RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440727.1

DCTN1-212, Transcript of dynactin subunit 1, humanhuman

TSL 4

Gene DCTN1, Length 521 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN1-212ENST00000440727 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.77■■■■■ 7.32
DCTN1-212ENST00000440727 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.99■■■■■ 6.23
DCTN1-212ENST00000440727 ABCC9O60706 1549 aa52.52■■■■■ 6
DCTN1-212ENST00000440727 NACADO15069 1562 aa50.72■■■■■ 5.71
DCTN1-212ENST00000440727 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.7■■■■■ 5.71
DCTN1-212ENST00000440727 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.66■■■■■ 5.7
DCTN1-212ENST00000440727 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.56■■■■■ 5.68
DCTN1-212ENST00000440727 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.53■■■■■ 5.68
DCTN1-212ENST00000440727 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.36■■■■■ 5.65
DCTN1-212ENST00000440727 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.5■■■■■ 5.51
DCTN1-212ENST00000440727 SCRIBQ14160 1630 aa49.16■■■■■ 5.46
DCTN1-212ENST00000440727 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.14■■■■■ 5.46
DCTN1-212ENST00000440727 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.08■■■■■ 5.45
DCTN1-212ENST00000440727 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.75■■■■■ 5.4
DCTN1-212ENST00000440727 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.03■■■■■ 5.28
DCTN1-212ENST00000440727 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.83■■■■■ 5.25
DCTN1-212ENST00000440727 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.56■■■■■ 5.2
DCTN1-212ENST00000440727 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.27■■■■■ 5.16
DCTN1-212ENST00000440727 SMARCA4P51532 1647 aa47.11■■■■■ 5.13
DCTN1-212ENST00000440727 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.1■■■■■ 5.13
DCTN1-212ENST00000440727 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.8■■■■■ 5.08
DCTN1-212ENST00000440727 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.79■■■■■ 5.08
DCTN1-212ENST00000440727 NCAPD3P42695 1498 aa46.79■■■■■ 5.08
DCTN1-212ENST00000440727 SMARCA2P51531 1590 aa46.78■■■■■ 5.08
DCTN1-212ENST00000440727 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.7■■■■■ 5.07
DCTN1-212ENST00000440727 HMGXB3Q12766 1538 aa46.58■■■■■ 5.05
DCTN1-212ENST00000440727 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.41■■■■■ 5.02
DCTN1-212ENST00000440727 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.34■■■■■ 5.01
DCTN1-212ENST00000440727 WIZO95785 1651 aa46.29■■■■■ 5
DCTN1-212ENST00000440727 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.86■■■■■ 4.93
DCTN1-212ENST00000440727 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.52■■■■■ 4.88
DCTN1-212ENST00000440727 NESP48681 1621 aa45.51■■■■■ 4.88
DCTN1-212ENST00000440727 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.41■■■■■ 4.86
DCTN1-212ENST00000440727 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.29■■■■■ 4.84
DCTN1-212ENST00000440727 ERCC6Q03468 1493 aa45.28■■■■■ 4.84
DCTN1-212ENST00000440727 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.2■■■■■ 4.83
DCTN1-212ENST00000440727 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.19■■■■■ 4.83
DCTN1-212ENST00000440727 CFTRP13569 1480 aa45.19■■■■■ 4.82
DCTN1-212ENST00000440727 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.99■■■■■ 4.79
DCTN1-212ENST00000440727 PRDM2Q13029 1718 aa44.86■■■■■ 4.77
DCTN1-212ENST00000440727 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.85■■■■■ 4.77
DCTN1-212ENST00000440727 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.84■■■■■ 4.77
DCTN1-212ENST00000440727 CUX2O14529 1486 aa44.82■■■■■ 4.77
DCTN1-212ENST00000440727 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.79■■■■■ 4.76
DCTN1-212ENST00000440727 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.7■■■■■ 4.75
DCTN1-212ENST00000440727 WDR62O43379 1518 aa44.57■■■■■ 4.73
DCTN1-212ENST00000440727 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.39■■■■■ 4.7
DCTN1-212ENST00000440727 ABCC8Q09428 1581 aa44.25■■■■■ 4.67
DCTN1-212ENST00000440727 TOPBP1Q92547 1522 aa44.17■■■■■ 4.66
DCTN1-212ENST00000440727 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.15■■■■■ 4.66
DCTN1-212ENST00000440727 CUX1P39880 1505 aa43.89■■■■■ 4.62
DCTN1-212ENST00000440727 IFT140Q96RY7 1462 aa43.87■■■■■ 4.61
DCTN1-212ENST00000440727 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.81■■■■■ 4.6
DCTN1-212ENST00000440727 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.71■■■■■ 4.59
DCTN1-212ENST00000440727 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.7■■■■■ 4.59
DCTN1-212ENST00000440727 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.69■■■■■ 4.58
DCTN1-212ENST00000440727 SOGA1O94964 1423 aa43.63■■■■■ 4.57
DCTN1-212ENST00000440727 TOP2BQ02880 1626 aa43.6■■■■■ 4.57
DCTN1-212ENST00000440727 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.6■■■■■ 4.57
DCTN1-212ENST00000440727 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.58■■■■■ 4.57
DCTN1-212ENST00000440727 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.57■■■■■ 4.57
DCTN1-212ENST00000440727 SYNJ1O43426 1573 aa43.55■■■■■ 4.56
DCTN1-212ENST00000440727 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.46■■■■■ 4.55
DCTN1-212ENST00000440727 WDR97A6NE52 1622 aa43.44■■■■■ 4.54
DCTN1-212ENST00000440727 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.38■■■■■ 4.53
DCTN1-212ENST00000440727 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.34■■■■■ 4.53
DCTN1-212ENST00000440727 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.32■■■■■ 4.53
DCTN1-212ENST00000440727 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.18■■■■■ 4.5
DCTN1-212ENST00000440727 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.15■■■■■ 4.5
DCTN1-212ENST00000440727 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.13■■■■■ 4.5
DCTN1-212ENST00000440727 GRIN2BQ13224 1484 aa43.12■■■■■ 4.49
DCTN1-212ENST00000440727 PBRM1Q86U86 1689 aa43.02■■■■■ 4.48
DCTN1-212ENST00000440727 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43■■■■■ 4.47
DCTN1-212ENST00000440727 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.99■■■■■ 4.47
DCTN1-212ENST00000440727 OSCARQ8IYS5 282 aa42.95■■■■■ 4.47
DCTN1-212ENST00000440727 CHD1O14646 1710 aa42.85■■■■■ 4.45
DCTN1-212ENST00000440727 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.84■■■■■ 4.45
DCTN1-212ENST00000440727 SYNJ2O15056 1496 aa42.82■■■■■ 4.45
DCTN1-212ENST00000440727 KIF27Q86VH2 1401 aa42.78■■■■■ 4.44
DCTN1-212ENST00000440727 FBLN2P98095 1184 aa42.77■■■■■ 4.44
DCTN1-212ENST00000440727 TRIM41Q8WV44 630 aa42.75■■■■■ 4.43
DCTN1-212ENST00000440727 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.74■■■■■ 4.43
DCTN1-212ENST00000440727 ADAMTS12P58397 1594 aa42.7■■■■■ 4.43
DCTN1-212ENST00000440727 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.66■■■■■ 4.42
DCTN1-212ENST00000440727 IGF1RP08069 1367 aa42.58■■■■■ 4.41
DCTN1-212ENST00000440727 GRIN2AQ12879 1464 aa42.55■■■■■ 4.4
DCTN1-212ENST00000440727 CUL7Q14999 1698 aa42.48■■■■■ 4.39
DCTN1-212ENST00000440727 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.45■■■■■ 4.39
DCTN1-212ENST00000440727 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.38■■■■■ 4.37
DCTN1-212ENST00000440727 NUP160Q12769 1436 aa42.37■■■■■ 4.37
DCTN1-212ENST00000440727 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.35■■■■■ 4.37
DCTN1-212ENST00000440727 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.32■■■■■ 4.37
DCTN1-212ENST00000440727 CEP170Q5SW79 1584 aa42.31■■■■■ 4.36
DCTN1-212ENST00000440727 ARHGEF11O15085 1522 aa42.25■■■■■ 4.35
DCTN1-212ENST00000440727 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.22■■■■■ 4.35
DCTN1-212ENST00000440727 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.22■■■■■ 4.35
DCTN1-212ENST00000440727 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.22■■■■■ 4.35
DCTN1-212ENST00000440727 EEA1Q15075 1411 aa42.12■■■■■ 4.33
DCTN1-212ENST00000440727 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.11■■■■■ 4.33
DCTN1-212ENST00000440727 SHROOM2Q13796 1616 aa42.05■■■■■ 4.32
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