTN1-212ENST00000440727 KDM6BO15054 1643 aa39.91■■■■□ 3.98
DCTN1-212ENST00000440727 KIF14Q15058 1648 aa39.91■■■■□ 3.98
DCTN1-212ENST00000440727 TTC37Q6PGP7 1564 aa39.89■■■■□ 3.98
DCTN1-212ENST00000440727 PHLDB1Q86UU1 1377 aa39.83■■■■□ 3.97
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DCTN1-212ENST00000440727 PLCH2O75038 1416 aa39.77■■■■□ 3.96
DCTN1-212ENST00000440727 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP39.75■■■■□ 3.95
DCTN1-212ENST00000440727 ARAP3Q8WWN8 1544 aa39.75■■■■□ 3.95
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DCTN1-212ENST00000440727 TIAM1Q13009 1591 aa39.73■■■■□ 3.95
DCTN1-212ENST00000440727 MYO5CQ9NQX4 1742 aa39.73■■■■□ 3.95
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DCTN1-212ENST00000440727 AKNAQ7Z591 1439 aa39.63■■■■□ 3.93
DCTN1-212ENST00000440727 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa39.59■■■■□ 3.93
DCTN1-212ENST00000440727 PREX2Q70Z35 1606 aa39.58■■■■□ 3.93
DCTN1-212ENST00000440727 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa39.56■■■■□ 3.92
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DCTN1-212ENST00000440727 ARHGAP5Q13017 1502 aa39.55■■■■□ 3.92
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