RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429374.5

HDAC10-204, Transcript of histone deacetylase 10, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HDAC10, Length 1,634 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC10-204ENST00000429374 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
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HDAC10-204ENST00000429374 MAP3K1Q13233 1512 aa29.28■■■□□ 2.28
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HDAC10-204ENST00000429374 SYNJ2O15056 1496 aa29.15■■■□□ 2.26
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HDAC10-204ENST00000429374 FHOD3Q2V2M9 1422 aa29.11■■■□□ 2.25
HDAC10-204ENST00000429374 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa29.11■■■□□ 2.25
HDAC10-204ENST00000429374 UGGT2Q9NYU1 1516 aa29.09■■■□□ 2.25
HDAC10-204ENST00000429374 TIAM1Q13009 1591 aa29.09■■■□□ 2.25
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HDAC10-204ENST00000429374 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
HDAC10-204ENST00000429374 NUP160Q12769 1436 aa28.97■■■□□ 2.23
HDAC10-204ENST00000429374 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa28.95■■■□□ 2.23
HDAC10-204ENST00000429374 CEP170Q5SW79 1584 aa28.93■■■□□ 2.22
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HDAC10-204ENST00000429374 DISP1Q96F81 1524 aa28.86■■■□□ 2.21
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HDAC10-204ENST00000429374 FBLN2P98095 1184 aa28.79■■■□□ 2.2
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HDAC10-204ENST00000429374 JPH4Q96JJ6 628 aa28.72■■■□□ 2.19
HDAC10-204ENST00000429374 CHD1O14646 1710 aa28.71■■■□□ 2.19
HDAC10-204ENST00000429374 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa28.67■■■□□ 2.18
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HDAC10-204ENST00000429374 PHLDB1Q86UU1 1377 aa28.64■■■□□ 2.17
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HDAC10-204ENST00000429374 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa28.63■■■□□ 2.17
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HDAC10-204ENST00000429374 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP28.45■■■□□ 2.14
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HDAC10-204ENST00000429374 MIA2Q96PC5 1412 aa28.36■■■□□ 2.13
HDAC10-204ENST00000429374 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
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HDAC10-204ENST00000429374 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
HDAC10-204ENST00000429374 PTPN23Q9H3S7 1636 aa28.31■■■□□ 2.12
HDAC10-204ENST00000429374 ADCY10Q96PN6 1610 aa28.31■■■□□ 2.12
HDAC10-204ENST00000429374 SETD5Q9C0A6 1442 aa28.26■■■□□ 2.12
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HDAC10-204ENST00000429374 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa28.18■■■□□ 2.1
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HDAC10-204ENST00000429374 ABCC2Q92887 1545 aa28.15■■■□□ 2.1
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HDAC10-204ENST00000429374 NAIPQ13075 1403 aa28■■■□□ 2.07
HDAC10-204ENST00000429374 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
HDAC10-204ENST00000429374 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa28■■■□□ 2.07
HDAC10-204ENST00000429374 GCC2Q8IWJ2 1684 aa27.99■■■□□ 2.07
HDAC10-204ENST00000429374 KDM5BQ9UGL1 1544 aa27.98■■■□□ 2.07
HDAC10-204ENST00000429374 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
HDAC10-204ENST00000429374 ROCK1Q13464 1354 aa27.97■■■□□ 2.07
HDAC10-204ENST00000429374 DAPK1P53355 1430 aa27.97■■■□□ 2.07
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